Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 80,487 | G→A | 8.5% | C126C (TGC→TGT) | leuC ← | 3‑isopropylmalate isomerase subunit, dehydratase component |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 80,487 | 0 | G→A | 8.5% | 39.4 ‑4.3 ‑0.1 | 211 | C126C (TGC→TGT) | leuC | 3‑isopropylmalate isomerase subunit, dehydratase component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (14/4): ref base (90/103): total (104/107) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.35e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.29e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
GTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAA > NC_007779/80387‑80587 | gTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTcgccg < 1:6245285/101‑1 (MQ=255) ttCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCa < 1:6837385/101‑1 (MQ=255) gcAGGGTCTGGGTAGCCAGAACGTGCTCAACTTCGGAAGTACCGATACCAAAGGCCATCGCGCCGAAAGCACCGTGCGTTGCAGTGTGGGAGTCACCACAg < 1:931052/100‑1 (MQ=255) cAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGa > 1:1129308/1‑101 (MQ=255) aGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGAc < 1:4385480/101‑1 (MQ=255) gggTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACa > 1:13452903/1‑101 (MQ=255) gggTCTGGGTAGCCAGAACGTGCTCAACTTCGGAAGTACCGATACCAAAGGCCATCGCGCCGAAAGCACCGTGCGTTGCAGTGTGGGAGTCACCACAGACa > 1:14036633/1‑101 (MQ=255) ggTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACaa < 1:8191948/101‑1 (MQ=255) ggTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACaa < 1:694033/101‑1 (MQ=255) gtctgggtagCCAGAACGTGCTCAACTTCGGAAGTACCGATACCAAAGGCCATCGCGCCGAAAGCACCGTGCGTTGCAGTGTGGGAGTCACCACAGACaac > 1:9425320/10‑100 (MQ=255) gTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAAt < 1:2564309/101‑1 (MQ=255) tttGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATg > 1:4050627/1‑101 (MQ=255) ttGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATgg > 1:8068234/1‑101 (MQ=255) ttGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATgg < 1:6173862/101‑1 (MQ=255) tGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGt > 1:13140031/1‑101 (MQ=255) gTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCAt > 1:1161803/1‑101 (MQ=255) ttGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATc > 1:3450820/1‑101 (MQ=255) tGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATcc > 1:4488166/1‑101 (MQ=255) tGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATcc > 1:10654976/1‑101 (MQ=255) cAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATACCCg < 1:8287203/101‑1 (MQ=255) aGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCgg < 1:10905148/101‑1 (MQ=255) gaaCGTGCTCAACTTCGGAAGTACCGATACCAAAGGCCATCGCGCCGAAAGCACCGTGCGTTGCAGTGTGGGAGTCACCACAGACAACGGTGGTGCCCggt > 1:4830807/3‑100 (MQ=255) aCGTGCTCAACTTCGGAAGTACCGATACCAAAGGCCATCGCGCCGAAAGCACCGTGCGTTGCAGTGTGGGAGTCACCACAGACAACGGTGGTGCCCggttg > 1:12666189/1‑98 (MQ=255) gtgtTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAgg < 1:14319115/101‑1 (MQ=255) tgtTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGt < 1:8914567/101‑1 (MQ=255) gtTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTg > 1:7547849/1‑101 (MQ=255) cAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACg < 1:12325634/101‑1 (MQ=255) cAACTTCGGAAGTACCGATACCAAAGGCCATCGCGCCGAAAGCACCGTGCGTTGCAGTGTGGGAGTCACCACAGACAACGGTGGTGCCCggttgagtcagg > 1:8549682/1‑91 (MQ=255) aCTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGcc < 1:3979920/101‑1 (MQ=255) cTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGccc > 1:8003848/1‑101 (MQ=255) ttCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCt < 1:7389472/101‑1 (MQ=255) cGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGt > 1:1522550/1‑101 (MQ=255) aaGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTcc > 1:13362549/1‑101 (MQ=255) aaGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTcc > 1:4882328/1‑101 (MQ=255) aGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCg < 1:9898150/101‑1 (MQ=255) aGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCg > 1:980739/1‑101 (MQ=255) gCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGcc > 1:4504119/1‑101 (MQ=255) gCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGcc > 1:2157163/1‑101 (MQ=255) ccGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGccc < 1:6718306/101‑1 (MQ=255) gATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCa > 1:12122673/1‑101 (MQ=255) tACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCAtt > 1:2975491/1‑101 (MQ=255) aCCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTa > 1:13270846/1‑101 (MQ=255) ccAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTAc < 1:8403506/101‑1 (MQ=255) ccAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTAc > 1:6108890/1‑101 (MQ=255) agaGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGt < 1:11803823/99‑1 (MQ=255) aaaGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGt > 1:11485054/1‑101 (MQ=255) aaaGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGt > 1:12750913/1‑101 (MQ=255) aaaGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGt > 1:5799661/1‑101 (MQ=255) ggCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGa > 1:4054161/1‑101 (MQ=255) ccAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACg < 1:10178060/101‑1 (MQ=255) ccAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCAGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACg < 1:11390923/101‑1 (MQ=255) aGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGAt > 1:4678762/1‑101 (MQ=255) aGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGAt > 1:4451901/1‑101 (MQ=255) gTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATc < 1:13686629/101‑1 (MQ=255) tGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATcc > 1:13741981/1‑101 (MQ=255) gcgcCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATccc < 1:2011419/101‑1 (MQ=255) gcCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCGCCt > 1:10122812/1‑101 (MQ=255) gcCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCt < 1:5254645/101‑1 (MQ=255) ccAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTg < 1:647117/101‑1 (MQ=255) ccAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTg > 1:8665460/1‑101 (MQ=255) aaaCGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGAt < 1:709701/101‑1 (MQ=255) aaaCGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGAt > 1:9252043/1‑101 (MQ=255) aaaCGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGAt > 1:10016637/1‑101 (MQ=255) aaCGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATa < 1:12585626/101‑1 (MQ=255) aCGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATAc < 1:5224586/101‑1 (MQ=255) aCGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATAc < 1:8165365/101‑1 (MQ=255) gcgcCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGATGATCCCCTGATACgg > 1:2337534/1‑101 (MQ=255) gcgcCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCAGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACgg < 1:5548646/101‑1 (MQ=255) cgcCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACggg > 1:12653826/1‑101 (MQ=255) cgcCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACggg < 1:881529/101‑1 (MQ=255) ccGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTg < 1:7713284/101‑1 (MQ=255) cGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGa < 1:5089024/101‑1 (MQ=255) cGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGa > 1:261140/1‑101 (MQ=255) gtgggtggCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGAt > 1:1764794/1‑101 (MQ=255) gtgggtggCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGAt > 1:1495582/1‑101 (MQ=255) gtgggtggCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGAt > 1:14111164/1‑101 (MQ=255) tgggtggCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGAtt > 1:11070299/1‑101 (MQ=255) ggtggCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCa > 1:10502452/1‑101 (MQ=255) gtggCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAg < 1:10354318/101‑1 (MQ=255) tggCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAgg < 1:11928727/101‑1 (MQ=255) gCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTc < 1:6278555/101‑1 (MQ=255) cGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCa < 1:8983166/101‑1 (MQ=255) ggTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCAt < 1:12415259/101‑1 (MQ=255) ggTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCAt > 1:5943624/1‑101 (MQ=255) gTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATa > 1:13374928/1‑101 (MQ=255) tGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAg > 1:9664219/1‑101 (MQ=255) tGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAg < 1:13647880/101‑1 (MQ=255) cGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGtt > 1:7797382/1‑101 (MQ=255) cGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGtt < 1:6644762/101‑1 (MQ=255) cGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGtt > 1:3038890/1‑101 (MQ=255) gAGTCGCCGCAGCCAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTc < 1:3953227/101‑1 (MQ=255) gTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGa < 1:10955676/101‑1 (MQ=255) tCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGAc < 1:11126646/101‑1 (MQ=255) ccgcAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGcc > 1:13957050/1‑101 (MQ=255) ccgcAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGcc < 1:1560616/101‑1 (MQ=255) ccgcAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGcc < 1:2083453/101‑1 (MQ=255) ccgcAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGcc < 1:5150461/101‑1 (MQ=255) cgcAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCa > 1:13024152/1‑101 (MQ=255) cgcAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCa > 1:13824753/1‑101 (MQ=255) cgcAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCa > 1:9127433/1‑101 (MQ=255) | GTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAA > NC_007779/80387‑80587 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |