| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,270,275 | T→C | 4.5% | intergenic (+818/+205) | yhaC → / ← garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,270,275 | 0 | T→C | 4.5% | 19.1 ‑2.1 ‑0.6 | 242 | intergenic (+818/+205) | yhaC/garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/9): ref base (102/129): total (104/138) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.21e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.54e-01 | ||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCC > NC_007779/3270175‑3270375 | tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCtt > 1:7747056/1‑101 (MQ=255)tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCtt > 1:535554/1‑101 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTa < 1:10553175/101‑1 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTa > 1:10954970/1‑101 (MQ=255) ttATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCt < 1:11114090/101‑1 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGa < 1:6300436/101‑1 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGa < 1:10965478/101‑1 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCGTACCGCCCCCTTTC‑ACCCTTACCTGa < 1:6626603/101‑1 (MQ=255) tGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGAt < 1:8437874/101‑1 (MQ=255) tGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGAt > 1:12451649/1‑101 (MQ=255) tGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGAt < 1:7173996/101‑1 (MQ=255) atgcgcgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTC‑ACCCTCACCGGATct > 1:2199790/8‑100 (MQ=255) aCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATccc < 1:10908351/101‑1 (MQ=255) aCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATccc > 1:315660/1‑101 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCg > 1:1119374/1‑101 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCg < 1:8724397/101‑1 (MQ=255) cgcgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCGCCTTTTC‑ACCCTCACCGGATctcca < 1:7669937/97‑5 (MQ=255) cccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACAGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGGGGGCTCTTACCGCACCCCTTC‑ACCCCTACCtcactccgc > 1:7236440/1‑93 (MQ=255) cccTATTTGGCCTTGCTCAGGGTGGAGTTAACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGGGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCgt > 1:6175736/1‑100 (MQ=255) cTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCtt < 1:13023374/101‑1 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTg < 1:13865166/101‑1 (MQ=255) aTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTC‑ACCCTCACCGGATctccacagc < 1:9572298/101‑9 (MQ=255) aTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTC‑ACCCTCACCGGATctccacagc < 1:12880096/101‑9 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTgc < 1:11228301/101‑1 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTgc > 1:10848921/1‑101 (MQ=255) tttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTgcg < 1:1698674/101‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg < 1:5685169/101‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg < 1:514296/101‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg < 1:1673424/101‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCgg > 1:2950687/1‑101 (MQ=255) ccTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGGGGGCGCTTTCCCCCCCCCTTCTCCCCTTCCCTATTCCCCCTT‑CGCGGGc > 1:2646525/1‑101 (MQ=255) tGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCAt > 1:4007610/1‑101 (MQ=255) tGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCAt > 1:5604576/1‑101 (MQ=255) gCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATc < 1:12924408/101‑1 (MQ=255) gCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATc > 1:4403298/1‑101 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg > 1:159823/1‑101 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg > 1:3376201/1‑101 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg < 1:9761077/101‑1 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg < 1:11080717/101‑1 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg < 1:706024/101‑1 (MQ=255) ccGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggc < 1:5030268/101‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcg < 1:12683504/101‑1 (MQ=255) gggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcgg < 1:3662232/101‑1 (MQ=255) ggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGt > 1:492555/1‑101 (MQ=255) gTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGtt < 1:7253237/101‑1 (MQ=255) tGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGttt < 1:10765239/101‑1 (MQ=255) ttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctc > 1:11261642/1‑101 (MQ=255) ttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGGTTGctctc > 1:3044933/1‑101 (MQ=255) tACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctct > 1:3628408/1‑101 (MQ=255) cGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGtt > 1:6594678/1‑101 (MQ=255) cGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGtt > 1:1923751/1‑101 (MQ=255) cGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGtt < 1:1506122/101‑1 (MQ=255) cGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGtt > 1:796294/1‑101 (MQ=255) gTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTg < 1:4160134/101‑1 (MQ=255) ccACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAc < 1:3800552/101‑1 (MQ=255) aCGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTCACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTg > 1:9141443/1‑101 (MQ=255) cGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCTCCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTgg < 1:2610420/101‑1 (MQ=255) cGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTgg > 1:8279135/1‑101 (MQ=255) cGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTgg < 1:8245556/101‑1 (MQ=255) gACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTc < 1:13529782/101‑1 (MQ=255) aCTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCg < 1:3526392/101‑1 (MQ=255) gTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTgg < 1:2037826/101‑1 (MQ=255) ttACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTATTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTggg < 1:12233577/101‑1 (MQ=255) tACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTCGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGt < 1:10308656/101‑1 (MQ=255) ccAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGgtt > 1:7554096/1‑101 (MQ=255) cAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCACTGGTCGTGGGTTTc > 1:133614/1‑101 (MQ=255) cAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTc < 1:238765/101‑1 (MQ=255) gCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTccc > 1:5223407/1‑101 (MQ=255) ccGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTcccc < 1:14227659/101‑1 (MQ=255) ccGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTcccc < 1:10235844/101‑1 (MQ=255) ccGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTcccc > 1:13180408/1‑101 (MQ=255) gcgc‑gGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTcccccc > 1:12790650/1‑101 (MQ=255) cgc‑gGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTccccccc > 1:3736820/1‑101 (MQ=255) gc‑gGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCa < 1:11526101/101‑1 (MQ=255) c‑gGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGGACCCGGCGTTGGTTTTCCCCCCAg > 1:3204515/1‑101 (MQ=255) c‑gGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAg < 1:5325124/101‑1 (MQ=255) ggTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAgg < 1:8143307/101‑1 (MQ=255) gTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGc > 1:13081128/1‑101 (MQ=255) gcTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTa < 1:1871441/101‑1 (MQ=255) gatctTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTa < 1:14319511/99‑1 (MQ=255) tctTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTAcc < 1:6357337/101‑1 (MQ=255) ctTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCt < 1:1726826/101‑1 (MQ=255) ctTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCt < 1:5406816/101‑1 (MQ=255) aCCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGc > 1:10568040/1‑101 (MQ=255) ccGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCa < 1:13656118/101‑1 (MQ=255) cGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCAc > 1:10293359/1‑101 (MQ=255) gCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCAcc > 1:8928120/1‑101 (MQ=255) cACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCAccc > 1:12531578/1‑101 (MQ=255) cACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCAccc > 1:13902556/1‑101 (MQ=255) cccTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTg > 1:13432955/1‑101 (MQ=255) cccTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTg < 1:8743800/101‑1 (MQ=255) cTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTTCCCCCCCGGCGTTACCTCGCACCCTGcc > 1:11948460/1‑101 (MQ=255) cTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGcc > 1:9374633/1‑101 (MQ=255) cccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATgg > 1:12753942/1‑101 (MQ=255) ccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGa < 1:3575632/101‑1 (MQ=255) ccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGa > 1:6028299/1‑101 (MQ=255) ttACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGc < 1:2801815/101‑1 (MQ=255) tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGcc > 1:6834419/1‑101 (MQ=255) tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGcc < 1:11646176/101‑1 (MQ=255) tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGcc < 1:10204358/101‑1 (MQ=255) | TACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTC‑ACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCC > NC_007779/3270175‑3270375 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |