| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,442,030 | G→A | 7.2% | A483A (GCG→GCA) | thiC → | thiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,442,030 | 0 | G→A | 7.2% | 34.4 ‑2.6 ‑0.0 | 236 | A483A (GCG→GCA) | thiC | thiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (12/5): ref base (100/119): total (112/124) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.51e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.35e-01 | ||||||||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
AGTTAGAGCACTGCCACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATCACCT > NC_007779/3441930‑3442130 | agTTAGAGCACTGCCACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTgcggcg < 1:4639894/101‑1 (MQ=255) gTTAGAGCACTGCCACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCga > 1:765730/1‑101 (MQ=255) gTTAGAGCACTGCCACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCga > 1:12049183/1‑101 (MQ=255) cTGCCACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCt > 1:9529545/1‑101 (MQ=255) cTGCCACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCt > 1:3550012/1‑101 (MQ=255) tGCCACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATAATGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTg > 1:9854712/1‑101 (MQ=255) ccACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGt < 1:10165461/101‑1 (MQ=255) ccACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGt > 1:14263148/1‑101 (MQ=255) aCGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGttt > 1:10302757/1‑101 (MQ=255) aCGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGttt > 1:11315659/1‑101 (MQ=255) cGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTg < 1:3771534/101‑1 (MQ=255) aaGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGc > 1:10326121/1‑101 (MQ=255) aaGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGc > 1:898013/1‑101 (MQ=255) aaGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGGTTGGc > 1:1342785/1‑101 (MQ=255) gcgcCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTg > 1:13278600/1‑101 (MQ=255) cgcCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTgc > 1:4590960/1‑101 (MQ=255) cgcCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTgc < 1:8397261/101‑1 (MQ=255) gcCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCTCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTgtg < 1:9697998/101‑3 (MQ=255) ccGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTgcgc < 1:1074944/101‑1 (MQ=255) ccGGTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTgcgc < 1:13752713/101‑1 (MQ=255) cGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGcgcg < 1:6130310/101‑1 (MQ=255) gTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGa > 1:4260994/1‑101 (MQ=255) gTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGa > 1:2744085/1‑101 (MQ=255) gTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGa > 1:9936514/1‑101 (MQ=255) tttACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATg > 1:11461908/1‑101 (MQ=255) tACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGct < 1:7868142/101‑1 (MQ=255) tctctGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGACGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTg < 1:3986764/100‑1 (MQ=255) acTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTg < 1:155764/101‑1 (MQ=255) acTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTg < 1:7791407/101‑1 (MQ=255) acTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTg > 1:12269720/1‑101 (MQ=255) tctGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGtt < 1:11640899/101‑1 (MQ=255) tGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTAc < 1:8220049/101‑1 (MQ=255) ggggCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACg < 1:7492055/101‑1 (MQ=255) gggCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGt < 1:11725172/101‑1 (MQ=255) gggCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGt > 1:2141669/1‑101 (MQ=255) ggCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGAGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTa < 1:10798622/101‑1 (MQ=255) gCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTaa < 1:6623327/101‑1 (MQ=255) gCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTaa < 1:10001353/101‑1 (MQ=255) ccGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGGTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAAc > 1:494737/1‑101 (MQ=255) cgctggcaaCCGACATCGCGCCGGGCTATGACCACATCACGTCGGCTATCGGCGCGGCAATCATTGCGCAGG‑CTGGTACCGCCATGCTCTGCTACGTCACg > 1:10686588/9‑101 (MQ=255) gCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGc < 1:9807356/101‑1 (MQ=255) gCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGc < 1:6222893/101‑1 (MQ=255) cTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGcc > 1:8058240/1‑101 (MQ=255) aaCTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCaa < 1:729092/101‑1 (MQ=255) aaCTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCaa > 1:5582066/1‑101 (MQ=255) aCTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCaaa > 1:7073202/1‑101 (MQ=255) aCTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCaaa < 1:138767/101‑1 (MQ=255) tACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAag < 1:8846038/101‑1 (MQ=255) tACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAag < 1:12808730/101‑1 (MQ=255) aCCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAaga < 1:4808717/101‑1 (MQ=255) cGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGc > 1:1355064/1‑101 (MQ=255) cGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGc > 1:5314540/1‑101 (MQ=255) gATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCa < 1:4024461/101‑1 (MQ=255) atatTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCAt > 1:10442088/1‑101 (MQ=255) tatTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATc > 1:7432193/1‑101 (MQ=255) atcgcgcCGGGCTATGACCACATCACGTCGGCTATCGGCGCGGCAATCATTGCGCAGG‑CTGGTACCGCCATGCTCTGCTACGTCACGCCGAAGGAGCACCt > 1:9199450/4‑101 (MQ=255) atTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCt > 1:7873835/1‑101 (MQ=255) gcgcCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTggg < 1:6504241/101‑1 (MQ=255) gcgcCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTggg > 1:1800744/1‑101 (MQ=255) cGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTg < 1:4764964/101‑1 (MQ=255) cGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTg < 1:3418703/101‑1 (MQ=255) gCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGccc < 1:4064635/101‑1 (MQ=255) cTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCa < 1:1514057/101‑1 (MQ=255) cTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCa < 1:5714520/101‑1 (MQ=255) cTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCa < 1:1248712/101‑1 (MQ=255) tGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATa > 1:7204423/1‑101 (MQ=255) tGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATa < 1:13091576/101‑1 (MQ=255) gACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATaa > 1:3185206/1‑101 (MQ=255) gACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATaa > 1:5016839/1‑101 (MQ=255) 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tCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGAt > 1:3076470/1‑101 (MQ=255) cACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATg > 1:2914726/1‑101 (MQ=255) gTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTa < 1:11139370/101‑1 (MQ=255) gTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTa > 1:1396800/1‑101 (MQ=255) tCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTaa > 1:6992280/1‑101 (MQ=255) cGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAg < 1:9226665/101‑1 (MQ=255) ggggATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGc > 1:6757844/1‑101 (MQ=255) 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tGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTa < 1:10940964/101‑1 (MQ=255) gcggcgATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTAt > 1:160904/1‑101 (MQ=255) cggcgATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTGAGCAGGGGCTTATc > 1:10062611/1‑101 (MQ=255) cggcgATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATc > 1:2794593/1‑101 (MQ=255) ggcgATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATCa < 1:545700/101‑1 (MQ=255) gcgATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATCAc < 1:11102188/101‑1 (MQ=255) gcgATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATCAc < 1:2493494/101‑1 (MQ=255) gcgATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATCAc > 1:11764972/1‑101 (MQ=255) cgATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATCAcc > 1:3456876/1‑101 (MQ=255) gatgatTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATCACCt > 1:5635172/1‑101 (MQ=255) | AGTTAGAGCACTGCCACGAAGCGCCGTTTTACACTCTGGGGCCGCTAACTACCGATATTGCGCCGGGCTATGACCACTTCACGTCGGGGATTGGTGCGGCGATGATTG‑GCTGGTTTGGCTGCGCGATGCTCTGTTACGTAACGCCAAAAGAGCATCTGGGTCTGCCCAATAAAGAAGATGTTAAGCAGGGGCTTATCACCT > NC_007779/3441930‑3442130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |