Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 190,413 | T→C | 6.6% | G180G (GGT→GGC) | rpsB → | 30S ribosomal protein S2 |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 190,413 | 0 | T→C | 6.6% | 42.9 ‑4.3 ‑0.8 | 274 | G180G (GGT→GGC) | rpsB | 30S ribosomal protein S2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (14/4): ref base (120/135): total (135/139) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.41e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.69e-01 |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
GCCTGGGCGGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACC > NC_007779/190313‑190513 | ccTGGGCGGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTa > 1:6098411/1‑101 (MQ=255) cTGGGCGGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTAt > 1:1160842/1‑101 (MQ=255) tGGGCGGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGTAAACAACCTGGGTAtt < 1:9585710/101‑1 (MQ=255) tGGGCGGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTAtt < 1:10849382/101‑1 (MQ=255) ggCGGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTcc < 1:95600/101‑1 (MQ=255) ggCCGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTcc < 1:4363932/101‑1 (MQ=255) gCGGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTCGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCg > 1:14046125/1‑101 (MQ=255) ggTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGt > 1:7005239/1‑101 (MQ=255) ggTATCAAAGACATGGGCGGTCCGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGt > 1:1283246/1‑101 (MQ=255) tATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTAt < 1:11534603/101‑1 (MQ=255) aTCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTAtt > 1:8527910/1‑101 (MQ=255) aaaGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGc < 1:2179479/101‑1 (MQ=255) aaGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCt < 1:3900526/101‑1 (MQ=255) gACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTAt < 1:2124112/101‑1 (MQ=255) aTGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGt < 1:13820648/101‑1 (MQ=255) aTGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGt < 1:8604867/101‑1 (MQ=255) aTGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGt > 1:12509610/1‑101 (MQ=255) gggCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTg < 1:9859908/101‑1 (MQ=255) cGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATa < 1:2936587/101‑1 (MQ=255) cGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATa < 1:7176024/101‑1 (MQ=255) cGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATa > 1:11896687/1‑101 (MQ=255) ggTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATAc > 1:8641210/1‑101 (MQ=255) gTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATAcc < 1:5944729/101‑1 (MQ=255) gTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATAcc < 1:11379181/101‑1 (MQ=255) tCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCa < 1:12060341/101‑1 (MQ=255) cTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCaa < 1:5432913/101‑1 (MQ=255) tGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAAc > 1:1987853/1‑101 (MQ=255) gCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAAct < 1:11314126/101‑1 (MQ=255) ggACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTg > 1:7409908/1‑101 (MQ=255) ggACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTg < 1:8061983/101‑1 (MQ=255) ggACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTg > 1:3353323/1‑101 (MQ=255) gACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGa < 1:3262668/101‑1 (MQ=255) cGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATc < 1:9473773/101‑1 (MQ=255) tGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGAc < 1:1163662/101‑1 (MQ=255) tGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGAc < 1:12911176/101‑1 (MQ=255) tttGTAATCGATGCTGACCACGAATACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACgg > 1:5053521/1‑101 (MQ=255) tttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACgg > 1:10947438/1‑101 (MQ=255) tttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACgg < 1:10216409/101‑1 (MQ=255) ttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgt > 1:2482458/1‑101 (MQ=255) tGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgtg > 1:5815075/1‑101 (MQ=255) tAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGtt < 1:733587/101‑1 (MQ=255) aaTCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTg < 1:6010369/101‑1 (MQ=255) tCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGAc > 1:1774360/1‑101 (MQ=255) aTGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTc < 1:6307772/101‑1 (MQ=255) tGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCg > 1:1304114/1‑101 (MQ=255) gCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGt > 1:8546320/1‑101 (MQ=255) cTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGtt > 1:11460532/1‑101 (MQ=255) cTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGtt > 1:4938565/1‑101 (MQ=255) cTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAAATCTGAACCGGACGGGGttttatttttt > 1:13891790/1‑92 (MQ=255) tGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTa < 1:7845131/101‑1 (MQ=255) tGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTa > 1:8988122/1‑101 (MQ=255) tGACCAAGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTa > 1:12376443/1‑101 (MQ=255) gACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTAt > 1:13486784/1‑101 (MQ=255) ccACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATcc < 1:12954478/101‑1 (MQ=255) cACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATccc > 1:10054265/1‑101 (MQ=255) gAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCggg < 1:4515596/101‑1 (MQ=255) aaCACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGt < 1:5608523/101‑1 (MQ=255) aaCACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGt < 1:5352089/101‑1 (MQ=255) acacATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTa < 1:1531362/101‑1 (MQ=255) cacaTTACTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTaa > 1:13724990/1‑101 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:10395569/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:11695917/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:913813/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac > 1:6695177/1‑101 (MQ=255) tGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacg < 1:3482393/101‑1 (MQ=255) tGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacg < 1:13609034/101‑1 (MQ=255) tATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgacg > 1:4408438/1‑101 (MQ=255) aTCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGc > 1:11850985/1‑101 (MQ=255) aTCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGc > 1:6321858/1‑101 (MQ=255) tCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCa > 1:14322150/1‑101 (MQ=255) cAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCaa > 1:6802386/1‑101 (MQ=255) gaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCg > 1:6862705/1‑101 (MQ=255) aagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGt > 1:13197946/1‑101 (MQ=255) agCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTg > 1:7670167/1‑101 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc > 1:3151322/1‑101 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc > 1:8334280/1‑101 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg < 1:9485299/101‑1 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg < 1:7502335/101‑1 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCGGGATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg > 1:3824554/1‑101 (MQ=255) aacaacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtgt < 1:2140994/101‑1 (MQ=255) agaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgct < 1:4699089/96‑3 (MQ=255) acaacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtgtg < 1:12633134/101‑1 (MQ=255) gaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgctt > 1:7911531/5‑98 (MQ=255) gaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgctt > 1:4115653/5‑98 (MQ=255) caacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGa > 1:14182462/1‑101 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc > 1:4626272/1‑101 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc < 1:1639320/101‑1 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCAGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc < 1:9933565/101‑1 (MQ=255) agcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttcc > 1:2692590/3‑96 (MQ=255) acCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAcc > 1:13383747/1‑101 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc < 1:9233236/101‑1 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc > 1:9355226/1‑101 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc > 1:12124428/1‑101 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc < 1:10009566/101‑1 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGGTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:10581655/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:8719163/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:1719490/1‑101 (MQ=255) cTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgt > 1:8211419/1‑94 (MQ=255) gTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAc < 1:9728444/101‑1 (MQ=255) tATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAcc > 1:10966806/1‑101 (MQ=255) | GCCTGGGCGGTATCAAAGACATGGGCGGTCTGCCGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACC > NC_007779/190313‑190513 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |