| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,449,994 | A→T | 11.2% | A446A (GCT→GCA) | rpoC ← | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,449,994 | 0 | A→T | 11.2% | 91.6 ‑2.1 ‑0.2 | 276 | A446A (GCT→GCA) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (9/22): ref base (111/134): total (120/156) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.23e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.84e-01 | ||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
CTTCCAGCTGGGCTTCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGT > NC_007779/3449894‑3450094 | cTTCCAGCTGGGCTTCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATa < 1:14239080/101‑1 (MQ=255)cTTCCAGCTGGGCTTCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATa < 1:8894050/101‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGGGCTTCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAg > 1:9645424/1‑101 (MQ=255) gCTGGGCTTCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTa > 1:7680053/1‑101 (MQ=255) gCTTCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTc < 1:12541597/101‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTc < 1:6071598/101‑1 (MQ=255) ttCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGa < 1:12138522/101‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGAt < 1:11207599/101‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGAt > 1:6171972/1‑101 (MQ=255) ccAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATc > 1:7434004/1‑101 (MQ=255) aGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAg < 1:1084275/101‑1 (MQ=255) gCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGt < 1:11318357/101‑1 (MQ=255) gTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTAc > 1:872723/1‑101 (MQ=255) gTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTAc > 1:4060510/1‑101 (MQ=255) tCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTAcc > 1:2771383/1‑101 (MQ=255) cAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCg < 1:5173754/101‑1 (MQ=255) cAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCg < 1:1881968/101‑1 (MQ=255) aGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCgg < 1:11715945/101‑1 (MQ=255) cGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGtt < 1:6550821/101‑1 (MQ=255) ggTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTc < 1:7832253/101‑1 (MQ=255) gTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCa < 1:1728028/101‑1 (MQ=255) tACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCaa > 1:10023767/1‑101 (MQ=255) aCGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCaaa > 1:332403/1‑101 (MQ=255) aCGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCaaa < 1:2671670/101‑1 (MQ=255) cGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAAt < 1:2508992/101‑1 (MQ=255) gTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATg < 1:5816238/101‑1 (MQ=255) tGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGc < 1:14049761/101‑1 (MQ=255) aCAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTg < 1:11628042/101‑1 (MQ=255) aCAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTg < 1:8839461/101‑1 (MQ=255) cAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTgg < 1:12295912/101‑1 (MQ=255) aGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGa > 1:7131494/1‑101 (MQ=255) gCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGAt > 1:8313123/1‑101 (MQ=255) ccATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATa < 1:7495925/101‑1 (MQ=255) cATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAc < 1:9252162/101‑1 (MQ=255) aTCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAcc > 1:9855490/1‑101 (MQ=255) aTCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCCCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAcc > 1:12777632/1‑101 (MQ=255) cTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCa < 1:940585/101‑1 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg < 1:11786343/101‑1 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg > 1:2284349/1‑101 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg > 1:13243641/1‑101 (MQ=255) tCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACg < 1:6266845/101‑1 (MQ=255) aCCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATGCCCAGACGGt < 1:8149418/101‑1 (MQ=255) aCCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGt > 1:7967182/1‑101 (MQ=255) aCCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGt > 1:10628709/1‑101 (MQ=255) ccATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTg < 1:8070359/101‑1 (MQ=255) cATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGc > 1:7848664/1‑101 (MQ=255) cATCGAAGTCGGCGTTACATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGc < 1:10100991/101‑1 (MQ=255) aTCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCa < 1:13876459/101‑1 (MQ=255) tCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCag < 1:6849948/101‑1 (MQ=255) tCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCag < 1:1351996/101‑1 (MQ=255) cGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCaga > 1:8008484/1‑101 (MQ=255) gAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCagag > 1:8489827/1‑101 (MQ=255) aaGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGt < 1:9108616/101‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGt < 1:13000022/101‑1 (MQ=255) aGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTc < 1:13227907/101‑1 (MQ=255) gTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCg > 1:2458915/1‑101 (MQ=255) gCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGc < 1:7299082/101‑1 (MQ=255) gCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGc < 1:11982108/101‑1 (MQ=255) gTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCAc > 1:12681365/1‑101 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg < 1:12910607/101‑1 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg < 1:2085919/101‑1 (MQ=255) atatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGt < 1:9136698/101‑1 (MQ=255) tGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTca > 1:2783153/1‑101 (MQ=255) gCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcag < 1:1798791/101‑1 (MQ=255) cctcacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagc < 1:4345156/92‑1 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca < 1:5468704/101‑1 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca > 1:680392/1‑101 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca < 1:1154528/101‑1 (MQ=255) tcacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagcag < 1:10940725/94‑1 (MQ=255) gCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagcag < 1:14116956/101‑1 (MQ=255) cacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagcagg > 1:5835402/7‑100 (MQ=255) cacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagcagg < 1:4611808/95‑2 (MQ=255) cacaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGt > 1:705713/1‑101 (MQ=255) acaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTa < 1:465671/101‑1 (MQ=255) caAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAc > 1:13322691/1‑101 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc > 1:10030391/1‑101 (MQ=255) aaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCg < 1:3161211/101‑1 (MQ=255) aaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCg < 1:110714/101‑1 (MQ=255) aaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCg > 1:10447850/1‑101 (MQ=255) gccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCgg < 1:2963135/100‑1 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt < 1:3459345/101‑1 (MQ=255) agtgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtg < 1:2855096/98‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGTTAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg < 1:301782/101‑1 (MQ=255) tgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtgtc < 1:2367695/100‑2 (MQ=255) cGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGtt < 1:10663787/101‑1 (MQ=255) gggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtgtcc > 1:6321012/1‑99 (MQ=255) gTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcgc > 1:5558021/1‑101 (MQ=255) gTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcgg < 1:4223904/101‑2 (MQ=255) tGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcgcg < 1:3653886/101‑1 (MQ=255) tGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcgcg < 1:1395012/101‑1 (MQ=255) gCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggta < 1:11464848/101‑4 (MQ=255) cAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggtaa > 1:2614801/1‑97 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt < 1:12107426/101‑1 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt < 1:5725516/101‑1 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATACCTGGATACCCAGACGCTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt > 1:4505839/1‑101 (MQ=255) gCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATa < 1:7194777/101‑1 (MQ=255) cTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATaa > 1:3829751/1‑101 (MQ=255) aTAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTc < 1:6458902/101‑1 (MQ=255) aGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGt < 1:4865868/101‑1 (MQ=255) aGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGt > 1:843073/1‑101 (MQ=255) | CTTCCAGCTGGGCTTCCAGCGTCAGCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGT > NC_007779/3449894‑3450094 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |