| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,451,600 | T→C | 14.9% | E1279E (GAA→GAG) | rpoB ← | RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,451,600 | 0 | T→C | 14.9% | 129.3 ‑0.3 ‑0.1 | 301 | E1279E (GAA→GAG) | rpoB | RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (23/22): ref base (122/134): total (145/156) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.47e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.25e-01 | ||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
GGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAC > NC_007779/3451500‑3451700 | ttGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTc < 1:3327906/101‑1 (MQ=255) tGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTcc < 1:8166302/101‑1 (MQ=255) accGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTTATCAGACTTAACGGTCAGCATTTCCTGCAGGGTGTGTGCTGCGCCGTATGCTTCCa > 1:12845856/2‑101 (MQ=255) ccGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAg < 1:14067/101‑1 (MQ=255) cGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAgc < 1:10572520/101‑1 (MQ=255) ccACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGcc > 1:2118083/1‑101 (MQ=255) cACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGccc > 1:8234911/1‑101 (MQ=255) cGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCcac < 1:5471670/101‑1 (MQ=255) gATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCcaca > 1:13375185/1‑101 (MQ=255) aTGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCacac > 1:9778426/1‑101 (MQ=255) tGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACt < 1:5122164/101‑1 (MQ=255) tGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACt < 1:5022538/101‑1 (MQ=255) tGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACt > 1:3698081/1‑101 (MQ=255) tttttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTc > 1:12800414/1‑101 (MQ=255) tttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCa > 1:3984450/1‑101 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt < 1:4138777/101‑1 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt > 1:8582093/1‑101 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt < 1:8695166/101‑1 (MQ=255) tataCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtc < 1:6411738/101‑1 (MQ=255) tataCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtc > 1:8469536/1‑101 (MQ=255) tCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCg < 1:7977877/101‑1 (MQ=255) cTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGa < 1:1465047/101‑1 (MQ=255) ggTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAAc < 1:10049860/101‑1 (MQ=255) gTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACg < 1:12932593/101‑1 (MQ=255) tACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGc > 1:11556218/1‑101 (MQ=255) aCGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCt > 1:9166026/1‑101 (MQ=255) aCGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCt < 1:2074577/101‑1 (MQ=255) cGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTg > 1:1665060/1‑101 (MQ=255) gACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGa > 1:4717713/1‑101 (MQ=255) aCCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGac < 1:429813/101‑1 (MQ=255) ccGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacc < 1:11095617/101‑1 (MQ=255) ccGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacc < 1:10402283/101‑1 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca < 1:7178038/101‑1 (MQ=255) gTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccac > 1:5209680/1‑101 (MQ=255) gTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccac < 1:8367924/101‑1 (MQ=255) gTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccac > 1:714663/1‑101 (MQ=255) ttCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccacc < 1:11939979/101‑1 (MQ=255) ttCACGACATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacaacc > 1:10128193/1‑101 (MQ=255) cACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGa < 1:4480752/101‑1 (MQ=255) aCGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGaa < 1:1756725/101‑1 (MQ=255) tcatcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtg > 1:7595279/1‑101 (MQ=255) catcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtgt < 1:7793505/101‑1 (MQ=255) tcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGc < 1:6283216/101‑1 (MQ=255) ggACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCt > 1:6689090/2‑101 (MQ=255) aGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCt > 1:1249289/1‑101 (MQ=255) gACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCTATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCtt < 1:1966839/101‑1 (MQ=255) gACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCtt < 1:9516027/101‑1 (MQ=255) aCTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTa > 1:11488216/1‑101 (MQ=255) cttgatggTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTac > 1:2685457/7‑101 (MQ=255) cttgatggTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCCCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTac > 1:5292844/7‑101 (MQ=255) ttgatggTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTaga > 1:13693556/6‑99 (MQ=255) ttAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTacc > 1:2466588/1‑101 (MQ=255) ttAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTacc > 1:8963194/1‑101 (MQ=255) ttAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTacc > 1:13784607/1‑101 (MQ=255) ttAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTacc > 1:2873292/1‑101 (MQ=255) ggTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCa < 1:3559445/101‑1 (MQ=255) gTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAg < 1:14255835/101‑1 (MQ=255) gTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAg > 1:9362283/1‑101 (MQ=255) gTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAg < 1:6343851/101‑1 (MQ=255) gCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgc < 1:8820160/101‑1 (MQ=255) gCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgc > 1:3237132/1‑101 (MQ=255) cagctCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGgct < 1:11817230/97‑1 (MQ=255) cATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgct > 1:10737194/1‑101 (MQ=255) cATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgct < 1:3014811/101‑1 (MQ=255) tttCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgctgc > 1:6082537/1‑101 (MQ=255) tCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGctgctg > 1:7957778/1‑101 (MQ=255) ccTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGctgctgg > 1:5620554/1‑100 (MQ=255) ccTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGctgctgg > 1:12229700/1‑100 (MQ=255) cTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAg < 1:11689733/101‑1 (MQ=255) tGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGctgctggga > 1:10982864/1‑98 (MQ=255) cAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTaa > 1:10494865/1‑101 (MQ=255) gggTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTaatc > 1:12673011/1‑99 (MQ=255) gggTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTaatc > 1:9106651/1‑99 (MQ=255) ggTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCa > 1:7425075/1‑101 (MQ=255) ggTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCa > 1:9320991/1‑101 (MQ=255) tgtATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAgg > 1:6183821/1‑101 (MQ=255) tgtATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAgg < 1:8662223/101‑1 (MQ=255) gtATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc > 1:3155491/1‑101 (MQ=255) gtATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc < 1:6485820/101‑1 (MQ=255) tATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCt < 1:8090103/101‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTg < 1:6935498/101‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTg < 1:4230709/101‑1 (MQ=255) ggcagcgcCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTAATCatggagt < 1:3208515/97‑7 (MQ=255) tgcGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAg < 1:10286375/101‑1 (MQ=255) agcgcCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTAATCatggagtacg > 1:6877422/2‑92 (MQ=255) gcgcCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTAATCatggagtacgg < 1:12996814/101‑11 (MQ=255) cgcCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAAGCtcttaaaa > 1:14020187/1‑94 (MQ=255) gcCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAAc > 1:7073685/1‑101 (MQ=255) ccGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAAcc > 1:3258093/1‑101 (MQ=255) cGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCg > 1:584957/1‑101 (MQ=255) cGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCg > 1:661142/1‑101 (MQ=255) cGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCg > 1:7390733/1‑101 (MQ=255) gTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCgg < 1:2375321/101‑1 (MQ=255) tATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGt < 1:13278856/101‑1 (MQ=255) tGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTgg < 1:2185614/101‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGa < 1:9870536/101‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGa > 1:4081036/1‑101 (MQ=255) cTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGaa < 1:5947241/101‑1 (MQ=255) ttCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAc > 1:1540134/1‑101 (MQ=255) ttCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAc < 1:11261067/101‑1 (MQ=255) | GGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAC > NC_007779/3451500‑3451700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |