| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 190,445 | C→G | 6.8% | S191C (TCT→TGT) | rpsB → | 30S ribosomal protein S2 |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 190,445 | 0 | C→G | 6.8% | 46.9 ‑2.4 0.0 | 276 | S191C (TCT→TGT) | rpsB | 30S ribosomal protein S2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (14/5): ref base (133/124): total (147/129) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 9.37e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
CGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGC > NC_007779/190346‑190545 | cGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAActct > 1:13505268/1‑101 (MQ=255)cGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAActct < 1:10954536/101‑1 (MQ=255) ggACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTg > 1:3353323/1‑101 (MQ=255) gACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGa < 1:3262668/101‑1 (MQ=255) gCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATcc > 1:2129186/1‑101 (MQ=255) tctGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCgg > 1:9829520/1‑101 (MQ=255) tGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGAc < 1:12911176/101‑1 (MQ=255) tttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCCGACgg < 1:8578767/101‑1 (MQ=255) tttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCCATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACgg > 1:9484010/1‑101 (MQ=255) ttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgt > 1:13702773/1‑101 (MQ=255) tGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgtg > 1:5815075/1‑101 (MQ=255) tAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGtt < 1:733587/101‑1 (MQ=255) aaTCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTg < 1:11846131/101‑1 (MQ=255) aTCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGa < 1:7353513/101‑1 (MQ=255) aTCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGa > 1:4389821/1‑101 (MQ=255) tCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTAGAc > 1:8093426/1‑101 (MQ=255) cGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACt < 1:1476515/101‑1 (MQ=255) cTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAAATCTGAACCGGACGGGGttttatttttt > 1:13891790/1‑92 (MQ=255) tGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTa < 1:7845131/101‑1 (MQ=255) ccACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATcc > 1:2807619/1‑101 (MQ=255) cACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATccc < 1:3824797/101‑1 (MQ=255) aCGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCg < 1:6240088/101‑1 (MQ=255) gAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCggg < 1:2244609/101‑1 (MQ=255) aaCACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGt < 1:5352089/101‑1 (MQ=255) aaCACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGt < 1:5608523/101‑1 (MQ=255) caTTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacg < 1:8626920/101‑1 (MQ=255) aTTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacga > 1:12976341/1‑101 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac > 1:6695177/1‑101 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:11695917/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:10395569/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:13230956/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:913813/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac > 1:4499705/1‑101 (MQ=255) tGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacg < 1:3482393/101‑1 (MQ=255) tGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacg > 1:4331367/1‑101 (MQ=255) cTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgac > 1:10863908/1‑101 (MQ=255) cAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCaa > 1:4954614/1‑101 (MQ=255) cAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCaa > 1:6802386/1‑101 (MQ=255) agaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATcc > 1:6755601/1‑101 (MQ=255) agaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATcc < 1:5997909/101‑1 (MQ=255) gaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCg > 1:6862705/1‑101 (MQ=255) gaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCg < 1:11487750/101‑1 (MQ=255) gctaagaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGc > 1:2569547/10‑101 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc < 1:6092093/101‑1 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc > 1:8334280/1‑101 (MQ=255) ctaagaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCt < 1:12348829/93‑1 (MQ=255) cAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCt > 1:4808675/1‑101 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg > 1:12004183/1‑101 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg < 1:7502335/101‑1 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCCGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg > 1:8498080/1‑101 (MQ=255) aacaacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtgt > 1:5142521/1‑101 (MQ=255) acaacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtgtg < 1:12633134/101‑1 (MQ=255) gaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgctt > 1:4115653/5‑98 (MQ=255) gaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgctt > 1:7911531/5‑98 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc < 1:4544248/101‑1 (MQ=255) gcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccg > 1:14091970/2‑95 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc > 1:9355226/1‑101 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc < 1:10009566/101‑1 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc > 1:12124428/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGTTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAcccg > 1:8244921/1‑100 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGGTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:10581655/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:8719163/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:1719490/1‑101 (MQ=255) gggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGt < 1:11365490/101‑1 (MQ=255) gggCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgtgc > 1:6317199/1‑92 (MQ=255) ggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTa < 1:13059012/101‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTa < 1:2962886/101‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTa < 1:1163476/101‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTa < 1:711678/101‑1 (MQ=255) gTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAc < 1:9728444/101‑1 (MQ=255) tATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAcc > 1:10966806/1‑101 (MQ=255) aTTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCt < 1:13136184/101‑1 (MQ=255) ttCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTg < 1:10416614/101‑1 (MQ=255) ttCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTg > 1:5480301/1‑101 (MQ=255) tCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTgg < 1:9534593/101‑1 (MQ=255) tCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTgg > 1:9014756/1‑101 (MQ=255) tCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTgg < 1:1781258/101‑1 (MQ=255) ccGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTggg > 1:11520669/1‑101 (MQ=255) ggTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGgcg < 1:13020099/101‑1 (MQ=255) ggTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGgcg > 1:1967489/1‑101 (MQ=255) aTTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTg > 1:2656340/1‑101 (MQ=255) tttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGt < 1:2159315/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGtt > 1:1005196/1‑101 (MQ=255) tGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtg > 1:11151999/1‑101 (MQ=255) gCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgc > 1:12391357/1‑101 (MQ=255) tATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgctg < 1:12815480/101‑1 (MQ=255) aTCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgctgc > 1:1618805/1‑101 (MQ=255) cGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTTACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCac > 1:2374772/1‑100 (MQ=255) ttGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAAcc < 1:5640319/101‑1 (MQ=255) tGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCg > 1:4697742/1‑101 (MQ=255) aTACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTa > 1:10293135/1‑101 (MQ=255) aTACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTa < 1:12040974/101‑1 (MQ=255) aTACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTa > 1:3064088/1‑101 (MQ=255) aTACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGAGCGCTGTTGCTGCAACCGTa > 1:6590487/1‑101 (MQ=255) tACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTAc < 1:10157505/101‑1 (MQ=255) tACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTAc < 1:110843/101‑1 (MQ=255) cAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTg < 1:13775754/101‑1 (MQ=255) ctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGc > 1:13375490/1‑101 (MQ=255) ctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGc > 1:1343932/1‑101 (MQ=255) ctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGc < 1:14255031/101‑1 (MQ=255) | CGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGC > NC_007779/190346‑190545 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |