| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 190,446 | T→C | 6.7% | S191S (TCT→TCC) | rpsB → | 30S ribosomal protein S2 |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 190,446 | 0 | T→C | 6.7% | 39.6 ‑2.4 ‑0.1 | 276 | S191S (TCT→TCC) | rpsB | 30S ribosomal protein S2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (14/5): ref base (133/124): total (147/129) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 9.37e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.19e-01 | ||||||||||
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
CGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCC > NC_007779/190346‑190546 | cGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAActct < 1:10954536/101‑1 (MQ=255) ggACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTg < 1:8061983/101‑1 (MQ=255) tctGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCgg > 1:9829520/1‑101 (MQ=255) tttGTAATCGATGCTGACCACGAATACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACgg > 1:5053521/1‑101 (MQ=255) tttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACgg < 1:6002181/101‑1 (MQ=255) tttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCCATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACgg > 1:9484010/1‑101 (MQ=255) ttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgt < 1:4375430/101‑1 (MQ=255) ttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgt > 1:2482458/1‑101 (MQ=255) tGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgtg < 1:5612314/101‑1 (MQ=255) tGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgtg < 1:12769591/101‑1 (MQ=255) aTCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGa < 1:7353513/101‑1 (MQ=255) tCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGAc < 1:13806178/101‑1 (MQ=255) tCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGAc > 1:2134860/1‑101 (MQ=255) aTGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTc > 1:8455929/1‑101 (MQ=255) aTGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTc > 1:7905469/1‑101 (MQ=255) aTGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTc < 1:2332405/101‑1 (MQ=255) aTGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTc > 1:1191830/1‑101 (MQ=255) tGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGTAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCg < 1:14306357/101‑1 (MQ=255) tGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCg > 1:7187718/1‑101 (MQ=255) gCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGt > 1:8546320/1‑101 (MQ=255) cTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGtt > 1:4938565/1‑101 (MQ=255) tGACCAAGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTa > 1:12376443/1‑101 (MQ=255) gACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTAt > 1:13486784/1‑101 (MQ=255) aCCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATc > 1:58257/1‑101 (MQ=255) ccACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATcc < 1:12954478/101‑1 (MQ=255) cGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCgg < 1:6311887/101‑1 (MQ=255) acacATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTa < 1:1531362/101‑1 (MQ=255) cacaTTACTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTaa > 1:13724990/1‑101 (MQ=255) acaTTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAac < 1:12582368/101‑1 (MQ=255) caTTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacg < 1:8626920/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:913813/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:1395494/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:3436770/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:13230956/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:10395569/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac > 1:5324412/1‑101 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:11695917/101‑1 (MQ=255) tGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacg < 1:13609034/101‑1 (MQ=255) gCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacga < 1:6403876/101‑1 (MQ=255) cTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgac > 1:10863908/1‑101 (MQ=255) cTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgac > 1:1736703/1‑101 (MQ=255) aagaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATc < 1:464987/101‑1 (MQ=255) gaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCg < 1:11487750/101‑1 (MQ=255) aagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGt > 1:2844139/1‑101 (MQ=255) agCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTg < 1:4714945/101‑1 (MQ=255) agCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTg > 1:7670167/1‑101 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc > 1:3151322/1‑101 (MQ=255) ctaagaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCt > 1:1801619/9‑101 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg < 1:7502335/101‑1 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCGGGATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg > 1:3824554/1‑101 (MQ=255) aagaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgc > 1:13417060/7‑100 (MQ=255) aacaacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtgt < 1:4442626/101‑1 (MQ=255) caacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGa > 1:14182462/1‑101 (MQ=255) agcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttcc > 1:2001271/3‑96 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc > 1:9355226/1‑101 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc < 1:10009566/101‑1 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc > 1:12124428/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGGTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:10581655/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:8719163/1‑101 (MQ=255) cTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgt > 1:8211419/1‑94 (MQ=255) tGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTg < 1:4241913/101‑1 (MQ=255) tGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTg < 1:4530529/101‑1 (MQ=255) gggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGt > 1:3315918/1‑101 (MQ=255) ggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTa < 1:13059012/101‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTa < 1:8287653/101‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTa < 1:1163476/101‑1 (MQ=255) gTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAc < 1:9728444/101‑1 (MQ=255) tATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAcc > 1:10966806/1‑101 (MQ=255) aTTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCt < 1:13136184/101‑1 (MQ=255) ttCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTg < 1:1633229/101‑1 (MQ=255) ttCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTg < 1:10416614/101‑1 (MQ=255) tCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTgg < 1:9534593/101‑1 (MQ=255) tCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTgg > 1:9014756/1‑101 (MQ=255) tCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTgg < 1:2226068/101‑1 (MQ=255) ccGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTggg > 1:11520669/1‑101 (MQ=255) ggTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGgcg < 1:6843494/101‑1 (MQ=255) ggTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGgcg > 1:12341603/1‑101 (MQ=255) gTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGgcgc > 1:3942516/1‑101 (MQ=255) tATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCt > 1:6737071/1‑101 (MQ=255) tttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGt > 1:11260079/1‑101 (MQ=255) tttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGt > 1:118260/1‑101 (MQ=255) ttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGtt > 1:1005196/1‑101 (MQ=255) ttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGtt < 1:5687502/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGtt < 1:11112587/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGtt < 1:7115971/101‑1 (MQ=255) cTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgct < 1:6777568/101‑1 (MQ=255) tATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgctg < 1:5405479/101‑1 (MQ=255) aTCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTTCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgctgc > 1:5515676/1‑101 (MQ=255) tCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCa > 1:6134880/1‑101 (MQ=255) ttGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAAcc < 1:12900278/101‑1 (MQ=255) gATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGt < 1:12994176/101‑1 (MQ=255) aTACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTa < 1:12040974/101‑1 (MQ=255) aTACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTa > 1:10293135/1‑101 (MQ=255) tACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTAc < 1:10157505/101‑1 (MQ=255) aCTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGaa < 1:13336290/101‑1 (MQ=255) ctctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAg < 1:665405/101‑1 (MQ=255) ctctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAg < 1:2593529/101‑1 (MQ=255) tctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAgg > 1:2981697/1‑101 (MQ=255) ctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGc < 1:2706420/101‑1 (MQ=255) tGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGcc < 1:11367493/101‑1 (MQ=255) | CGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCC > NC_007779/190346‑190546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |