Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 3,717,895 | A→G | 6.9% | N358D (AAC→GAC) | atpA → | F1 sector of membrane‑bound ATP synthase subunit alpha |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,717,895 | 0 | A→G | 6.9% | 38.1 ‑2.5 ‑0.0 | 261 | N358D (AAC→GAC) | atpA | F1 sector of membrane‑bound ATP synthase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/13): ref base (124/118): total (129/132) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.50e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.55e-01 |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
GACCGCACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGAAAAAACTGTCCGG > NC_007779/3717795‑3717995 | aCCGCACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCACCGTAATCTCCATACCCGATGGTCAGATCTTCCTGGAaaccac > 1:567977/1‑100 (MQ=255) cGCACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAaaccaacc > 1:9913315/1‑101 (MQ=255) cGCACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAaaccaacc > 1:12060760/1‑101 (MQ=255) cGCACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAaaccaacc < 1:10366704/101‑1 (MQ=255) gCACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCt > 1:5280212/1‑101 (MQ=255) cACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTg < 1:2728825/101‑1 (MQ=255) cACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTg > 1:3650264/1‑101 (MQ=255) cTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGtt > 1:1895822/1‑101 (MQ=255) cTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGGGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACCTAATCTCCATTACCGATGGGCAAATCTTCCTCGAAACCAACCCGtt > 1:9549118/1‑101 (MQ=255) gCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCa < 1:145863/101‑1 (MQ=255) ccGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCaa > 1:14186871/1‑101 (MQ=255) gATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACg < 1:3906475/101‑1 (MQ=255) gATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACg < 1:3761562/101‑1 (MQ=255) aTTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGc > 1:13412689/1‑101 (MQ=255) aTCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCgg < 1:6649848/101‑1 (MQ=255) aTCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCgg < 1:6839418/101‑1 (MQ=255) aTCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCgg > 1:12428935/1‑101 (MQ=255) tCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGt < 1:5971238/101‑1 (MQ=255) tCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCCGt < 1:3453639/101‑1 (MQ=255) gAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTAt < 1:8512017/101‑1 (MQ=255) aaaCTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTAtt < 1:1998339/101‑1 (MQ=255) aaaCTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTAtt < 1:7300399/101‑1 (MQ=255) aaCTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTc < 1:1198140/101‑1 (MQ=255) aaCTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTc < 1:11178369/101‑1 (MQ=255) aaCTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATATTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTc < 1:2092686/101‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTcc < 1:11846804/101‑1 (MQ=255) aGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCt < 1:10016638/101‑1 (MQ=255) aGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCt > 1:11377270/1‑101 (MQ=255) ggCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTg < 1:107426/101‑1 (MQ=255) gCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGc < 1:10667868/101‑1 (MQ=255) cGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCg > 1:9498610/1‑101 (MQ=255) cGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCg < 1:8881551/101‑1 (MQ=255) tgTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGt > 1:2474952/2‑101 (MQ=255) gTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGtt < 1:13982652/101‑1 (MQ=255) tGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTa > 1:11563611/1‑101 (MQ=255) gACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTaa < 1:10071774/101‑1 (MQ=255) gTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAAccc > 1:826574/1‑101 (MQ=255) gTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAAccc < 1:10248698/101‑1 (MQ=255) tttCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATCCGTCCTGCGGTTAACCCg > 1:5877295/1‑101 (MQ=255) tCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCggg > 1:4734899/1‑101 (MQ=255) tCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCggg < 1:12721407/101‑1 (MQ=255) cTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGt > 1:6249499/1‑101 (MQ=255) tGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTa < 1:10338141/101‑1 (MQ=255) tGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTa > 1:13103874/1‑101 (MQ=255) gttcgttcCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTAttt > 1:464617/1‑101 (MQ=255) ttcgttcCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTc > 1:8104441/1‑101 (MQ=255) tcgttcCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTcc > 1:13571089/1‑101 (MQ=255) tcgttcCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTcc < 1:845142/101‑1 (MQ=255) tcCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTAt < 1:10445316/101‑1 (MQ=255) cGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATcc > 1:7906844/1‑101 (MQ=255) gACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATccc > 1:6450103/1‑101 (MQ=255) aCCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCg < 1:13269400/101‑1 (MQ=255) aCCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCg < 1:13719915/101‑1 (MQ=255) ccAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCgt < 1:13918945/101‑1 (MQ=255) cAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAGCGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCgtg < 1:7724735/101‑1 (MQ=255) cAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCgtg > 1:5474218/1‑101 (MQ=255) cAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCgtg > 1:928159/1‑101 (MQ=255) tAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTtggt > 1:7386941/1‑101 (MQ=255) tAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTtggt < 1:9715342/101‑1 (MQ=255) tAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTtggt > 1:1053426/1‑101 (MQ=255) tAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTtggt < 1:11636668/101‑1 (MQ=255) aaTCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTtggtg < 1:9159973/101‑1 (MQ=255) aTCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTtggtgg < 1:3392960/101‑1 (MQ=255) tctcCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTggtggt > 1:2776085/1‑101 (MQ=255) cATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTgcag < 1:4380277/101‑1 (MQ=255) cATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTgcag < 1:1350735/101‑1 (MQ=255) cATTACCGACGGCCAGGTCTTCCTCGAGTCCGACCTGTTCAACCAGGGTGTCCGCCCGGCTATTAACGTCGGTGTGTCGGTTTCCCGTGTTGGTGGTgccg > 1:9365941/1‑99 (MQ=255) aTTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTgcagc > 1:7166488/1‑101 (MQ=255) ttACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTgcagca < 1:2974878/101‑1 (MQ=255) tACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGcac < 1:5202925/101‑1 (MQ=255) aCCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGcaca > 1:4772534/1‑101 (MQ=255) ccGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAg < 1:5399311/101‑1 (MQ=255) ccGACGGCCAGGTCTTCCTCGAGTCCGACCTGTTCAACCAGGGTGTCCGCCCGGCTATTAACGTCGGTGTGTCGGTTTCCCGTGTTGGTGGTGCCGCACAg > 1:10931363/1‑101 (MQ=255) gATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGAc > 1:2244066/1‑101 (MQ=255) gATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGAc > 1:6983091/1‑101 (MQ=255) acggccAGGTCTTCCTCGAGTCCGACCTGTTCAACCAGGGTGTCCGCCCGGCTATTAACGTCGGTGTGTCGGTTTCCCGTGTTGGTGGTGCCGCACAGAcc < 1:4033931/96‑1 (MQ=255) acggccAGGTCTTCCTCGAGTCCGACCTGTTCAACCAGGGTGTCCGCCCGGCTATTAACGTCGGTGTGTCGGTTTCCCGTGTTGGTGGTGCCGCACAGAcc < 1:4542583/96‑1 (MQ=255) aTGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGAcc > 1:10876701/1‑101 (MQ=255) aTGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGAcc > 1:7885480/1‑101 (MQ=255) tGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCa > 1:12666368/1‑101 (MQ=255) ggTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCaa > 1:161879/1‑101 (MQ=255) gTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAg < 1:318800/101‑1 (MQ=255) gTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAg < 1:6827483/101‑1 (MQ=255) gTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAg > 1:1141379/1‑101 (MQ=255) tCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGa > 1:11512268/1‑101 (MQ=255) cAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGAt < 1:5821559/101‑1 (MQ=255) cAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGAt > 1:13017856/1‑101 (MQ=255) ggtCTTCCTCGAGTCCGACCTGTTCAACCAGGGTGTCCGCCCGGCTATTAACGTCGGTGTGTCGGTTTCCCGTGTTGGTGGTGCCGCACAGACCAAgggca < 1:1787134/99‑5 (MQ=255) tCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATg > 1:8673657/1‑101 (MQ=255) tCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATg < 1:5012050/101‑1 (MQ=255) tCTTCCTCGAGTCCGACCTGTTCAACCAGGGTGTCCGCCCGGCTATTAACGTCGGTGTGTCGGTTTCCCGTGTTGGTGGTGCCGCACAGACCAAGGGCATg < 1:12159348/101‑1 (MQ=255) ccTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGaaaa < 1:12221535/101‑1 (MQ=255) cTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGaaaaa < 1:8921086/101‑1 (MQ=255) tGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGaaaaaa < 1:3131995/101‑1 (MQ=255) ggAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGAAAAAAc < 1:6034196/101‑1 (MQ=255) gAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGAAAAAACt > 1:660982/1‑101 (MQ=255) aaaCCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGAAAAAACTg < 1:10143608/101‑1 (MQ=255) ccaaccTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGAAAAAACTGTcc > 1:11878000/1‑101 (MQ=255) caaccTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGAAAAAACTGTCCg > 1:1539151/1‑101 (MQ=255) aaccTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGAAAAAACTGTCCgg < 1:7053952/101‑1 (MQ=255) | GACCGCACTGCCGATTATCGAAACTCAGGCGGGTGACGTTTCTGCGTTCGTTCCGACCAACGTAATCTCCATTACCGATGGTCAGATCTTCCTGGAAACCAACCTGTTCAACGCCGGTATTCGTCCTGCGGTTAACCCGGGTATTTCCGTATCCCGTGTTGGTGGTGCAGCACAGACCAAGATCATGAAAAAACTGTCCGG > NC_007779/3717795‑3717995 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |