| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,051,694 | G→A | 13.9% | A154T (GCG→ACG) | ugpC → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,051,694 | 0 | G→A | 13.9% | 90.7 ‑0.7 ‑0.0 | 274 | A154T (GCG→ACG) | ugpC | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (23/15): ref base (125/111): total (148/126) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.83e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.71e-01 | ||||||||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
CATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGAC > NC_007779/4051594‑4051794 | ttCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCcggcg > 1:2725576/1‑101 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCcggcgg > 1:8041536/1‑101 (MQ=255) cTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGgt > 1:5158297/1‑101 (MQ=255) cTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGgt < 1:4348952/101‑1 (MQ=255) tGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGgtg < 1:547516/101‑1 (MQ=255) tGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGGCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGGGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGAGCGATTGTGCGCGATCCGGCGgtg < 1:11877818/101‑1 (MQ=255) gAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGtt > 1:187784/1‑101 (MQ=255) gAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGtt < 1:10843343/101‑1 (MQ=255) aGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTc > 1:641581/1‑101 (MQ=255) ggTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtga < 1:7520787/101‑1 (MQ=255) ggTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtga > 1:3521607/1‑101 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat > 1:347185/1‑101 (MQ=255) tCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatg < 1:1169459/101‑1 (MQ=255) cTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatga > 1:7938292/1‑101 (MQ=255) tGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAg < 1:8376051/101‑1 (MQ=255) gCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGc > 1:8192360/1‑101 (MQ=255) gCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGc > 1:5942846/1‑101 (MQ=255) cTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGCTTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGcc > 1:428798/1‑101 (MQ=255) tCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCg > 1:3589503/1‑101 (MQ=255) gaccgcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGCCCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGct > 1:12820090/9‑101 (MQ=2) aaCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctc < 1:6343433/101‑1 (MQ=255) aCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCTCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctct > 1:2144326/1‑101 (MQ=255) gTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctctct > 1:13968049/1‑101 (MQ=255) gTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTACGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctctct > 1:9702857/1‑101 (MQ=255) caagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGctctcaa < 1:13519346/98‑3 (MQ=2) tCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTa > 1:7292222/1‑101 (MQ=255) cGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTaa < 1:1642412/101‑1 (MQ=255) gCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAc > 1:360352/1‑101 (MQ=255) gCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAc > 1:13057905/1‑101 (MQ=255) gCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAAcc < 1:6705329/101‑1 (MQ=2) ccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCt > 1:11381578/1‑101 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg < 1:7163936/101‑1 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt > 1:13400541/1‑101 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt > 1:12590089/1‑101 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt < 1:10469764/101‑1 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt > 1:12061077/1‑101 (MQ=255) gAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGc < 1:12166756/101‑1 (MQ=255) ctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCaa > 1:9764756/10‑101 (MQ=9) ctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCaa > 1:3288707/10‑101 (MQ=9) ctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCaa > 1:9125445/10‑101 (MQ=9) ctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCaa > 1:13136777/10‑101 (MQ=9) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:8700050/101‑1 (MQ=255) tttCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAg > 1:14226077/1‑101 (MQ=255) tctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTCGACGCCAAg > 1:5802000/9‑101 (MQ=9) cgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCtc > 1:14316027/6‑100 (MQ=255) ccGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTg < 1:6074675/101‑1 (MQ=255) cggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgc < 1:7667021/101‑1 (MQ=255) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg > 1:1158167/1‑101 (MQ=255) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg < 1:8930696/101‑1 (MQ=255) gtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccgc < 1:4864215/99‑1 (MQ=255) gtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccgc > 1:2935063/3‑101 (MQ=255) tggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCcgcg > 1:11666306/2‑101 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGt > 1:9549156/1‑101 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGt < 1:5373599/101‑1 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCAGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGt < 1:3099000/101‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCa < 1:12706380/101‑1 (MQ=255) ggctgcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGAGGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAg < 1:6931986/96‑1 (MQ=255) aGCGTCAGCGCCTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCaa > 1:3833973/1‑100 (MQ=255) aGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTTACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAg < 1:12891135/101‑1 (MQ=255) gcgtCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGa < 1:4058914/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt > 1:5652804/1‑101 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt < 1:10976911/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt < 1:910643/101‑1 (MQ=255) gtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATg > 1:11227920/3‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTACTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:8130809/101‑1 (MQ=255) cAGTGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg < 1:10118771/101‑1 (MQ=255) cAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCCCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg < 1:5626359/101‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGGCGATGGGCCGCGCCATCGCCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg < 1:11156484/101‑1 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt < 1:5006467/101‑1 (MQ=255) cgcgtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCGCGATGCgcac > 1:11603268/4‑98 (MQ=255) tgtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTg < 1:3629720/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGa < 1:1408658/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGa < 1:10320569/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGa < 1:2278404/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGa < 1:12352418/101‑1 (MQ=255) tgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGaa > 1:11832363/1‑101 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc < 1:6204681/101‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACt < 1:5683777/101‑1 (MQ=255) cGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTg > 1:10068171/1‑101 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:12406201/101‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa > 1:7581232/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAg > 1:2870875/1‑101 (MQ=255) ccGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGt > 1:1556966/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:10719366/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:4569803/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:937739/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:13629003/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:6820329/1‑101 (MQ=255) gcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTg < 1:1253692/101‑1 (MQ=255) cgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc > 1:7844188/1‑101 (MQ=255) cgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc < 1:1191692/101‑1 (MQ=255) cgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc > 1:2004098/1‑101 (MQ=255) gcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCa > 1:2355343/1‑101 (MQ=255) cgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc < 1:8747076/101‑1 (MQ=255) gATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAcc < 1:2689120/101‑1 (MQ=255) gATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAcc > 1:2951215/1‑101 (MQ=255) cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGa > 1:14184571/1‑101 (MQ=255) cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGa < 1:11775274/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa < 1:6782516/101‑1 (MQ=255) gcggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGAc < 1:13666224/101‑1 (MQ=255) | CATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGAC > NC_007779/4051594‑4051794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |