| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,051,695 | C→A | 13.9% | A154E (GCG→GAG) | ugpC → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,051,695 | 0 | C→A | 13.9% | 99.7 ‑0.7 ‑0.0 | 273 | A154E (GCG→GAG) | ugpC | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (23/15): ref base (125/110): total (148/125) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.84e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.71e-01 | ||||||||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
ATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACT > NC_007779/4051595‑4051795 | aTTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCcggc > 1:2948375/1‑101 (MQ=255) ttCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCcggcg < 1:3593498/101‑1 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCcggcgg < 1:13414636/101‑1 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCcggcgg > 1:8041536/1‑101 (MQ=255) tGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGgtg > 1:12355496/1‑101 (MQ=255) ggAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGgtgt < 1:13605968/101‑1 (MQ=255) ggAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGgtgt < 1:14305823/101‑1 (MQ=255) gAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGtt < 1:10843343/101‑1 (MQ=255) aGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTc > 1:641581/1‑101 (MQ=255) gCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTcc > 1:5369401/1‑101 (MQ=255) cTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCt > 1:4004100/1‑101 (MQ=255) tGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTg < 1:2354807/101‑1 (MQ=255) cGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtg > 1:12073244/1‑101 (MQ=255) ggTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtga < 1:7520787/101‑1 (MQ=255) tCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatg < 1:1169459/101‑1 (MQ=255) cTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatga > 1:7938292/1‑101 (MQ=255) tGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAg < 1:8376051/101‑1 (MQ=255) gCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGc > 1:8192360/1‑101 (MQ=255) gCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGc > 1:5942846/1‑101 (MQ=255) tCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCg > 1:4348105/1‑101 (MQ=255) aaaCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGct > 1:3329064/1‑101 (MQ=255) aaCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctc < 1:13670814/101‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctc < 1:6343433/101‑1 (MQ=255) gTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctctct > 1:436950/1‑101 (MQ=255) gTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTACGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctctct > 1:9702857/1‑101 (MQ=255) tCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTa > 1:7292222/1‑101 (MQ=255) agCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAAc > 1:5405076/2‑101 (MQ=2) gCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAc > 1:1221796/1‑101 (MQ=255) gCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAAcc < 1:6705329/101‑1 (MQ=2) gCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAAcc > 1:1543053/1‑101 (MQ=2) ccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCt > 1:11381578/1‑101 (MQ=255) cgcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc > 1:3618352/1‑101 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg > 1:203573/1‑101 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg < 1:7163936/101‑1 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt < 1:10469764/101‑1 (MQ=255) cgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACTTCGATg < 1:12539571/101‑1 (MQ=255) ctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCaa > 1:9125445/10‑101 (MQ=9) ctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCaa > 1:9764756/10‑101 (MQ=9) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa > 1:3092581/1‑101 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:8700050/101‑1 (MQ=255) tctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTCGACGCCAAg > 1:5802000/9‑101 (MQ=9) cgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCtc < 1:4201521/96‑2 (MQ=9) ccGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTg < 1:6074675/101‑1 (MQ=255) cggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgc < 1:7667021/101‑1 (MQ=255) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg > 1:1158167/1‑101 (MQ=255) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg < 1:8930696/101‑1 (MQ=255) gtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccgc < 1:4864215/99‑1 (MQ=255) gtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccgc < 1:11874708/99‑1 (MQ=255) tggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCcgcg > 1:11666306/2‑101 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGt > 1:9549156/1‑101 (MQ=255) ggctgcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGAGGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAg < 1:6931986/96‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt < 1:10976911/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt < 1:910643/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt < 1:3691772/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt > 1:5652804/1‑101 (MQ=255) gtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATg > 1:11227920/3‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg > 1:3498747/1‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:1993287/101‑1 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTACTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:8130809/101‑1 (MQ=255) ccAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGc < 1:12864782/101‑1 (MQ=255) cAGTGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg < 1:10118771/101‑1 (MQ=255) cAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg > 1:3112615/1‑101 (MQ=255) cAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg < 1:2789889/101‑1 (MQ=255) cAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCCCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg < 1:5626359/101‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGGCGATGGGCCGCGCCATCGCCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg < 1:11156484/101‑1 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt > 1:1263626/1‑101 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt > 1:179644/1‑101 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc > 1:13650187/1‑100 (MQ=255) gCGTGTGGCGATGGGCCGCGAGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTc < 1:14172705/101‑1 (MQ=255) cgcgtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCGCGATGCgcac > 1:11603268/4‑98 (MQ=255) gtgtGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCtt > 1:2928651/1‑101 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGa < 1:10320569/101‑1 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc < 1:6204681/101‑1 (MQ=255) gCGGTGGGCCGCTCTATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACt < 1:5143436/101‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACt < 1:5683777/101‑1 (MQ=255) cGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTg > 1:10068171/1‑101 (MQ=255) cGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTg < 1:12496965/101‑1 (MQ=255) gATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGc > 1:12948982/1‑101 (MQ=255) gATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGc < 1:219640/101‑1 (MQ=255) aTGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCa > 1:13063340/1‑101 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa > 1:14211465/1‑101 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa > 1:7581232/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAg > 1:1636843/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:937739/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:6820329/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:10719366/101‑1 (MQ=255) cgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc > 1:7844188/1‑101 (MQ=255) cgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc > 1:3522079/1‑101 (MQ=255) cgcgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc < 1:13210247/101‑1 (MQ=255) cgATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc < 1:8747076/101‑1 (MQ=255) gATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAcc > 1:11912898/1‑101 (MQ=255) aTTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCg > 1:2512467/1‑101 (MQ=255) cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGa < 1:11775274/101‑1 (MQ=255) gATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaa > 1:2714315/1‑101 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa < 1:6782516/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa < 1:11830668/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa > 1:12763964/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGCCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaaa > 1:14075487/1‑101 (MQ=255) cggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACt > 1:4987095/1‑101 (MQ=255) cggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACt < 1:11982046/101‑1 (MQ=255) | ATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACT > NC_007779/4051595‑4051795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |