| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,051,708 | T→G | 14.8% | F158L (TTT→TTG) | ugpC → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,051,708 | 0 | T→G | 14.8% | 120.1 ‑0.5 ‑0.0 | 264 | F158L (TTT→TTG) | ugpC | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (22/17): ref base (114/111): total (136/128) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.03e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.95e-01 | ||||||||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
ACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTT > NC_007779/4051608‑4051807 | ggTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtga > 1:8085642/1‑101 (MQ=255) ggTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtga > 1:3521607/1‑101 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat > 1:347185/1‑101 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat < 1:11488430/101‑1 (MQ=255) cTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatga > 1:7938292/1‑101 (MQ=255) tGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAg < 1:11905800/101‑1 (MQ=255) gCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGc > 1:8192360/1‑101 (MQ=255) cTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGCTTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGcc > 1:428798/1‑101 (MQ=255) tCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCg > 1:3589503/1‑101 (MQ=255) tCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGCGTTCCTGTTTGATGAGCCg > 1:6812837/1‑101 (MQ=255) accgcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGGCTTCCTCATGGACGAGCCGctc > 1:11820897/8‑101 (MQ=0) aaaCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGct < 1:12330726/101‑1 (MQ=255) aaaCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGct > 1:11360512/1‑101 (MQ=255) aaCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctc < 1:13670814/101‑1 (MQ=255) gTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctctct > 1:13968049/1‑101 (MQ=255) caagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGctctcaa < 1:13519346/98‑3 (MQ=2) tCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTa > 1:815054/1‑101 (MQ=255) tCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTa > 1:11759660/1‑101 (MQ=255) cGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTaa > 1:11839726/1‑101 (MQ=255) agCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAAc > 1:5405076/2‑101 (MQ=2) gCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAc > 1:360352/1‑101 (MQ=255) gCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAc > 1:13057905/1‑101 (MQ=255) gCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAAcc > 1:1543053/1‑101 (MQ=2) ccGCACGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCt > 1:11673652/1‑101 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg > 1:203573/1‑101 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg < 1:3038305/101‑1 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt > 1:12061077/1‑101 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt < 1:11656183/101‑1 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt < 1:10469764/101‑1 (MQ=255) cgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACTTCGATg < 1:12539571/101‑1 (MQ=255) cgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATg > 1:10093608/1‑101 (MQ=255) ctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCaa > 1:3288707/10‑101 (MQ=9) ctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCaa > 1:9125445/10‑101 (MQ=9) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:436798/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:10724964/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt < 1:10967180/101‑1 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTACCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:9712520/1‑101 (MQ=255) cgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCtc > 1:14316027/6‑100 (MQ=255) cggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgc < 1:7667021/101‑1 (MQ=255) gtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccgc > 1:2935063/3‑101 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGt < 1:5677663/101‑1 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGt > 1:9549156/1‑101 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGt > 1:9080677/1‑101 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGt < 1:11918705/101‑1 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGt > 1:2338748/1‑101 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCAGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGt < 1:3099000/101‑1 (MQ=255) gttaGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCAGCGCCCCCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGtc < 1:5886587/98‑2 (MQ=255) tCAGCGTCAGCGGGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGtcc < 1:7534089/101‑3 (MQ=255) aGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTTACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAg < 1:12891135/101‑1 (MQ=255) gcgtCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGa < 1:4058914/101‑1 (MQ=255) cgtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGAt > 1:9118042/4‑101 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt < 1:6237211/101‑1 (MQ=255) gtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATg < 1:570198/99‑1 (MQ=255) gtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATg > 1:11227920/3‑101 (MQ=255) gcCGGCGTGTGGCGAGGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:7180971/101‑1 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:1993287/101‑1 (MQ=255) ccAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGc < 1:12864782/101‑1 (MQ=255) cAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCTGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg > 1:12107080/1‑101 (MQ=255) cAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCCCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg < 1:5626359/101‑1 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt > 1:694173/1‑101 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt > 1:179644/1‑101 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt < 1:5006467/101‑1 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc > 1:604248/1‑100 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc > 1:13650187/1‑100 (MQ=255) gCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTc > 1:1159808/1‑101 (MQ=255) gCGTGTGGCGATGGGCCGCGAGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTc < 1:14172705/101‑1 (MQ=255) gtgtGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCtt < 1:740777/101‑1 (MQ=255) tgtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTg < 1:3629720/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGa < 1:1408658/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGa < 1:10320569/101‑1 (MQ=255) cGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTg > 1:10068171/1‑101 (MQ=255) cGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTg < 1:12496965/101‑1 (MQ=255) gATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGc < 1:219640/101‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa > 1:14211465/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAg > 1:2870875/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAg > 1:1636843/1‑101 (MQ=255) 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gATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAcc < 1:6756277/101‑1 (MQ=255) aTTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCg > 1:2512467/1‑101 (MQ=255) aTTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCg > 1:5222049/1‑101 (MQ=255) gtgCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCg > 1:8486484/1‑101 (MQ=255) gtgCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCg < 1:8716835/101‑1 (MQ=255) gtgCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCg < 1:6397845/101‑1 (MQ=255) gATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaa > 1:2714315/1‑101 (MQ=255) gATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaa > 1:12669013/1‑101 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa < 1:6897041/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa > 1:12763964/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaaa > 1:12379761/1‑101 (MQ=255) gtTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCAc > 1:8841093/1‑101 (MQ=255) gtTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCAc < 1:6123393/101‑1 (MQ=255) ttCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCAct > 1:1099213/1‑101 (MQ=255) tCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCActc > 1:9799432/1‑101 (MQ=255) tGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTAc < 1:6626069/101‑1 (MQ=255) ttGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAGCAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGtt < 1:11118887/101‑1 (MQ=255) | ACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTT > NC_007779/4051608‑4051807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |