| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,051,729 | C→G | 11.6% | L165L (CTC→CTG) | ugpC → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,051,729 | 0 | C→G | 11.6% | 89.6 ‑1.4 ‑0.0 | 269 | L165L (CTC→CTG) | ugpC | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (18/13): ref base (109/128): total (128/141) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.52e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.99e-01 | ||||||||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
CGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGCGA > NC_007779/4051629‑4051829 | cgcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc > 1:3618352/1‑101 (MQ=255)cgcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc < 1:1564535/101‑1 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg < 1:8899885/101‑1 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt < 1:10469764/101‑1 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt > 1:12061077/1‑101 (MQ=255) cgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACTTCGATg < 1:12539571/101‑1 (MQ=255) gAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGc < 1:12166756/101‑1 (MQ=255) aGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGcc > 1:4592633/1‑101 (MQ=255) tctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCa > 1:11685122/11‑101 (MQ=9) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGCGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa > 1:8195014/1‑101 (MQ=255) tttCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAg > 1:14226077/1‑101 (MQ=255) tctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTCGACGCCAAg > 1:5802000/9‑101 (MQ=9) tcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCt > 1:7707752/7‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:436798/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt < 1:10967180/101‑1 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:10724964/1‑101 (MQ=255) cggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgc < 1:1441024/101‑1 (MQ=255) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg > 1:1158167/1‑101 (MQ=255) tggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCcgcg > 1:11666306/2‑101 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCAGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGt < 1:3099000/101‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGGTTGATGAGCGGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCa > 1:2696592/1‑101 (MQ=255) ggctgcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGAGGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAg < 1:6931986/96‑1 (MQ=255) gcgtCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGa < 1:4058914/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt < 1:3691772/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt < 1:910643/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt > 1:5652804/1‑101 (MQ=255) gtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATg > 1:11227920/3‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:1993287/101‑1 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg > 1:3498747/1‑101 (MQ=255) ccAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGc < 1:12864782/101‑1 (MQ=255) cAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg < 1:2789889/101‑1 (MQ=255) cAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCC‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg < 1:5626359/101‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGGCGATGGGCCGCGCCATCGCCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg < 1:11156484/101‑1 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt < 1:5006467/101‑1 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc > 1:604248/1‑100 (MQ=255) gCGTGTGGCGATGGGCCGCGAGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTc < 1:14172705/101‑1 (MQ=255) ggtgtGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCt < 1:7451742/100‑1 (MQ=255) cgcgtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCGCGATGCgcac > 1:11603268/4‑98 (MQ=255) cGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCt < 1:8007601/101‑1 (MQ=255) gtgtGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCtt < 1:12958304/101‑1 (MQ=255) gtgtGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCtt > 1:2928651/1‑101 (MQ=255) tgtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTACCCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTg < 1:6715441/101‑1 (MQ=255) cgtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGA‑CCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccg > 1:7244164/2‑96 (MQ=255) tgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGNGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGaa < 1:10348103/101‑1 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc < 1:6204681/101‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACt < 1:5683777/101‑1 (MQ=255) cGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTg < 1:12496965/101‑1 (MQ=255) gATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGc > 1:6078960/1‑101 (MQ=255) gATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGc > 1:9719443/1‑101 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa > 1:7581232/1‑101 (MQ=255) ccGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGt < 1:9470785/101‑1 (MQ=255) ccGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGt > 1:3133388/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:6820329/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:13629003/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:937739/1‑101 (MQ=255) gcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTg > 1:3768470/1‑101 (MQ=255) cgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc > 1:3522079/1‑101 (MQ=255) cgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc < 1:13210247/101‑1 (MQ=255) cgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc > 1:7844188/1‑101 (MQ=255) gcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCa > 1:2355343/1‑101 (MQ=255) gcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCa > 1:4889149/1‑101 (MQ=255) gATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAcc > 1:11912898/1‑101 (MQ=255) aTTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCg > 1:5222049/1‑101 (MQ=255) gtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCg < 1:6397845/101‑1 (MQ=255) gtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCg < 1:8716835/101‑1 (MQ=255) tgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGc > 1:5391212/1‑101 (MQ=255) gcg‑cGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGcc < 1:7043084/101‑1 (MQ=255) cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGa < 1:9904612/101‑1 (MQ=255) gATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaa > 1:12669013/1‑101 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa > 1:12763964/1‑101 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa < 1:6782516/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa < 1:11830668/101‑1 (MQ=255) tCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaaa > 1:12379761/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGCCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaaa > 1:14075487/1‑101 (MQ=255) ccGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAAc < 1:13452571/101‑1 (MQ=255) gcggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGAc < 1:13666224/101‑1 (MQ=255) gcgaTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGAc < 1:10134835/101‑1 (MQ=255) ggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACtt < 1:1884374/101‑1 (MQ=255) tgtTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCa > 1:12070899/1‑101 (MQ=255) cTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTa < 1:10079643/101‑1 (MQ=255) gatgaGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTAc < 1:2800261/101‑1 (MQ=255) atgaGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACt > 1:8565126/1‑101 (MQ=255) atgaGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACt < 1:2206298/101‑1 (MQ=255) gaGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCa < 1:11055338/101‑1 (MQ=255) aGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCAc < 1:12300337/101‑1 (MQ=255) aGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCAc > 1:2999713/1‑101 (MQ=255) gCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACg < 1:1286985/101‑1 (MQ=255) gCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACg < 1:13510/101‑1 (MQ=255) gCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACg < 1:9070475/101‑1 (MQ=255) gCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACg < 1:217648/101‑1 (MQ=255) ccGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGa < 1:10387432/101‑1 (MQ=255) ccGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGa > 1:10037631/1‑101 (MQ=255) tctAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGt < 1:14099299/101‑1 (MQ=255) aacTCGATGCGAAGCTGCGCGTGCAGGTGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGaa < 1:9214042/99‑1 (MQ=255) aCCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGaa > 1:7228813/1‑101 (MQ=255) ccTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAg < 1:172809/101‑1 (MQ=255) cTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGc < 1:8126564/101‑1 (MQ=255) cTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGc > 1:1400650/1‑101 (MQ=255) cTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGc > 1:11936660/1‑101 (MQ=255) cTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGc > 1:2027902/1‑101 (MQ=255) | CGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGCGA > NC_007779/4051629‑4051829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |