| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,166,169 | T→C | 5.6% | L102L (CTT→CTC) | rpsL → | 30S ribosomal protein S12 |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,166,169 | 0 | T→C | 5.6% | 28.3 ‑1.3 ‑0.0 | 251 | L102L (CTT→CTC) | rpsL | 30S ribosomal protein S12 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/6): ref base (100/137): total (108/143) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.83e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.83e-01 | ||||||||||
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
GTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTT > NC_007779/4166069‑4166269 | gAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTGCGTGGTGCGCTTGa > 1:10067485/1‑101 (MQ=255) gAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGa > 1:974482/1‑101 (MQ=255) gAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGa < 1:236227/101‑1 (MQ=255) ggTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTg > 1:11773974/1‑101 (MQ=255) gTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGc < 1:2813478/101‑1 (MQ=255) ccacaACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGAcaccc > 1:10906169/2‑97 (MQ=255) acaACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTcc > 1:12218628/1‑101 (MQ=255) caACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCg > 1:13043688/1‑101 (MQ=255) aaCCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCgg < 1:14110234/101‑1 (MQ=255) aaCCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCgg < 1:6715029/101‑1 (MQ=255) aCCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGc > 1:2941991/1‑101 (MQ=255) ccTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCTCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCg > 1:8544402/1‑101 (MQ=255) tGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGtt > 1:2234274/1‑101 (MQ=255) aGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGAc > 1:5563613/1‑101 (MQ=255) cACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCCGGTGTTCGTTACCACGCCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCg < 1:3885738/101‑1 (MQ=255) aCTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGt > 1:5243182/1‑101 (MQ=255) ccGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAg < 1:10769071/101‑1 (MQ=255) ccGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAg < 1:1571203/101‑1 (MQ=255) cGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGc < 1:6275580/101‑1 (MQ=255) cGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGc > 1:8451549/1‑101 (MQ=255) cGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGc > 1:8704119/1‑101 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa < 1:513696/101‑1 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa > 1:3932966/1‑101 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa > 1:1450027/1‑101 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa < 1:9912499/101‑1 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa > 1:10256207/1‑101 (MQ=255) atcctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGCGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGc > 1:7222296/1‑101 (MQ=255) cctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTc < 1:10932672/101‑1 (MQ=255) cctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTc < 1:11228264/101‑1 (MQ=255) tgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGt < 1:1355943/101‑1 (MQ=255) tgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGt < 1:2419393/101‑1 (MQ=255) gatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGtt < 1:13947199/101‑1 (MQ=255) atccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTc > 1:5280036/1‑101 (MQ=255) cggggCGGTCTTGTT‑AAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAg < 1:12741450/98‑1 (MQ=255) cgcggtggTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGACACCCAGGGTGTCAAGGACCGCAAGCAGGCTCGTTcccg > 1:9183841/7‑99 (MQ=255) tGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGt > 1:4473479/1‑101 (MQ=255) cGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATg > 1:7583230/1‑101 (MQ=255) gTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGACACCCAGGGTGTCAAGGACCGCAAGCAGGCTCGTTcccgctacggc < 1:8191628/101‑10 (MQ=255) gTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGc > 1:13856288/1‑101 (MQ=255) tCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCg < 1:1986181/101‑1 (MQ=255) gtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGaa < 1:14216091/101‑1 (MQ=255) gtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGaa < 1:12116979/101‑1 (MQ=255) ttAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAg < 1:8007515/101‑1 (MQ=255) aaaGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCg < 1:8135758/101‑1 (MQ=255) aaGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGt > 1:13277661/1‑101 (MQ=255) aGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTc < 1:7555676/101‑1 (MQ=255) aGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTc > 1:14023724/1‑101 (MQ=255) aCCTCCCGTGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCt > 1:1155652/1‑101 (MQ=255) aCCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCt < 1:11821454/101‑1 (MQ=255) aCCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCt > 1:259961/1‑101 (MQ=255) aCCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCt < 1:12826817/101‑1 (MQ=255) ccTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTa < 1:1808889/101‑1 (MQ=255) tCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAg < 1:9142144/101‑1 (MQ=255) tCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAg < 1:9000677/101‑1 (MQ=255) cGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCt > 1:12040669/1‑101 (MQ=255) gggTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCtt > 1:932974/1‑101 (MQ=255) ggTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTa < 1:5693280/101‑1 (MQ=255) gtgtTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTaa < 1:9455588/101‑1 (MQ=255) ttCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATgg < 1:5484602/101‑1 (MQ=255) ttCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATgg > 1:4583280/1‑101 (MQ=255) ttCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATgg > 1:14238329/1‑101 (MQ=255) tCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGt < 1:11000069/101‑1 (MQ=255) tCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGt > 1:1316789/1‑101 (MQ=255) cGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGtt < 1:7833885/101‑1 (MQ=255) tACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTtctc < 1:9665667/101‑1 (MQ=255) aCCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTcc < 1:9393596/101‑1 (MQ=255) aCCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTcc < 1:6151316/101‑1 (MQ=255) ccACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCg < 1:3595029/101‑1 (MQ=255) ccACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCg < 1:13494030/101‑1 (MQ=255) acacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGtt < 1:9097578/101‑1 (MQ=255) acacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGtt < 1:14007823/101‑1 (MQ=255) cacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTta < 1:1687182/101‑1 (MQ=255) cacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTta > 1:7360816/1‑101 (MQ=255) cacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTta < 1:13570464/101‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaag < 1:11267681/101‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaag > 1:5371993/1‑101 (MQ=255) cGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagt < 1:13771273/101‑1 (MQ=255) gTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagta > 1:2166906/1‑101 (MQ=255) tACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaa > 1:6508543/1‑101 (MQ=255) tACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaa > 1:9277062/1‑101 (MQ=255) tACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaa > 1:5008414/1‑101 (MQ=255) tACGTGGTGCGCTTGACTGCTACGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaa < 1:6729927/101‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag > 1:8978206/1‑101 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag > 1:5861864/1‑101 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag > 1:5876158/1‑101 (MQ=255) cGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAgg < 1:7004530/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAgg < 1:4398181/101‑1 (MQ=255) gtggtgCGCTTTACTGCTCCGGCGTTAAAAGCCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGc < 1:4785294/101‑1 (MQ=255) gtggtgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGc > 1:3781039/1‑101 (MQ=255) gtggtgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGc < 1:10470951/101‑1 (MQ=255) tgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCaaa < 1:4050795/101‑1 (MQ=255) cgcTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACg > 1:4318274/1‑101 (MQ=255) gcTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGt < 1:3185867/101‑1 (MQ=255) ttGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGttt < 1:9488751/101‑1 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt > 1:5977181/1‑101 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt < 1:3644982/101‑1 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt < 1:12409089/101‑1 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt > 1:6216678/1‑101 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt < 1:10574530/101‑1 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt < 1:10003448/101‑1 (MQ=255) | GTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTT > NC_007779/4166069‑4166269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |