| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,166,184 | T→C | 2.3% | V107V (GTT→GTC) | rpsL → | 30S ribosomal protein S12 |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,166,184 | 0 | T→C | 2.3% | 7.4 ‑0.4 ‑0.4 | 258 | V107V (GTT→GTC) | rpsL | 30S ribosomal protein S12 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/3): ref base (105/147): total (108/150) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.97e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.37e-01 | ||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
TGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCAAA > NC_007779/4166084‑4166284 | tGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGtt > 1:2234274/1‑101 (MQ=255)tGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGtt < 1:6237145/101‑1 (MQ=255) gCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTa < 1:13996580/101‑1 (MQ=255) aGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTaaa > 1:8560288/1‑101 (MQ=255) aGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTaaa < 1:13839801/101‑1 (MQ=255) aGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGAc > 1:5563613/1‑101 (MQ=255) gCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGCCCTCCCGGGTGTTGGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGAcc < 1:3932338/101‑1 (MQ=255) aCTGCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGt < 1:10143319/101‑1 (MQ=255) aCTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGt > 1:6722531/1‑101 (MQ=255) aCTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGt > 1:14079755/1‑101 (MQ=255) tCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTaa < 1:2894182/101‑1 (MQ=255) ccGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAg < 1:1571203/101‑1 (MQ=255) catgatcctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGc > 1:8704120/3‑101 (MQ=255) cGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGc > 1:4376801/1‑101 (MQ=255) cGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGc > 1:141508/1‑101 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa > 1:4188378/1‑101 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa > 1:1450027/1‑101 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa > 1:12063957/1‑101 (MQ=255) atcctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGCGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGc > 1:7222296/1‑101 (MQ=255) gatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGtt < 1:7361795/101‑1 (MQ=255) gatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGtt < 1:13947199/101‑1 (MQ=255) gatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGtt < 1:5746701/101‑1 (MQ=255) tccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTcc < 1:126036/101‑1 (MQ=255) ccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCa > 1:6208932/1‑101 (MQ=255) cgcggtggTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGACACCCAGGGTGTCAAGGACCGCAAGCAGGCTCGTTcccg > 1:9183841/7‑99 (MQ=255) gcggtggTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGACACCCAGGGTGTCAAGGACCGCAAGCAGGCTCGTTcccgc < 1:134600/96‑4 (MQ=255) gcggtggTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGACACCCAGGGTGTCAAGGACCGCAAGCAGGCTCGTTcccgc < 1:9097746/96‑4 (MQ=255) tGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGt > 1:1813736/1‑101 (MQ=255) tGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGt > 1:4473479/1‑101 (MQ=255) cGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATg < 1:3882334/101‑1 (MQ=255) ggTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATgg > 1:2432933/1‑101 (MQ=255) gTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGACACCCAGGGTGTCAAGGACCGCAAGCAGGCTCGTTcccgctacggc < 1:8191628/101‑10 (MQ=255) cGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGt > 1:13559452/1‑101 (MQ=255) tgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGa > 1:14008457/1‑101 (MQ=255) tgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGa > 1:1212258/1‑101 (MQ=255) tgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGa > 1:2106111/1‑101 (MQ=255) ttAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAg > 1:10723876/1‑101 (MQ=255) aaGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGt > 1:13277661/1‑101 (MQ=255) aGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTc < 1:7555676/101‑1 (MQ=255) aCCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCt < 1:12826817/101‑1 (MQ=255) ccTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTa < 1:10906885/101‑1 (MQ=255) tCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAg < 1:9142144/101‑1 (MQ=255) tCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAg < 1:2705756/101‑1 (MQ=255) gggTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCtt > 1:932974/1‑101 (MQ=255) ggTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTa < 1:5693280/101‑1 (MQ=255) gtgtTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTaa > 1:2400976/1‑101 (MQ=255) gtgtTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTaa < 1:9455588/101‑1 (MQ=255) gtTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATg > 1:372055/1‑101 (MQ=255) ttCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATgg < 1:5484602/101‑1 (MQ=255) ttCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATgg > 1:4583280/1‑101 (MQ=255) cGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGtt > 1:3643683/1‑101 (MQ=255) aCCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTcc < 1:1612277/101‑1 (MQ=255) ccgcacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCg < 1:4331028/98‑1 (MQ=255) ccACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCg > 1:10392874/1‑101 (MQ=255) ccACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCg < 1:13494030/101‑1 (MQ=255) acacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGtt < 1:3988465/101‑1 (MQ=255) acacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGtt > 1:11392459/1‑101 (MQ=255) cacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTta < 1:6887285/101‑1 (MQ=255) cacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTta < 1:1687182/101‑1 (MQ=255) acCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaa < 1:9033490/101‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaag > 1:4643305/1‑101 (MQ=255) ccGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaag > 1:5371993/1‑101 (MQ=255) ccGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaag < 1:13703578/101‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaag < 1:11267681/101‑1 (MQ=255) gTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagta < 1:14231335/101‑1 (MQ=255) gTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagta < 1:1198242/101‑1 (MQ=255) tACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaa > 1:6508543/1‑101 (MQ=255) tACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaa > 1:9277062/1‑101 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag < 1:9678169/101‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag < 1:9410962/101‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag > 1:5876158/1‑101 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag > 1:8978206/1‑101 (MQ=255) gcgcTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAAc < 1:11079322/101‑1 (MQ=255) gcTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGt < 1:3185867/101‑1 (MQ=255) ttGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGttt < 1:13140149/101‑1 (MQ=255) ttGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGttt > 1:5273381/1‑101 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt < 1:10003448/101‑1 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt > 1:5977181/1‑101 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt < 1:10574530/101‑1 (MQ=255) gACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTa < 1:11827250/101‑1 (MQ=255) gACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTa > 1:5126207/1‑101 (MQ=255) gACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTa > 1:8293554/1‑101 (MQ=255) aCTGCTCCGGCGTTACAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTaa < 1:9772019/101‑1 (MQ=255) aCTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTaa < 1:2198940/101‑1 (MQ=255) aCTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTaa < 1:3491309/101‑1 (MQ=255) gCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACtt > 1:6281159/1‑101 (MQ=255) cTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTa > 1:7909858/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTaa < 1:4849634/101‑1 (MQ=255) ccGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTaaa < 1:12344159/101‑1 (MQ=255) ccGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTaaa < 1:11813515/101‑1 (MQ=255) cGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAAt < 1:12884516/101‑1 (MQ=255) gCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGt < 1:8143668/101‑1 (MQ=255) cGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTc > 1:10771226/1‑101 (MQ=255) gTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCa > 1:5228255/1‑101 (MQ=255) gTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCa > 1:8081778/1‑101 (MQ=255) ttAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaa < 1:7579658/101‑1 (MQ=255) tAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaa > 1:14240012/1‑101 (MQ=255) tAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaa > 1:7731032/1‑101 (MQ=255) tAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaa > 1:9528306/1‑101 (MQ=255) tAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaa < 1:6758827/101‑1 (MQ=255) | TGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCAAA > NC_007779/4166084‑4166284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |