| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,169,458 | T→C | 31.7% | R124R (CGT→CGC) | tufA → | protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,169,458 | 0 | T→C | 31.7% | 73.8 ‑0.2 ‑1.2 | 79 | R124R (CGT→CGC) | tufA | protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (11/14): ref base (26/28): total (37/42) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.11e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.77e-02 | ||||||||||
ACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCATCGTGTTCCTGAACAAATGCGACATGGTTGATGACGAAGAGCTGCTGGAACTGGTTGAAATGGAAGTTCGTGAA > NC_007779/4169358‑4169554 | aCATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcgt < 1:5466689/101‑1 (MQ=32) cATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcgtc < 1:2188465/101‑1 (MQ=32) cATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcgtc > 1:40109/1‑101 (MQ=33) cATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcgtc > 1:10926669/1‑101 (MQ=33) aTGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCa < 1:10494075/101‑1 (MQ=32) aTGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCa < 1:8524219/101‑1 (MQ=32) aTGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCa < 1:7068563/101‑1 (MQ=32) tGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAg > 1:41204/1‑101 (MQ=33) tGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAg > 1:11746481/1‑101 (MQ=33) gATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAgg < 1:12737544/101‑1 (MQ=2) gATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAgg < 1:2221448/101‑1 (MQ=32) gATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAgg > 1:919704/1‑101 (MQ=33) gATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAgg < 1:14195560/101‑1 (MQ=32) gATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAgg < 1:8668648/101‑1 (MQ=32) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt < 1:1432640/101‑1 (MQ=32) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt < 1:1326020/101‑1 (MQ=32) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt > 1:2737618/1‑101 (MQ=33) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt < 1:1199863/101‑1 (MQ=32) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt < 1:8945074/101‑1 (MQ=32) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGGAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGGGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt > 1:9716908/1‑101 (MQ=12) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGtt < 1:11814090/101‑2 (MQ=2) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGtt > 1:4817789/1‑100 (MQ=2) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa > 1:3085047/1‑101 (MQ=33) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa < 1:12754577/101‑1 (MQ=32) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa < 1:14066088/101‑1 (MQ=32) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa < 1:2233593/101‑1 (MQ=32) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa > 1:2181152/1‑101 (MQ=33) cACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGttg < 1:2299828/101‑3 (MQ=2) cACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGttg < 1:2063519/101‑3 (MQ=2) cACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCTACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAg < 1:8952133/101‑1 (MQ=17) aCCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTgg < 1:33805/101‑1 (MQ=2) aCCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTgg > 1:4833652/1‑101 (MQ=2) aCCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAgg > 1:327106/1‑101 (MQ=32) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGc > 1:8926617/1‑101 (MQ=2) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGc > 1:2447443/1‑101 (MQ=2) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGc < 1:3959282/101‑1 (MQ=32) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGc > 1:14107766/1‑101 (MQ=32) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGc > 1:8298289/1‑101 (MQ=32) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGc < 1:8450876/101‑1 (MQ=32) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGGCGTCAGGTAGGc > 1:9737816/1‑101 (MQ=17) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCg > 1:9172639/1‑101 (MQ=2) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCg < 1:10995534/101‑1 (MQ=2) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCg > 1:4614922/1‑101 (MQ=2) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCCGGTAGGCg > 1:2831546/1‑101 (MQ=17) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCg > 1:10260803/1‑101 (MQ=32) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCATGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCg > 1:4521982/1‑101 (MQ=17) ggTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGt < 1:2675773/101‑1 (MQ=2) gTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGtt < 1:8110355/101‑1 (MQ=32) tgctgcTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTc > 1:7237040/1‑101 (MQ=32) tgctgcTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTc > 1:12024916/1‑101 (MQ=32) gctgctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTcc < 1:13138711/101‑1 (MQ=2) gctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTcc < 1:8981227/101‑1 (MQ=32) gctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTcc > 1:8061688/1‑101 (MQ=32) ctgctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCg < 1:2379285/101‑1 (MQ=2) ctgctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCg > 1:8213229/1‑101 (MQ=2) ctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCg > 1:1995085/1‑101 (MQ=32) ctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCg > 1:3574240/1‑101 (MQ=32) ctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCg < 1:8705390/101‑1 (MQ=32) ctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCg > 1:8702097/1‑101 (MQ=32) ctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTAGTCAGGTAGGCGTTCCg < 1:5174927/101‑1 (MQ=17) tgctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGt > 1:12061116/1‑101 (MQ=2) tgctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGt > 1:5322701/1‑101 (MQ=2) tgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGt < 1:1321916/101‑1 (MQ=32) tgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGt > 1:670789/1‑101 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTa < 1:10405656/101‑1 (MQ=2) gctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTa < 1:169788/101‑1 (MQ=2) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa > 1:9398760/1‑101 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa > 1:2636629/1‑101 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa < 1:4070198/101‑1 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa < 1:13674704/101‑1 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa > 1:5965686/1‑101 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa < 1:168011/101‑1 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa < 1:5210701/101‑1 (MQ=32) ctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTAc > 1:6454384/1‑101 (MQ=2) ctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTAc > 1:10703814/1‑101 (MQ=2) ctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTAc > 1:4253240/1‑101 (MQ=31) ctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTAc > 1:1664445/1‑101 (MQ=31) ctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTAc < 1:4881252/101‑1 (MQ=31) ctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTAc < 1:5978489/101‑1 (MQ=31) ctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTAc > 1:758175/1‑101 (MQ=31) tCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTGCGTAca > 1:14171870/1‑101 (MQ=2) tCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTAca < 1:12342206/101‑1 (MQ=2) tCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTAca > 1:5372838/1‑101 (MQ=11) tCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTAca < 1:10375238/101‑1 (MQ=11) tGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTACATCCTCGTTGCACTGAACaag < 1:1893714/101‑2 (MQ=0) tGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTACATCCTCGTTGCACTGAACaag < 1:3744302/101‑2 (MQ=0) ctcgccAGGTTGGCGTTCCGTACATCCTCGTTGCACTGAACAAGTGCGACATGGTTGACGATGAAGAGATCATCGAACTCGTCGAGATGGAGATTCGCGag < 1:4254487/100‑2 (MQ=0) | ACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCATCGTGTTCCTGAACAAATGCGACATGGTTGATGACGAAGAGCTGCTGGAACTGGTTGAAATGGAAGTTCGTGAA > NC_007779/4169358‑4169554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |