| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 2071081 = | NA (NA) | 6 (0.030) | 6/174 | NT | 2.7% | intergenic (‑1623/+8) | insH/insD | IS5 transposase and trans‑activator/IS2 insertion element transposase InsAB' |
| ? | NC_007779 | = 2072412 | 224 (1.040) | coding (32/261 nt) | yoeE | disrupted hemin or colicin receptor | |||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
AATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCT > NC_007779/2072312‑2072512 | aatcaTCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGG > 1:1706560‑M2/1‑101 (MQ=255)aatcaTCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGG > 1:4079126‑M2/1‑101 (MQ=255) tcatcTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCg > 1:13591617/1‑101 (MQ=33) tcatcTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCg < 1:12960251/101‑1 (MQ=33) atcTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATAATGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGaa < 1:9062269/101‑1 (MQ=25) cTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGc < 1:6948791/101‑1 (MQ=38) tcCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCAtcctc > 1:738058/1‑101 (MQ=255) ccAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCAtcctcc < 1:13969138/101‑1 (MQ=255) cAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTccc > 1:3179906/1‑101 (MQ=255) aaTGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCg < 1:1282820/101‑1 (MQ=255) aTGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCgt < 1:11953039/101‑1 (MQ=255) gACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCGGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCgtgt < 1:3795175/101‑1 (MQ=255) gACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCgtgt > 1:4416842/1‑101 (MQ=255) cTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGttt < 1:8322010/101‑1 (MQ=255) tAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGtttt < 1:11054970/101‑1 (MQ=255) aGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTa < 1:2716467/101‑1 (MQ=255) aGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTa > 1:7620123/1‑101 (MQ=255) aGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTa < 1:4594190/101‑1 (MQ=255) tAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATtc > 1:5275801/1‑101 (MQ=255) aaaaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATtct < 1:5439501/101‑1 (MQ=255) aaaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATtctc > 1:2204227/1‑101 (MQ=255) aaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCa > 1:5766695/1‑101 (MQ=255) aaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCa < 1:5100839/101‑1 (MQ=255) aaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCa > 1:628783/1‑101 (MQ=255) aaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCAt > 1:1384691/1‑101 (MQ=255) aaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGCGTTTTAATTCTCAt < 1:14170590/101‑1 (MQ=255) aCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCAtt < 1:4847941/101‑1 (MQ=255) aCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCAtt > 1:2988900/1‑101 (MQ=255) aGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGAt > 1:1176920/1‑101 (MQ=255) gTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATg < 1:11334923/101‑1 (MQ=255) tATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATgg > 1:9690189/1‑101 (MQ=255) aTTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGt > 1:5880779/1‑101 (MQ=255) tAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCa < 1:13137114/101‑1 (MQ=255) aGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCagg > 1:7538341/1‑101 (MQ=255) gACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCagga < 1:11736457/101‑1 (MQ=255) aCTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCaggag > 1:187675/1‑101 (MQ=255) aCTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCaggag > 1:2159682/1‑101 (MQ=255) cTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCaggagg > 1:10820039/1‑101 (MQ=255) tATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGt > 1:10243287/1‑101 (MQ=255) cTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACtt < 1:7697903/101‑1 (MQ=255) ttATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTa > 1:5499324/1‑101 (MQ=255) ttATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTa > 1:11886535/1‑101 (MQ=255) tATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTAt > 1:11560211/1‑101 (MQ=255) aTTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATc > 1:14052048/1‑101 (MQ=255) aTTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGGAACTTATc > 1:9563016/1‑101 (MQ=255) tttAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCa < 1:4776473/101‑1 (MQ=255) tttAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCa < 1:3754551/101‑1 (MQ=255) tttAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCa > 1:10500666/1‑101 (MQ=255) 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ggTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGAt < 1:8890164/101‑1 (MQ=255) ggTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGAt < 1:12655777/101‑1 (MQ=255) gTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAAtt > 1:1805822/1‑101 (MQ=255) tCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTa < 1:3864266/101‑1 (MQ=255) tCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTa > 1:8299016/1‑101 (MQ=255) cTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTAt > 1:6778116/1‑101 (MQ=255) agaTTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGgtg < 1:2495240/101‑1 (MQ=255) 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gatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcg < 1:6863224‑M2/101‑101 (MQ=255) gatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcg > 1:10700990‑M2/1‑1 (MQ=255) gatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcg > 1:10025402‑M2/1‑1 (MQ=255) | AATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAG‑TGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCT > NC_007779/2072312‑2072512 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |