| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 725,827 | C→T | 12.7% | E544E (GAG→GAA) | kdpB ← | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 725,827 | 0 | C→T | 12.7% | 66.9 ‑6.3 ‑0.0 | 220 | E544E (GAG→GAA) | kdpB | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/20): ref base (117/75): total (125/95) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.82e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.99e-01 | ||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
AGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAC > NC_007779/725727‑725927 | ggtggtCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCct < 1:5137999/101‑1 (MQ=255) gtggtCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCctc < 1:13819308/101‑1 (MQ=255) gtCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCttt < 1:1805527/101‑1 (MQ=255) tCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTc < 1:14003363/101‑1 (MQ=255) tCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTc < 1:11700156/101‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcg > 1:3895965/1‑101 (MQ=255) aGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCCCCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgc < 1:14126847/101‑1 (MQ=255) aGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgc > 1:6219550/1‑101 (MQ=255) aGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgc > 1:4977284/1‑101 (MQ=255) aGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgc > 1:7135416/1‑101 (MQ=255) aGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCgccgcc > 1:8360527/1‑101 (MQ=255) gCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCt < 1:4627975/101‑1 (MQ=255) ccACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTg < 1:7816336/101‑1 (MQ=255) tatcaGGATCTGTTTGCCAATGTGCCCCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGCCGAGATCGCCCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCgg < 1:3100687/100‑1 (MQ=255) atcaGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGa > 1:7612433/1‑101 (MQ=255) atcaGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGa > 1:7186630/1‑101 (MQ=255) tcaGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAg > 1:87847/1‑101 (MQ=255) caGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGt > 1:1063418/1‑101 (MQ=255) caGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGt < 1:2461367/101‑1 (MQ=255) aGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGtt > 1:3542515/1‑101 (MQ=255) gCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTc < 1:8912375/101‑1 (MQ=255) cATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGTTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCa > 1:9473646/1‑101 (MQ=255) cATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCa > 1:7014113/1‑101 (MQ=255) cATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCa < 1:6173350/101‑1 (MQ=255) tCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATc > 1:13124963/1‑101 (MQ=255) tCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATc < 1:5495899/101‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCg > 1:10594284/1‑101 (MQ=255) cTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCg < 1:14317062/101‑1 (MQ=255) tGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGc > 1:12009033/1‑101 (MQ=255) tGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGc < 1:7804373/101‑1 (MQ=255) tttGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCa > 1:3240215/1‑101 (MQ=255) tGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCAcc > 1:5348952/1‑101 (MQ=255) gCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGACGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACcg > 1:12609526/1‑101 (MQ=255) cAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACcgcg > 1:11381998/1‑101 (MQ=255) cAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACcgcg > 1:1440616/1‑101 (MQ=255) aTGTGCCCCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGAc < 1:5386829/101‑1 (MQ=255) aTGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGAc > 1:6435328/1‑101 (MQ=255) tgtgCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACa < 1:9118489/101‑1 (MQ=255) gtgCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACAt > 1:1870538/1‑101 (MQ=255) gtgCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACAt < 1:12740056/101‑1 (MQ=255) tgCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATc > 1:7413558/1‑101 (MQ=255) tgCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATc > 1:5238949/1‑101 (MQ=255) caccacCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctg > 1:10256594/1‑101 (MQ=255) ccaccTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcc > 1:2037478/1‑101 (MQ=255) ccTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGCCCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcctgc < 1:57182/101‑1 (MQ=255) ccTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcctgc > 1:925100/1‑101 (MQ=255) cTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTgcg > 1:13010590/1‑101 (MQ=255) gATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCa > 1:6270709/1‑101 (MQ=255) aTCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAg > 1:2919762/1‑101 (MQ=255) aTCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAg > 1:767411/1‑101 (MQ=255) tCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAgc > 1:214283/1‑101 (MQ=255) gagcTTGGTCGGATCCGAATCCAGGTCCACCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCaatg < 1:4507775/98‑4 (MQ=255) cAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAgcg > 1:13594606/1‑101 (MQ=255) cAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAgcg < 1:13043884/101‑1 (MQ=255) tttGGTCGGGTTGGAGAAGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCg < 1:9873033/100‑1 (MQ=255) ttGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCgg > 1:1605233/1‑101 (MQ=255) tGGTCGGATCCGAATCCAGGTCCACCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCggt < 1:7556966/101‑2 (MQ=255) tGGTCGGATCCGAATCCAGGTCCACCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCggt < 1:5841318/101‑2 (MQ=255) ggTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAg > 1:11568204/1‑101 (MQ=255) tCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTAGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGct > 1:1349195/1‑100 (MQ=255) cGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCAt < 1:9012197/101‑1 (MQ=255) cGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCAt < 1:5899156/101‑1 (MQ=255) cGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCAt < 1:10416695/101‑1 (MQ=255) gggTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATc < 1:11525021/101‑1 (MQ=255) gTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGt > 1:2279171/1‑101 (MQ=255) ttAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGtt > 1:10863783/1‑101 (MQ=255) ttAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGtt > 1:5059749/1‑101 (MQ=255) ttAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGtt > 1:4325021/1‑101 (MQ=255) tAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTg > 1:6019639/1‑101 (MQ=255) agagTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTgg > 1:520183/1‑101 (MQ=255) agagCCGAGATCATCATTATTGCCCGCCTCTTTCGCCGGCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCGCCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTgg < 1:12439693/101‑1 (MQ=255) agTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTg < 1:12909636/101‑1 (MQ=255) tCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGcc > 1:8267623/1‑101 (MQ=255) cGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCg > 1:3487395/1‑101 (MQ=255) cGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCg > 1:3684571/1‑101 (MQ=255) agaTCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTc < 1:11833442/101‑1 (MQ=255) 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gCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTa < 1:13249948/101‑1 (MQ=255) cccGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTAc < 1:4679391/101‑1 (MQ=255) ccGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGAcc < 1:6925075/101‑1 (MQ=255) ccGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGAcc < 1:6504661/101‑1 (MQ=255) ccGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTAcc > 1:6994329/1‑101 (MQ=255) ccGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTAcc > 1:2417361/1‑101 (MQ=255) cGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCa < 1:8576025/101‑1 (MQ=255) cGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCa < 1:5668771/101‑1 (MQ=255) gCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCaa < 1:2160298/101‑1 (MQ=255) ccTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCaaa < 1:6854307/101‑1 (MQ=255) | AGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAC > NC_007779/725727‑725927 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |