| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 725,890 | A→T | 16.3% | A523A (GCT→GCA) | kdpB ← | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 725,890 | 0 | A→T | 16.3% | 123.3 ‑3.2 ‑2.8 | 250 | A523A (GCT→GCA) | kdpB | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (16/25): ref base (120/89): total (136/114) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.92e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.66e-03 | ||||||||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
TGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAA > NC_007779/725790‑725990 | tGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGa > 1:6944332/1‑101 (MQ=255)tGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGa < 1:1672749/101‑1 (MQ=255) tCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTAGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGct > 1:1349195/1‑100 (MQ=255) cGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCAt > 1:10514171/1‑101 (MQ=255) gggTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATc > 1:796050/1‑101 (MQ=255) gggTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATc > 1:11972063/1‑101 (MQ=255) gggTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATc < 1:11525021/101‑1 (MQ=255) ttAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGtt > 1:5059749/1‑101 (MQ=255) ttAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGtt > 1:10863783/1‑101 (MQ=255) tAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTg > 1:6019639/1‑101 (MQ=255) agagTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTgg > 1:8957862/1‑101 (MQ=255) agTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTg < 1:12909636/101‑1 (MQ=255) agTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTg > 1:12394040/1‑101 (MQ=255) agTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTg > 1:4283907/1‑101 (MQ=255) atccaggtccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGc < 1:10633836/91‑1 (MQ=255) tCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGcc > 1:8267623/1‑101 (MQ=255) gagaTCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGt > 1:4751054/1‑101 (MQ=255) aggtccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTc < 1:3597172/95‑1 (MQ=255) aggtccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTc > 1:4642448/7‑101 (MQ=255) agaTCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTc < 1:11833442/101‑1 (MQ=255) gaTCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATTTTCCTGCGCCAGCTCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTct > 1:198165/1‑100 (MQ=255) gaTCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCg < 1:4066260/101‑1 (MQ=255) gtccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTcac > 1:1432806/5‑99 (MQ=255) tccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCAcc < 1:4335005/98‑1 (MQ=255) tCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGcc < 1:4254018/101‑1 (MQ=255) tCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGcc > 1:2220065/1‑101 (MQ=255) tCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGcc > 1:7648672/1‑101 (MQ=255) ccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCTGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCg > 1:1161477/3‑101 (MQ=255) aCCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGt > 1:5397192/1‑101 (MQ=255) ccATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTc > 1:9732043/1‑101 (MQ=255) cATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCa > 1:5109650/1‑101 (MQ=255) atatTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCAt > 1:5696153/1‑101 (MQ=255) tatTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATc > 1:10312538/1‑101 (MQ=255) gttGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCAtgg < 1:7460265/100‑3 (MQ=255) ttGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGc < 1:3823951/101‑1 (MQ=255) ttGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGc < 1:5787887/101‑1 (MQ=255) ttGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGc < 1:12457872/101‑1 (MQ=255) tGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCt > 1:10418522/1‑101 (MQ=255) gCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTa < 1:13249948/101‑1 (MQ=255) gCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCACGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTa < 1:914638/101‑1 (MQ=255) ccGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGAcc < 1:6504661/101‑1 (MQ=255) ccGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTAcc > 1:2417361/1‑101 (MQ=255) ccGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTAcc > 1:6994329/1‑101 (MQ=255) ccGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTAcc > 1:6999663/1‑101 (MQ=255) cGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCa < 1:11706943/101‑1 (MQ=255) gcttccttCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCag < 1:6884811/95‑2 (MQ=255) gCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCCGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGCCCCCGGTCATCGCTACCaa > 1:5638370/1‑101 (MQ=255) ccTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCaaa < 1:6854307/101‑1 (MQ=255) ttccttCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCaggc < 1:5246730/97‑4 (MQ=255) ctctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAc < 1:7809889/101‑1 (MQ=255) tctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACg > 1:12061849/1‑101 (MQ=255) tttCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAc < 1:12703037/101‑1 (MQ=255) gccgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTc > 1:10542510/1‑101 (MQ=255) ccgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTcc > 1:7492039/1‑101 (MQ=255) ccgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTcc < 1:12562654/101‑1 (MQ=255) cgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCg > 1:11394589/1‑101 (MQ=255) cgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCg > 1:8644098/1‑101 (MQ=255) cgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCg < 1:9301079/101‑1 (MQ=255) gccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGc < 1:3910477/101‑1 (MQ=255) gccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGc > 1:12240422/1‑101 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGcc > 1:3779789/1‑101 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGcc > 1:2141812/1‑101 (MQ=255) cTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCt > 1:13800772/1‑101 (MQ=255) cTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCt > 1:4718567/1‑101 (MQ=255) cTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCt > 1:9559715/1‑101 (MQ=255) gCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACt > 1:309112/1‑101 (MQ=255) cGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGa < 1:11072021/101‑1 (MQ=255) cGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGa > 1:6722232/1‑101 (MQ=255) ggAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGAc > 1:2549103/1‑101 (MQ=255) 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aTCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCttctgct > 1:98966/1‑96 (MQ=255) tCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTc < 1:5615659/101‑1 (MQ=255) tCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCttctgctc > 1:12970044/1‑95 (MQ=255) tgcctgcGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCg < 1:13651486/101‑1 (MQ=255) tgcGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCTTCTGCTCCGgggt > 1:7671652/1‑101 (MQ=255) tgcGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCTTCTGCTCCGgggt > 1:11932598/1‑101 (MQ=255) gcgcCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCTTCTGCTCCGgggtg < 1:3665848/101‑2 (MQ=255) cgcCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTca < 1:7179015/101‑2 (MQ=255) cgcCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCg > 1:2759738/1‑101 (MQ=255) aatgcCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCTTCTGCTCCGGGGTGGCCTc < 1:11199972/98‑1 (MQ=255) aGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTc < 1:3421935/101‑1 (MQ=255) gcgcCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCg < 1:9764693/101‑1 (MQ=255) cgcCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCgg > 1:10013732/1‑101 (MQ=255) gcCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGc > 1:8801004/1‑101 (MQ=255) ccGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCg < 1:4856931/101‑1 (MQ=255) cGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCTTCTGCTCCGGGGTGGCCTCAGCga > 1:9612987/1‑101 (MQ=255) ggAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCgag > 1:1963395/1‑101 (MQ=255) | TGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAA > NC_007779/725790‑725990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |