| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779 | 13,317 | C→G | 10.9% | D385E (GAC→GAG) | dnaK → | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_007779 | 13,317 | 0 | C→G | 10.9% | 93.6 0.0 0.0 | 303 | D385E (GAC→GAG) | dnaK | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (16/17): ref base (131/139): total (147/156) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
AAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCC > NC_007779/13217‑13417 | aaGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGAc > 1:2271427/1‑101 (MQ=255) cTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaaaa > 1:1337962/1‑101 (MQ=255) tGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAg > 1:11295578/1‑101 (MQ=255) gAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGa < 1:12014313/101‑1 (MQ=255) aGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGAc > 1:5772900/1‑101 (MQ=255) gTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACg < 1:483024/101‑1 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ggTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgct < 1:9214510/101‑1 (MQ=255) ggTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgct > 1:10721985/1‑101 (MQ=255) ggTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGCAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgct > 1:8849916/1‑101 (MQ=255) tAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgc > 1:2849250/1‑101 (MQ=255) tAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgc > 1:11629672/1‑101 (MQ=255) tAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgc > 1:3834192/1‑101 (MQ=255) tAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGCGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgc < 1:7468153/101‑1 (MQ=255) aaaGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgct < 1:9505169/101‑1 (MQ=255) aaaGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgct < 1:1943423/101‑1 (MQ=255) aaGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgctg < 1:10050580/101‑1 (MQ=255) aaGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgctg > 1:11187238/1‑101 (MQ=255) agagCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTgg > 1:5871925/1‑101 (MQ=255) agagCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTACTgg < 1:6951250/101‑1 (MQ=255) gCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACg < 1:6208507/101‑1 (MQ=255) cgcgTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGtt > 1:7747007/1‑101 (MQ=255) cgTAAAGACGTTAACCTGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAc > 1:9032894/1‑101 (MQ=255) aacaagggcGTTAACCCGGACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTAc < 1:12941540/93‑1 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc < 1:6550983/101‑1 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc < 1:4658823/101‑1 (MQ=255) aGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGc > 1:5504404/1‑101 (MQ=255) gACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCt < 1:3171157/101‑1 (MQ=255) 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tGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTa < 1:9903668/101‑1 (MQ=255) cGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATcc > 1:11115837/1‑101 (MQ=255) cGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATcc > 1:7415675/1‑101 (MQ=255) | AAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCC > NC_007779/13217‑13417 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |