Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 13,400 | C→A | 6.1% | A413E (GCG→GAG) | dnaK → | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 13,400 | 0 | C→A | 6.1% | 29.8 ‑0.2 ‑0.1 | 230 | A413E (GCG→GAG) | dnaK | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/6): ref base (113/103): total (121/109) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.88e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.85e-01 |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
GGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAA > NC_007779/13300‑13500 | ggttTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATcgc < 1:2311817/101‑1 (MQ=255) gtgtTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATcgcg < 1:5633682/101‑1 (MQ=255) tgtTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGa < 1:6715313/101‑1 (MQ=255) ttCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGaaa > 1:1369504/1‑101 (MQ=255) aCTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAacac < 1:12568620/101‑1 (MQ=255) cTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAAcacc < 1:13448598/101‑1 (MQ=255) tGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAAcacca < 1:12157651/101‑1 (MQ=255) gTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACt < 1:10748144/101‑1 (MQ=255) tGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTa > 1:14250713/1‑101 (MQ=255) tGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTa > 1:1103415/1‑101 (MQ=255) gACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTAt < 1:6574683/101‑1 (MQ=255) gACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTAt > 1:11432596/1‑101 (MQ=255) gACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTAt > 1:4702727/1‑101 (MQ=255) gACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTAt < 1:2924375/101‑1 (MQ=255) cGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATcc > 1:7415675/1‑101 (MQ=255) gTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATccc < 1:6507437/101‑1 (MQ=255) aaaaGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGa < 1:7562476/101‑1 (MQ=255) aaGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGAcc < 1:4408684/101‑1 (MQ=255) aGACGTACTGCCGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCa < 1:9302496/101‑1 (MQ=255) aCGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAg > 1:11336093/1‑101 (MQ=255) cGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGc < 1:12292872/101‑1 (MQ=255) cGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGc < 1:9780702/101‑1 (MQ=255) gTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGca < 1:1877167/101‑1 (MQ=255) tACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGcac < 1:5737169/101‑1 (MQ=255) gctgctgctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAGcgtt < 1:11601029/100‑4 (MQ=255) aCTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGcaca < 1:5188014/101‑1 (MQ=255) ctgctgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAg < 1:5366103/101‑1 (MQ=255) ctgctgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAg < 1:9177022/101‑1 (MQ=255) gctgctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAGcgttcgg > 1:4513335/1‑95 (MQ=255) ctgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCa < 1:9619543/101‑1 (MQ=255) tgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAg > 1:7211550/1‑101 (MQ=255) tgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAg > 1:2689383/1‑101 (MQ=255) tgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAg > 1:12206992/1‑101 (MQ=255) tgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAg < 1:5451502/101‑1 (MQ=255) tgctgGACGTTACCCCACTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAg < 1:7784455/101‑1 (MQ=255) tgctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAGcgttcggag > 1:7818699/1‑93 (MQ=255) ctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGgt > 1:8665544/1‑101 (MQ=255) gACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGtt > 1:8088667/1‑101 (MQ=255) aCGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTtc > 1:9873677/1‑101 (MQ=255) cGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTtct < 1:4250006/101‑1 (MQ=255) cGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTtct > 1:1443620/1‑101 (MQ=255) ttACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTctct < 1:5247506/101‑1 (MQ=255) aCCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGTCAGGTGTTCTCTAc > 1:13809417/1‑101 (MQ=255) aCCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTAc < 1:10037783/101‑1 (MQ=255) aCCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTAc > 1:2140792/1‑101 (MQ=255) cccGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCg > 1:10072331/1‑101 (MQ=255) ccGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGc > 1:2531807/1‑101 (MQ=255) ccGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGc < 1:3005288/101‑1 (MQ=255) cGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCt > 1:7087821/1‑101 (MQ=255) cGCTGTCTCCGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCt > 1:12465630/1‑101 (MQ=255) gCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTg < 1:1854207/101‑1 (MQ=255) cTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGa < 1:13318036/101‑1 (MQ=255) tGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCCGaa > 1:5014967/1‑101 (MQ=255) gTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAg > 1:8930979/1‑101 (MQ=255) tctcTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGa > 1:10362033/1‑101 (MQ=255) tctcTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGa > 1:13587705/1‑101 (MQ=255) ctctGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGAc > 1:14110929/1‑101 (MQ=255) ctctGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGAc > 1:636878/1‑101 (MQ=255) tctGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACa < 1:13217048/101‑1 (MQ=255) tGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAAc > 1:9581522/1‑101 (MQ=255) gggTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAAcc < 1:6072734/101‑1 (MQ=255) ggTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCa < 1:11079124/101‑1 (MQ=255) ggTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCa < 1:12019327/101‑1 (MQ=255) tATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGt < 1:8808505/101‑1 (MQ=255) tATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGt > 1:3912804/1‑101 (MQ=255) tATAGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGt > 1:7674001/1‑101 (MQ=255) tCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCt < 1:8236432/101‑1 (MQ=255) aaaCCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCg > 1:11840085/1‑101 (MQ=255) aaaCCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCg > 1:379623/1‑101 (MQ=255) aaaCCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCg > 1:13634542/1‑101 (MQ=255) aaaCCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCg > 1:2011305/1‑101 (MQ=255) aaCCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCgg > 1:3432602/1‑101 (MQ=255) aCCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGt > 1:9446914/1‑101 (MQ=255) ccATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTa > 1:9522195/1‑101 (MQ=255) ccATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTa < 1:4776183/101‑1 (MQ=255) aTGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAc < 1:9651651/101‑1 (MQ=255) aTGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAc > 1:576834/1‑101 (MQ=255) ggCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAccat < 1:12699425/101‑1 (MQ=255) cGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAccatcc > 1:9935490/1‑101 (MQ=255) cGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAccatcc > 1:5053524/1‑101 (MQ=255) tgtgATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCAtg < 1:8163035/101‑1 (MQ=255) tgatgaCGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCAtgtg < 1:5705334/101‑1 (MQ=255) atgaCGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGtgct < 1:11721401/101‑1 (MQ=255) tgaCGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCCAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGtgctg > 1:1285233/1‑101 (MQ=255) tgaCGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGtgctg < 1:3169846/101‑1 (MQ=255) tatgtcgCTGATCGCGAAAATGCCCAGTCTCGCGAGAAGGCAGAGCCAGGTGTTCTCTACCACGCAAGATAACCAGACTGCGTGCCCCATCCACGtgatgc > 1:6402522/6‑101 (MQ=255) gacgacGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGtgctgc > 1:7112276/1‑101 (MQ=255) cgacgCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAg > 1:2336781/1‑101 (MQ=255) cgacgCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAg > 1:6443665/1‑101 (MQ=255) gacgCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAgg < 1:10139934/101‑1 (MQ=255) acgCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAggg > 1:12280971/1‑101 (MQ=255) cgCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGt > 1:8361050/1‑101 (MQ=255) cgCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGt < 1:2599156/101‑1 (MQ=255) tGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGaa > 1:5364070/1‑101 (MQ=255) tGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGaa > 1:3633576/1‑101 (MQ=255) gATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAAc > 1:5455118/1‑101 (MQ=255) aTCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACg > 1:11208468/1‑101 (MQ=255) cgcgAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTa > 1:10828732/1‑101 (MQ=255) cgcgAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTa > 1:10412811/1‑101 (MQ=255) cgAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTaaa > 1:1684851/1‑101 (MQ=255) | GGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAA > NC_007779/13300‑13500 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |