| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,450,018 | T→C | 7.7% | E438E (GAA→GAG) | rpoC ← | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,450,018 | 0 | T→C | 7.7% | 51.0 ‑0.7 ‑0.9 | 272 | E438E (GAA→GAG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/13): ref base (119/132): total (127/145) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.98e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.17e-01 | ||||||||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
GCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTT > NC_007779/3449918‑3450118 | cGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGtt < 1:6467438/101‑1 (MQ=255) cGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGtt > 1:6256353/1‑101 (MQ=255) gTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCa < 1:3750364/101‑1 (MQ=255) tACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCaa < 1:1111034/101‑1 (MQ=255) cGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTGCCGGTTCAAAt < 1:10294323/101‑1 (MQ=255) aaCAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCt > 1:12810551/1‑101 (MQ=255) aCAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTg < 1:10767046/101‑1 (MQ=255) aGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGa > 1:2529651/1‑101 (MQ=255) cTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCa > 1:7157771/1‑101 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg > 1:13311091/1‑101 (MQ=255) gTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGAc > 1:11940680/1‑101 (MQ=255) tCACCATCGAAGTCGGCGTTATAAGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACg > 1:6952059/1‑101 (MQ=255) cACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACgg > 1:2949176/1‑101 (MQ=255) aCCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGt > 1:11456424/1‑101 (MQ=255) aCCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGt > 1:2001972/1‑101 (MQ=255) cATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGc < 1:9830563/101‑1 (MQ=255) aTCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCa > 1:1644456/1‑101 (MQ=255) cGAAGTCGGCGTTATATGTCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCaga < 1:332844/101‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGt < 1:4758152/101‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGt > 1:14179648/1‑101 (MQ=255) aGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTc < 1:1833564/101‑1 (MQ=255) aGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTc < 1:8018648/101‑1 (MQ=255) aGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTc < 1:4281864/101‑1 (MQ=255) gTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGCTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCT‑GATACCCAGACCGTGCAGAGTCgt > 1:14122538/1‑100 (MQ=255) tCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCgg > 1:9320371/1‑101 (MQ=255) tCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCgg < 1:271124/101‑1 (MQ=255) cGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGt < 1:12401989/101‑1 (MQ=255) cGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGt < 1:6907474/101‑1 (MQ=255) cGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGt > 1:14964/1‑101 (MQ=255) cGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCa > 1:13549577/1‑101 (MQ=255) gTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCAc < 1:2790058/101‑1 (MQ=255) gTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCAc < 1:8999829/101‑1 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg > 1:10389369/1‑101 (MQ=255) atatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGt < 1:3642637/101‑1 (MQ=255) tatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGtt > 1:3055700/1‑101 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc > 1:2214267/1‑101 (MQ=255) tGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTca > 1:13405246/1‑101 (MQ=255) cctcacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagc < 1:8145173/92‑1 (MQ=255) ccGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagc > 1:11790261/1‑101 (MQ=255) gctatccAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTa > 1:989531/6‑101 (MQ=255) acaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTa < 1:5882029/101‑1 (MQ=255) acaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTa > 1:42008/1‑101 (MQ=255) catgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGAc > 1:10659433/5‑101 (MQ=255) caAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTTGGTGCACGGTTCAGCAGTAc < 1:5029335/101‑1 (MQ=255) caAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAc < 1:4579788/101‑1 (MQ=255) atgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGAcc < 1:7507366/98‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc > 1:4084234/1‑101 (MQ=255) cAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCCAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCgggg > 1:12247308/1‑100 (MQ=255) cAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCCAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgt > 1:10898976/1‑101 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt > 1:6143545/1‑101 (MQ=255) gCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtgt < 1:1907612/101‑1 (MQ=255) gCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtgt > 1:770625/1‑101 (MQ=255) cGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGtt < 1:14056222/101‑1 (MQ=255) ggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcg < 1:4978769/101‑1 (MQ=255) ggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcg > 1:10254218/1‑101 (MQ=255) cAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggtaa < 1:11752288/101‑5 (MQ=255) aGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggtaat > 1:8529042/1‑96 (MQ=255) aGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggtaat < 1:12613220/101‑6 (MQ=255) gCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGATGTCcggtaatg < 1:7514277/101‑7 (MQ=255) gCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCCGAATACCCAGGCGGTGCAGTGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGGGTCcggtaatg > 1:11859196/1‑95 (MQ=255) cTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATaa > 1:1234390/1‑101 (MQ=255) cTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATaa < 1:13540556/101‑1 (MQ=255) cTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATaa > 1:5484518/1‑101 (MQ=255) cTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCCCAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGGGTCcggtaatga > 1:1391834/1‑94 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc > 1:10580644/1‑101 (MQ=255) ggATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACt > 1:12700765/1‑101 (MQ=255) gATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACtt < 1:12547796/101‑1 (MQ=255) gATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACtt < 1:11045687/101‑1 (MQ=255) aTAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTc > 1:8859325/1‑101 (MQ=255) aTAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTc < 1:11283752/101‑1 (MQ=255) tAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCg > 1:9748494/1‑101 (MQ=255) aGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGt > 1:3879370/1‑101 (MQ=255) cTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTcc < 1:8298210/101‑1 (MQ=255) cTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTcc < 1:4811841/101‑1 (MQ=255) cTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTcc > 1:3435032/1‑101 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg < 1:3833448/101‑1 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg < 1:13055897/101‑1 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg < 1:6390128/101‑1 (MQ=255) tACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAgg > 1:11509491/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGa > 1:7102775/1‑101 (MQ=255) cTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCGGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTTCAGGata > 1:8124537/1‑101 (MQ=255) cTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGata < 1:6539496/101‑1 (MQ=255) cTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGata < 1:9629605/101‑1 (MQ=255) ttCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat < 1:7629320/101‑1 (MQ=255) ttCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat < 1:9149309/101‑1 (MQ=255) ttCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat < 1:1730591/101‑1 (MQ=255) tCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGGGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATc > 1:4056990/1‑101 (MQ=255) gATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCATAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATccc < 1:2630901/101‑1 (MQ=255) gATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATccc > 1:208160/1‑101 (MQ=255) aTCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCa > 1:12044490/1‑101 (MQ=255) tCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaa < 1:5404735/101‑1 (MQ=255) tCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaa > 1:4565050/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:5366774/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc > 1:8421534/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc > 1:5534725/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:525148/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc > 1:7931563/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:6057854/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:2142276/101‑1 (MQ=255) ggTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGc < 1:1372850/101‑1 (MQ=255) | GCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTT > NC_007779/3449918‑3450118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |