| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,451,560 | C→T | 5.0% | V1293I (GTT→ATT) | rpoB ← | RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,451,560 | 0 | C→T | 5.0% | 21.1 ‑2.0 ‑0.1 | 239 | V1293I (GTT→ATT) | rpoB | RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/9): ref base (114/113): total (117/122) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.37e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.23e-01 | ||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AATACGTTGAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCC > NC_007779/3451460‑3451660 | tACGTTGAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACgg > 1:12229688/1‑101 (MQ=255) aCGTTGAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGt < 1:13045899/101‑1 (MQ=255) cGTTGAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTg > 1:12046235/1‑101 (MQ=255) gTTGAAGGATTCTGGGATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGa < 1:7440352/101‑1 (MQ=255) ttGAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAg > 1:13221970/1‑101 (MQ=255) tGAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGc < 1:9273031/101‑1 (MQ=255) tGAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGc > 1:6170025/1‑101 (MQ=255) gAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCa > 1:2606880/1‑101 (MQ=255) aaGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCAt > 1:5144632/1‑101 (MQ=255) aGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCAtt > 1:11592554/1‑101 (MQ=255) gATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTc > 1:1503326/1‑101 (MQ=255) aTTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTcc < 1:6707404/101‑1 (MQ=255) ttCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCt > 1:14024605/1‑101 (MQ=255) ttCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCt < 1:4266192/101‑1 (MQ=255) tCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTg > 1:1051387/1‑101 (MQ=255) tCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTg > 1:347877/1‑101 (MQ=255) tCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTg < 1:12471988/101‑1 (MQ=255) tGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCa > 1:10011395/1‑101 (MQ=255) tGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCa > 1:814809/1‑101 (MQ=255) gCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAgg > 1:5274541/1‑101 (MQ=255) tGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGgtg > 1:3024430/1‑101 (MQ=255) cccGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTa < 1:1849569/101‑1 (MQ=255) cccGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTa < 1:7530812/101‑1 (MQ=255) tCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtgctgc > 1:1957501/1‑101 (MQ=255) tCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtgctgc < 1:397054/101‑1 (MQ=255) ccATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTgcg < 1:8448425/101‑1 (MQ=255) tCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCg < 1:12118955/101‑1 (MQ=255) cTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGt < 1:4736292/101‑1 (MQ=255) tGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTa > 1:3530008/1‑101 (MQ=255) tGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTa > 1:1766577/1‑101 (MQ=255) tGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTa > 1:6237050/1‑101 (MQ=255) aTGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATg < 1:5010807/101‑1 (MQ=255) aTGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATg < 1:12634520/101‑1 (MQ=255) tGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGc > 1:879476/1‑101 (MQ=255) ggTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCt > 1:862696/1‑101 (MQ=255) gTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCtt > 1:12993739/1‑101 (MQ=255) gCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCa > 1:8259442/1‑101 (MQ=255) gCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCa < 1:7149812/101‑1 (MQ=255) gCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCa < 1:9694574/101‑1 (MQ=255) gCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCa < 1:12400068/101‑1 (MQ=255) ccGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAg < 1:4799761/101‑1 (MQ=255) gTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAgcg < 1:9521554/101‑1 (MQ=255) tCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAgcgc > 1:7867126/1‑101 (MQ=255) ccACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGcc > 1:13360164/1‑101 (MQ=255) cACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGccc > 1:6956173/1‑101 (MQ=255) cACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGccc > 1:13857420/1‑101 (MQ=255) aCGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCca > 1:10562642/1‑101 (MQ=255) aCGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCca > 1:10841498/1‑101 (MQ=255) gATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCcaca > 1:2059164/1‑101 (MQ=255) aTGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCacac < 1:11105107/101‑1 (MQ=255) tGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACt < 1:9421013/101‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACtt > 1:14260310/1‑101 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACtt < 1:11221180/101‑1 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt > 1:4407103/1‑101 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt < 1:9178193/101‑1 (MQ=255) tataCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCCCACTTCCAtc > 1:405542/1‑101 (MQ=255) tataCATCTTAGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtc > 1:9197732/1‑101 (MQ=255) ataCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtct > 1:13149718/1‑101 (MQ=255) taCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtctc < 1:663187/101‑1 (MQ=255) aTCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTcccc > 1:4188563/1‑101 (MQ=255) aTCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTcccc < 1:2344784/101‑1 (MQ=255) aTCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTcccc < 1:6255800/101‑1 (MQ=255) tCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCg < 1:5929016/101‑1 (MQ=255) cTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGa > 1:4169222/1‑101 (MQ=255) ttGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGaa < 1:9377906/101‑1 (MQ=255) ttGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGaa > 1:6303915/1‑101 (MQ=255) tGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAGCGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGaaa > 1:7175444/1‑101 (MQ=255) tGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGaaa > 1:310036/1‑101 (MQ=255) cGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTg < 1:581175/101‑1 (MQ=255) gACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGa > 1:11331576/1‑101 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca > 1:7022047/1‑101 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca < 1:7057871/101‑1 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca > 1:2819029/1‑101 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca < 1:12955158/101‑1 (MQ=255) gTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccac > 1:10295287/1‑101 (MQ=255) ttCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccacc < 1:2802301/101‑1 (MQ=255) cGTCATCGGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAAc < 1:6570421/101‑1 (MQ=255) cGTCATCGGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAAc < 1:10742014/101‑1 (MQ=255) gTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACt < 1:11470195/101‑1 (MQ=255) tcatcgGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACtg > 1:6852029/1‑101 (MQ=255) tcatcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtg < 1:12760253/101‑1 (MQ=255) tcatcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtg < 1:4866694/101‑1 (MQ=255) catcgGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACtga < 1:9462357/101‑2 (MQ=255) catcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtgt > 1:4521639/1‑101 (MQ=255) atcgGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACtgag > 1:3679112/1‑99 (MQ=255) atcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtgtg > 1:7774656/1‑101 (MQ=255) tcggACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGc < 1:2659638/98‑1 (MQ=255) tcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGc < 1:9091286/101‑1 (MQ=255) tcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGc < 1:10356686/101‑1 (MQ=255) tcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGc > 1:7975131/1‑101 (MQ=255) cggACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGcc > 1:13560707/3‑101 (MQ=255) aGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCt > 1:5222869/1‑101 (MQ=255) aGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCt > 1:3305777/1‑101 (MQ=255) aCTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTa < 1:8602379/101‑1 (MQ=255) ttAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTacc > 1:4548567/1‑101 (MQ=255) tAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTacca < 1:10993415/101‑1 (MQ=255) aaCGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTaccac > 1:8702131/1‑101 (MQ=255) aaCGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTaccac > 1:12863233/1‑101 (MQ=255) aCGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTaccacc > 1:608533/1‑101 (MQ=255) cGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCAccc < 1:11684688/101‑1 (MQ=255) | AATACGTTGAAGGATTCTGGCATGCCCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCC > NC_007779/3451460‑3451660 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |