| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,451,606 | C→T | 19.3% | A1277A (GCG→GCA) | rpoB ← | RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,451,606 | 0 | C→T | 19.3% | 150.4 ‑0.3 ‑0.7 | 275 | A1277A (GCG→GCA) | rpoB | RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (27/26): ref base (106/116): total (133/142) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.60e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.23e-01 | ||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
CGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGT > NC_007779/3451506‑3451706 | tCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAgcgc > 1:7867126/1‑101 (MQ=255) ccACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGcc > 1:5529979/1‑101 (MQ=255) cACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGccc > 1:3850691/1‑101 (MQ=255) aCGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCca < 1:8209153/101‑1 (MQ=255) cGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCcac < 1:8940758/101‑1 (MQ=255) cGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCcac > 1:12811254/1‑101 (MQ=255) gATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCcaca > 1:2059164/1‑101 (MQ=255) gATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCcaca < 1:9291161/101‑1 (MQ=255) aTGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCacac < 1:11105107/101‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACtt < 1:11221180/101‑1 (MQ=255) ttttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTcc < 1:7296935/101‑1 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt < 1:2609474/101‑1 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt > 1:4407103/1‑101 (MQ=255) tataCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtc < 1:10678317/101‑1 (MQ=255) ataCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtct > 1:13149718/1‑101 (MQ=255) aCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTcc < 1:10463338/101‑1 (MQ=255) aTCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTcccc > 1:14186603/1‑101 (MQ=255) cTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGa > 1:9684570/1‑101 (MQ=255) cTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGa > 1:4169222/1‑101 (MQ=255) cTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGa < 1:10958559/101‑1 (MQ=255) ttGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGaa > 1:6303915/1‑101 (MQ=255) ggTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACATTTCCATCTCCCCGAAAc < 1:11317152/101‑1 (MQ=255) cGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTg < 1:860525/101‑1 (MQ=255) cGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTg < 1:581175/101‑1 (MQ=255) ccGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacc > 1:490180/1‑101 (MQ=255) ccGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacc < 1:4737236/101‑1 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca < 1:12667464/101‑1 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca < 1:12955158/101‑1 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca > 1:7022047/1‑101 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca > 1:2819029/1‑101 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca < 1:2788839/101‑1 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca < 1:7057871/101‑1 (MQ=255) ttCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccacc > 1:5218806/1‑101 (MQ=255) ttCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccacc > 1:3409716/1‑101 (MQ=255) ttCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccacc > 1:2114296/1‑101 (MQ=255) ttCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccacc < 1:1893729/101‑1 (MQ=255) aCGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGaa < 1:11468572/101‑1 (MQ=255) cGTCATCGGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAAc < 1:6570421/101‑1 (MQ=255) cGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCTCCGAAc > 1:9403141/1‑101 (MQ=255) gTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACt > 1:10561546/1‑101 (MQ=255) gTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACt > 1:10431583/1‑101 (MQ=255) tcatcgGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACtg > 1:6852029/1‑101 (MQ=255) catcgGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACtga < 1:9462357/101‑2 (MQ=255) catcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtgt > 1:4521639/1‑101 (MQ=255) atcgGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACtgag < 1:717515/101‑3 (MQ=255) atcgGACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACtgag > 1:3679112/1‑99 (MQ=255) tcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGc < 1:9091286/101‑1 (MQ=255) tcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGc > 1:7975131/1‑101 (MQ=255) ggACTTGATGGTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCt < 1:3310051/100‑1 (MQ=255) aGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCt > 1:10309089/1‑101 (MQ=255) gatggTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTaccac < 1:5127168/98‑1 (MQ=255) aaCGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTaccac < 1:13369897/101‑1 (MQ=255) aCGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTaccacc > 1:608533/1‑101 (MQ=255) ggTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCa < 1:5660813/101‑1 (MQ=255) ggTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACCCCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCa < 1:13470428/101‑1 (MQ=255) ggTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCa > 1:13846267/1‑101 (MQ=255) tGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGc < 1:9186692/101‑1 (MQ=255) tGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGc > 1:179186/1‑101 (MQ=255) gAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCg > 1:2565329/1‑101 (MQ=255) aGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCgg > 1:4256667/1‑101 (MQ=255) cagctCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCACTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGgct < 1:6155696/97‑1 (MQ=255) cATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgct < 1:14262544/101‑1 (MQ=255) agctCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGgctg > 1:6458847/4‑101 (MQ=255) ttCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgctgct > 1:11409774/1‑101 (MQ=255) ccTGCAGGGTGTAGGCAGCGCTGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCTCCGAAGCTCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGctgctgg > 1:3109068/1‑100 (MQ=255) cTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAg < 1:5369643/101‑1 (MQ=255) tGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGt < 1:2986715/101‑1 (MQ=255) tGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGt < 1:13932114/101‑1 (MQ=255) tGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGt > 1:800743/1‑101 (MQ=255) gCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTa > 1:10051738/1‑101 (MQ=255) aGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAAc > 1:10751202/1‑101 (MQ=255) aGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAAc > 1:12218251/1‑101 (MQ=255) gtATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc < 1:5933387/101‑1 (MQ=255) gtAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTAATCatgg > 1:1361482/1‑98 (MQ=255) taggcagcgcCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTAATCatgga < 1:6754352/95‑5 (MQ=255) tATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCt < 1:7735225/101‑1 (MQ=255) tATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCt > 1:12513851/1‑101 (MQ=255) aggcagcgcCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTAATCatggag > 1:10626238/6‑96 (MQ=255) aggcagcgcCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTAATCatggag < 1:13001461/96‑6 (MQ=255) tgctgcGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGt < 1:2471433/101‑1 (MQ=255) tgctgcGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGt < 1:8457017/101‑1 (MQ=255) gctgcGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTa < 1:2139730/101‑1 (MQ=255) ctgcGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTaa < 1:2319199/101‑1 (MQ=255) tgcGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAg > 1:4317031/1‑101 (MQ=255) gcgcCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGa > 1:11889021/1‑101 (MQ=255) gcgcCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGa > 1:2683553/1‑101 (MQ=255) gcgcCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGTAATCatggagtacgg > 1:10084120/1‑91 (MQ=255) cgcCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGaa > 1:11375347/1‑101 (MQ=255) cgcCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGaa > 1:4013615/1‑101 (MQ=255) ccGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAAcc < 1:5899666/101‑1 (MQ=255) cTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGaa > 1:8998444/1‑101 (MQ=255) ttCCAGCGCCCCCACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCCCCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAc < 1:661425/101‑1 (MQ=255) ttCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAc > 1:7501066/1‑101 (MQ=255) tCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAcg < 1:2839492/101‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAcg > 1:6254978/1‑101 (MQ=255) tCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGGGGTAcg > 1:8962467/1‑101 (MQ=255) cAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAcgcg > 1:3508308/1‑101 (MQ=255) gcgcCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAAcgcgcg < 1:1149819/101‑1 (MQ=255) cgcCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGt < 1:13734448/101‑1 (MQ=255) cgcCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGt < 1:12395441/101‑1 (MQ=255) | CGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGT > NC_007779/3451506‑3451706 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |