| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,451,753 | A→G | 11.6% | G1228G (GGT→GGC) | rpoB ← | RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,451,753 | 0 | A→G | 11.6% | 68.2 ‑0.4 ‑0.4 | 233 | G1228G (GGT→GGC) | rpoB | RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (15/12): ref base (104/102): total (119/114) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.85e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.71e-01 | ||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
TACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGCTCTTTAA > NC_007779/3451653‑3451853 | tACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTaa > 1:9477206/1‑101 (MQ=255) caccCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCa > 1:12397717/1‑101 (MQ=255) caccCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCa > 1:3177697/1‑101 (MQ=255) accCAGCGGCTGCTGGGTAATCATGGAGTACGGACCGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGccca < 1:14244795/101‑3 (MQ=255) accCAGCGGCTGCTGGGTAATCATGGAGTACGGACCGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGccca < 1:5349165/101‑3 (MQ=255) ccAGCGGCTGCTGGGTAATCATGGAGTACGGACCGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCAcc < 1:13184071/101‑2 (MQ=255) ccAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACg < 1:7223894/101‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACg > 1:2877309/1‑101 (MQ=255) aGCGGCTGCTGGGTAATCATGGAGTACGGACCGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCAccga < 1:11250974/101‑4 (MQ=255) aGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGt < 1:10508078/101‑1 (MQ=255) gCGGCTGCTGGGAAATCATGGAGGACGGACCGGTGGAACGAGGGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGGGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCAccgaa > 1:4253933/1‑97 (MQ=255) gCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAGCCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTGCAGCATGTACATGTAACCAACgggt < 1:1610817/101‑3 (MQ=255) gCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGtt < 1:834280/101‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGGGTAATCATGGAGTACGGACCGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCAccgaaa > 1:5074918/1‑96 (MQ=255) cGGCTGCTGGGTAATCATGGAGTACGGACCGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCAccgaaa > 1:633419/1‑96 (MQ=255) cGGCTGCTGGGTAATCATGGAGTACGGACCGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCAccgaaa < 1:1774627/101‑6 (MQ=255) gctggtGAGTACCCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCCTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAGCGGTTAcc < 1:12505066/101‑1 (MQ=255) gctgctGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTAcc < 1:11998878/101‑1 (MQ=255) ctgctgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCg < 1:11441400/101‑1 (MQ=255) ctgccgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCg < 1:13383445/101‑1 (MQ=255) tgctgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGTTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCgg > 1:4734138/1‑101 (MQ=255) ctgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGAc > 1:526108/1‑101 (MQ=255) ctgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGAc < 1:2714263/101‑1 (MQ=255) ctgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGAc < 1:10392738/101‑1 (MQ=255) ctgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGAc > 1:2230520/1‑101 (MQ=255) ctgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGAc > 1:8029335/1‑101 (MQ=255) tgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACg < 1:2200984/101‑1 (MQ=255) tgAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACg > 1:10090291/1‑101 (MQ=255) tAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCg > 1:3896560/1‑101 (MQ=255) tAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCg > 1:7099078/1‑101 (MQ=255) aaCCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGTTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGa > 1:9326629/1‑101 (MQ=255) cAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGTTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACt > 1:8218919/1‑101 (MQ=255) cAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACt < 1:9196108/101‑1 (MQ=255) cAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACt > 1:11035622/1‑101 (MQ=255) aGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTg > 1:7139692/1‑101 (MQ=255) aGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTg > 1:12919391/1‑101 (MQ=255) cTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTc < 1:3035089/101‑1 (MQ=255) tGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCa < 1:11355282/101‑1 (MQ=255) tAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGTTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCAcc < 1:2701346/101‑1 (MQ=255) aGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAg < 1:10207520/101‑1 (MQ=255) gAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGt > 1:9636631/1‑101 (MQ=255) aaCCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTg < 1:68913/101‑1 (MQ=255) aCCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGc < 1:13948490/101‑1 (MQ=255) cGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGa < 1:6974050/101‑1 (MQ=255) cGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGa < 1:10789324/101‑1 (MQ=255) cGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGa < 1:4529096/101‑1 (MQ=255) cGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCACCGAAACCGGGAACGGGAACTTTTCGCCAGAGCgg > 1:5976651/1‑100 (MQ=255) cGGTGGAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCACCGAAACCGGGAACGGGAACTTTTCGCCAGAGCgg > 1:11720276/1‑100 (MQ=255) gAACGAGCGTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCACCGAAACCGGGAACGGGAACTTTTCGCCAGAGCGGCCGTc < 1:13696643/101‑1 (MQ=255) aaCGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCg < 1:280298/101‑1 (MQ=255) aaCGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCg > 1:8476240/1‑101 (MQ=255) aCGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGt > 1:2147388/1‑101 (MQ=255) aCGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGt > 1:12778399/1‑101 (MQ=255) cgcgcgTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTTAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACGATCGTa > 1:14138569/1‑101 (MQ=255) cgcgcgTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTa > 1:6598426/1‑101 (MQ=255) cgcgcgTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTa < 1:4462408/101‑1 (MQ=255) cgagcgTGAATCTTCTCGTCGACCAGGTGGTGCAGCTTCAGCATGTACATGTAGCCCACCGAAACCGGGAACGGGAACTTTTCGCCAGAGCGGCCGTCgaa > 1:7000837/4‑99 (MQ=255) agcgcgTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTa < 1:5614753/100‑1 (MQ=255) cgcgTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACa > 1:1926129/1‑101 (MQ=255) gcgTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAg > 1:8146066/1‑101 (MQ=255) gcgTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAg > 1:5452451/1‑101 (MQ=255) gcgTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAg > 1:12573929/1‑101 (MQ=255) gTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGc > 1:11644876/1‑101 (MQ=255) tGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCg < 1:4603122/101‑1 (MQ=255) gCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCgg > 1:4008385/1‑101 (MQ=255) gCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCgg < 1:3558395/101‑1 (MQ=255) cATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTTAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGa > 1:7632107/1‑101 (MQ=255) aTCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGAt > 1:1212251/1‑101 (MQ=255) tCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATc < 1:11159980/101‑1 (MQ=255) 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ttCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAg > 1:6089095/1‑101 (MQ=255) ttCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAg < 1:11322704/101‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAg > 1:3974678/1‑101 (MQ=255) cAGCATGTACATGTAACCAGCGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGtt < 1:11195593/101‑1 (MQ=255) atgtacatgtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTcag > 1:11727124/1‑101 (MQ=255) atgtacatgtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTcag < 1:7688529/101‑1 (MQ=255) acatgtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCagcagc > 1:13493628/1‑101 (MQ=255) acatgtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCagcagc < 1:13142859/101‑1 (MQ=255) catgtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGct > 1:4877559/1‑101 (MQ=255) atgtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGctc > 1:3677723/1‑101 (MQ=255) atgtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGctc > 1:5401282/1‑101 (MQ=255) atgtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGGCGCCAAGTTTCAGCAGctc > 1:2663514/1‑101 (MQ=255) gtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGCTCtt < 1:2508713/101‑1 (MQ=255) gtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGCTCtt < 1:3442475/101‑1 (MQ=255) gtaACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGCTCtt < 1:7288873/101‑1 (MQ=255) taACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGCTCttt < 1:4101902/101‑1 (MQ=255) aCCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGCTCTTTaa < 1:13562653/101‑1 (MQ=255) | TACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGTAAGAACCGGTGGAACGCGCGTGCATCTTGTCGTCGACCAGGTGGTTCAGTTTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATCGTACAGGCGGATCTGACCGGAAGTCGGCAGGTCGCCAAGTTTCAGCAGCTCTTTAA > NC_007779/3451653‑3451853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |