| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,884,452 | C→G | 5.2% | P183P (CCC→CCG) | aldB → | aldehyde dehydrogenase B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,884,452 | 0 | C→G | 5.2% | 28.7 ‑1.0 ‑0.0 | 229 | P183P (CCC→CCG) | aldB | aldehyde dehydrogenase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/4): ref base (113/104): total (121/108) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.84e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.83e-01 | ||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
GCGAAACCGTGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCG > NC_007779/3884352‑3884551 | gCGAAACCGTGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTccc < 1:3895587/101‑1 (MQ=255) gAAACCGTGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCcgc > 1:1088925/1‑101 (MQ=255) aaCCGTGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCgcgc < 1:5832915/101‑1 (MQ=255) aCCGTGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCt < 1:10578119/101‑1 (MQ=255) aCCGTGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCt > 1:781569/1‑101 (MQ=255) ggCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTggcgg < 1:5574462/101‑1 (MQ=255) gCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTggcggc < 1:12776235/101‑1 (MQ=255) ccTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGgcggcg < 1:1593374/101‑1 (MQ=255) ccTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGgcggcg < 1:1530997/101‑1 (MQ=255) cTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGcggcgg < 1:6786160/101‑1 (MQ=255) cTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGcggcgg < 1:11228437/101‑1 (MQ=255) cTACCACTTCCACGAGCCACTCGGCGTCGTCGGCCAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTggccgccg < 1:11038412/101‑3 (MQ=255) aTCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGc < 1:4271929/101‑1 (MQ=255) aTCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGc < 1:7101979/101‑1 (MQ=255) aTTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAAc < 1:13833310/101‑1 (MQ=255) ttCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtg > 1:3686154/1‑101 (MQ=255) ttCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtg > 1:41042/1‑101 (MQ=255) tCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgt > 1:13367581/1‑101 (MQ=255) aTGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtgtg < 1:3508417/101‑1 (MQ=255) aTGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtgtg < 1:1835928/101‑1 (MQ=255) tGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTgtgg > 1:2978611/1‑101 (MQ=255) aaCCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTgtggtg < 1:10131975/101‑1 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt < 1:1710107/101‑1 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt > 1:9015825/1‑101 (MQ=255) cGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTg > 1:546068/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa > 1:11247628/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGGGCTGaaa > 1:8421765/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGGGCTGaaa > 1:7333429/1‑101 (MQ=255) aGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAc < 1:7702361/101‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAcc < 1:11566629/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:8516609/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:204464/101‑1 (MQ=255) gtggtgGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGc > 1:3218043/1‑101 (MQ=255) gtggtgGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGc > 1:5785328/1‑101 (MQ=255) ggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCAc < 1:462199/101‑1 (MQ=255) tcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagag < 1:10484438/96‑4 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:7415364/101‑1 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:9807570/101‑1 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:11347555/101‑1 (MQ=255) ggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagca > 1:13168341/4‑96 (MQ=2) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:4052739/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:13525973/101‑1 (MQ=255) gCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTa < 1:5640715/101‑1 (MQ=255) ccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcaga > 1:10614514/2‑94 (MQ=255) cAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAc > 1:8649770/1‑101 (MQ=255) aGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcagacc > 1:13999603/1‑92 (MQ=255) gATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAccc < 1:2937868/101‑1 (MQ=255) aTTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAcccc < 1:9577717/101‑1 (MQ=255) aTTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAcccc < 1:13046551/101‑1 (MQ=255) aTTAGCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAATCCCGCACGTCTTAcccc < 1:10758798/101‑1 (MQ=255) tATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGc > 1:8550938/1‑101 (MQ=255) tATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGc < 1:10347860/101‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGACGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCCACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCt > 1:5049696/1‑101 (MQ=255) tCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCtt > 1:7375167/1‑101 (MQ=255) tCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCtt < 1:11656124/101‑1 (MQ=255) tCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCtt < 1:8598503/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc < 1:10988527/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc > 1:6906293/1‑101 (MQ=255) gTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTg > 1:1183920/1‑101 (MQ=255) gAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAc < 1:8944544/101‑1 (MQ=255) aaCTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAct > 1:13744956/1‑101 (MQ=255) aaCTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAct > 1:9606450/1‑101 (MQ=255) aCTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActg > 1:6019799/1‑101 (MQ=255) aCTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGG‑AAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGGCACTGTGTGGGGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgc > 1:281977/1‑101 (MQ=255) cTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGACGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgc < 1:522740/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct > 1:13934307/1‑101 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:1420138/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTATTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:6263299/101‑1 (MQ=255) tCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgctg < 1:3712518/101‑1 (MQ=255) cccGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACtgctgc > 1:1216484/1‑101 (MQ=255) ccGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTgctgct > 1:8318019/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt < 1:14301629/101‑1 (MQ=255) tgctgATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATg > 1:1572045/1‑101 (MQ=255) ctgATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa < 1:12536388/101‑1 (MQ=255) ctgATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa > 1:3590034/1‑101 (MQ=255) ctgATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCAGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa > 1:2740851/1‑101 (MQ=255) gATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaaa < 1:12241054/101‑1 (MQ=255) aTGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAt > 1:5212311/1‑101 (MQ=255) tGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:6133888/101‑1 (MQ=255) tGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:6210894/101‑1 (MQ=255) gg‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:6336928/101‑1 (MQ=255) gg‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:8128957/101‑1 (MQ=255) gg‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:5966617/101‑1 (MQ=255) g‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt > 1:5399148/1‑101 (MQ=255) cGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTc > 1:1638895/1‑101 (MQ=255) gAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCg < 1:1332026/101‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg > 1:12094921/1‑101 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:11927228/1‑101 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:3912159/1‑101 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:13651556/1‑101 (MQ=255) gAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGAtt < 1:6084143/101‑1 (MQ=255) gAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGAtt > 1:10640108/1‑101 (MQ=255) aaaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTa < 1:214861/101‑1 (MQ=255) aaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTAc < 1:10845177/101‑1 (MQ=255) aaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTAc < 1:6644791/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg > 1:4849446/1‑101 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg < 1:4462666/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg > 1:10082473/1‑101 (MQ=255) ggCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgc < 1:7904102/101‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGccgccg > 1:2311196/1‑101 (MQ=255) | GCGAAACCGTGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCG > NC_007779/3884352‑3884551 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |