| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,884,473 | T→C | 4.8% | C190C (TGT→TGC) | aldB → | aldehyde dehydrogenase B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,884,473 | 0 | T→C | 4.8% | 21.4 ‑1.5 ‑1.2 | 230 | C190C (TGT→TGC) | aldB | aldehyde dehydrogenase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/3): ref base (113/106): total (121/109) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.22e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.51e-02 | ||||||||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATG > NC_007779/3884373‑3884573 | tCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgt < 1:9957921/101‑1 (MQ=255) aTGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtgtg > 1:2119055/1‑101 (MQ=255) aTGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtgtg > 1:5810239/1‑101 (MQ=255) tGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTgtgg > 1:12460101/1‑101 (MQ=255) aaCCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTgtggtg < 1:10131975/101‑1 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt < 1:1710107/101‑1 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt > 1:5384106/1‑101 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt > 1:10905927/1‑101 (MQ=255) ttAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaa > 1:9506775/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa > 1:13380636/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGGGCTGaaa > 1:8421765/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGGGCTGaaa > 1:7333429/1‑101 (MQ=255) aGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAc < 1:7702361/101‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAcc < 1:11566629/101‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAccc > 1:11998614/1‑101 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGTCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:7960698/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:8516609/101‑1 (MQ=255) gtggtgGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGc > 1:6196504/1‑101 (MQ=255) ggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCAc > 1:3801000/1‑101 (MQ=255) ggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCAc < 1:13854114/101‑1 (MQ=255) gtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCaga < 1:5431438/95‑3 (MQ=9) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt < 1:1604848/101‑1 (MQ=255) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt > 1:7348259/1‑101 (MQ=255) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt < 1:2965212/101‑1 (MQ=255) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt > 1:1123355/1‑101 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:7415364/101‑1 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:4147784/101‑1 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:11347555/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:5214660/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt > 1:7825957/1‑101 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:13525973/101‑1 (MQ=255) gccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGC‑CGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcag > 1:3359812/3‑95 (MQ=2) gCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTa < 1:5640715/101‑1 (MQ=255) ccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGC‑CGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcaga > 1:13156489/2‑94 (MQ=255) cAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAc > 1:8649770/1‑101 (MQ=255) aGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcagacc > 1:13999603/1‑92 (MQ=255) gATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAccc > 1:4773851/1‑101 (MQ=255) aTTAGCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAATCCCGCACGTCTTAcccc < 1:10758798/101‑1 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCg < 1:10583613/101‑1 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCg > 1:13134678/1‑101 (MQ=255) tATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGc < 1:10347860/101‑1 (MQ=255) tATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGc > 1:8550938/1‑101 (MQ=255) aTCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCt < 1:156209/101‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGACGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCCACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCt > 1:5049696/1‑101 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc < 1:10988527/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc > 1:6906293/1‑101 (MQ=255) tGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGt > 1:12237213/1‑101 (MQ=255) ggAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTTCCCCGCTTTCTGTa > 1:11813894/1‑101 (MQ=255) aaCTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAct > 1:9606450/1‑101 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:10620421/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:1420138/101‑1 (MQ=255) tCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgctg < 1:3712518/101‑1 (MQ=255) cccGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACtgctgc > 1:1216484/1‑101 (MQ=255) ccGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTgctgct > 1:8318019/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:6241577/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:159302/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt < 1:14301629/101‑1 (MQ=255) tgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATg > 1:4596970/1‑101 (MQ=255) ctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa > 1:3590034/1‑101 (MQ=255) ctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCAGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa > 1:2740851/1‑101 (MQ=255) aTGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAt > 1:10780816/1‑101 (MQ=255) tGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:6133888/101‑1 (MQ=255) ggCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:5966617/101‑1 (MQ=255) ggCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:6336928/101‑1 (MQ=255) ggCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg > 1:2779979/1‑101 (MQ=255) ggCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:10493713/101‑1 (MQ=255) gCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt > 1:9693496/1‑101 (MQ=255) gCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt > 1:182993/1‑101 (MQ=255) gCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt > 1:3510746/1‑101 (MQ=255) cGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTc > 1:6514865/1‑101 (MQ=255) gAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCg < 1:1332026/101‑1 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg > 1:553670/1‑101 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:11927228/1‑101 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:13651556/1‑101 (MQ=255) ggAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGAt > 1:13678638/1‑101 (MQ=255) gAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGAtt < 1:6084143/101‑1 (MQ=255) aaaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTa < 1:214861/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg > 1:10082473/1‑101 (MQ=255) cTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgccg > 1:307854/1‑101 (MQ=255) cTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgccg < 1:8816107/101‑1 (MQ=255) cTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgccg < 1:12598298/101‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGccgccg < 1:2537219/101‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg > 1:9005364/1‑101 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg < 1:704405/101‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg < 1:367176/101‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg < 1:3846327/101‑1 (MQ=255) gcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCg > 1:2935863/1‑101 (MQ=255) gcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCg > 1:6254457/1‑101 (MQ=255) cTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgt > 1:4389088/1‑101 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:13306498/1‑101 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc < 1:493171/101‑1 (MQ=255) gggCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACg < 1:188852/101‑1 (MQ=255) ggCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGt > 1:2328297/1‑101 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt > 1:11701639/1‑101 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt < 1:5193558/101‑1 (MQ=255) aCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTc > 1:6031934/1‑101 (MQ=255) tgtgtgGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCaa > 1:11176429/1‑101 (MQ=255) gtgtgGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAAt < 1:9917239/101‑1 (MQ=255) tgtgGTGCTGAACCCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATg < 1:6681801/101‑1 (MQ=255) tgtgGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATg < 1:7244951/101‑1 (MQ=255) | TCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATG > NC_007779/3884373‑3884573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |