Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 3,884,479 | G→A | 4.8% | V192V (GTG→GTA) | aldB → | aldehyde dehydrogenase B |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,884,479 | 0 | G→A | 4.8% | 18.6 ‑1.5 ‑0.7 | 229 | V192V (GTG→GTA) | aldB | aldehyde dehydrogenase B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/3): ref base (110/108): total (118/111) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.18e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.14e-01 |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
AACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAG > NC_007779/3884379‑3884579 | aaCCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTgtggtg < 1:10131975/101‑1 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt < 1:1710107/101‑1 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt > 1:9015825/1‑101 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt > 1:5384106/1‑101 (MQ=255) cGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTg > 1:546068/1‑101 (MQ=255) gTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGa > 1:11882682/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa > 1:5986198/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa < 1:8439748/101‑1 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGGGCTGaaa > 1:7333429/1‑101 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:204464/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:8547276/101‑1 (MQ=255) gtggtgGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGc > 1:11279608/1‑101 (MQ=255) gtggtgGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGc > 1:5785328/1‑101 (MQ=255) gtcgtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGc > 1:11232236/10‑101 (MQ=2) gtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCaga < 1:13022869/95‑3 (MQ=255) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt < 1:2965212/101‑1 (MQ=255) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt > 1:7348259/1‑101 (MQ=255) tcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagag < 1:10484438/96‑4 (MQ=255) ggggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTc < 1:6108744/101‑1 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:11084507/101‑1 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt > 1:4993448/1‑101 (MQ=255) ggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCG‑‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagca > 1:13168341/4‑96 (MQ=2) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:746211/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:4052739/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt > 1:7825957/1‑101 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:13525973/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt > 1:6930633/1‑101 (MQ=255) gCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTa < 1:5640715/101‑1 (MQ=255) ccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcaga > 1:10614514/2‑94 (MQ=255) ccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑C‑CGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcaga > 1:13311258/2‑94 (MQ=255) aGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGG‑CCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcagacc > 1:13999603/1‑92 (MQ=255) gATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAccc > 1:4773851/1‑101 (MQ=255) aTTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAcccc < 1:9577717/101‑1 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCg > 1:13789355/1‑101 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCg > 1:13134678/1‑101 (MQ=255) aTCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGACGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCCACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCt > 1:5049696/1‑101 (MQ=255) tCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCtt < 1:11656124/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc < 1:10988527/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGG‑AAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCt > 1:8558358/1‑101 (MQ=255) cGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCt < 1:1463601/101‑1 (MQ=255) gAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAc < 1:8944544/101‑1 (MQ=255) cTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGACGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgc < 1:522740/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:1420138/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:8375829/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct > 1:13548936/1‑101 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTATTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:6263299/101‑1 (MQ=255) tCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgctg < 1:3712518/101‑1 (MQ=255) cccGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACtgctgc > 1:1216484/1‑101 (MQ=255) cccGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACtgctgc < 1:13325052/101‑1 (MQ=255) cGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTa > 1:3630094/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:159302/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:6241577/1‑101 (MQ=255) tgctgATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATg > 1:11383424/1‑101 (MQ=255) ctgATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa < 1:12536388/101‑1 (MQ=255) ctgATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa > 1:3590034/1‑101 (MQ=255) tgATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaa > 1:4874899/1‑101 (MQ=255) tgATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaa < 1:9926914/101‑1 (MQ=255) gATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaaa < 1:12241054/101‑1 (MQ=255) aTGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAt > 1:10780816/1‑101 (MQ=255) tGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:6210894/101‑1 (MQ=255) tGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:285048/101‑1 (MQ=255) tGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:6133888/101‑1 (MQ=255) gg‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:8128957/101‑1 (MQ=255) gg‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg > 1:2779979/1‑101 (MQ=255) g‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt > 1:182993/1‑101 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg > 1:11961866/1‑101 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg > 1:12094921/1‑101 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGCTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg < 1:9756619/101‑1 (MQ=255) ggAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGAt > 1:13678638/1‑101 (MQ=255) gAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGAtt > 1:10640108/1‑101 (MQ=255) aaaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTa < 1:214861/101‑1 (MQ=255) aaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTAc < 1:6644791/101‑1 (MQ=255) aaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTAc < 1:10845177/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg > 1:10082473/1‑101 (MQ=255) cTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgccg > 1:307854/1‑101 (MQ=255) cccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgccgcc < 1:681363/101‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGccgccg < 1:2537219/101‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGccgccg < 1:7713845/101‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg < 1:3846327/101‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgt > 1:4389088/1‑101 (MQ=255) cTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgt > 1:3423173/1‑101 (MQ=255) tGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtg < 1:642365/101‑1 (MQ=255) gcggcgGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtggt > 1:10562715/1‑101 (MQ=255) ggcggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGa > 1:4472696/1‑101 (MQ=255) ggcggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGa < 1:9646092/101‑1 (MQ=255) ggcggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGa < 1:8691425/101‑1 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAATTTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:2683898/1‑101 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:5505776/1‑101 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:11780028/1‑101 (MQ=255) ggCAACTGTGTGGTGCTGAGACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGt > 1:1602284/1‑101 (MQ=255) ggCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGt > 1:2328297/1‑101 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt < 1:5193558/101‑1 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt > 1:3789617/1‑101 (MQ=255) aCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTc > 1:6031934/1‑101 (MQ=255) tgtgGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATg < 1:7244951/101‑1 (MQ=255) gtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATgcgca < 1:10308749/101‑5 (MQ=255) gtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGgcgc < 1:10710223/101‑1 (MQ=255) gtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGgcgc < 1:1534076/101‑1 (MQ=255) gtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGCGAACGGGGTCAATGgcgc > 1:7403163/1‑101 (MQ=255) gCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAg > 1:7070468/1‑101 (MQ=255) | AACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGG‑CGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAG > NC_007779/3884379‑3884579 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |