| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,884,482 | G→C | 4.6% | L193L (CTG→CTC) | aldB → | aldehyde dehydrogenase B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,884,482 | 0 | G→C | 4.6% | 26.6 ‑1.5 ‑1.4 | 240 | L193L (CTG→CTC) | aldB | aldehyde dehydrogenase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/3): ref base (114/115): total (122/118) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.16e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.63e-02 | ||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
CGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTG > NC_007779/3884382‑3884582 | ttAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaa > 1:9506775/1‑101 (MQ=255) ttAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaa > 1:7784530/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa > 1:5986198/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa > 1:13380636/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa < 1:1526271/101‑1 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa > 1:11247628/1‑101 (MQ=255) tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGGGCTGaaa > 1:7333429/1‑101 (MQ=255) ggCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAcc < 1:11566629/101‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAccc > 1:11998614/1‑101 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:8516609/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:204464/101‑1 (MQ=255) gtcgtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGc > 1:11232236/10‑101 (MQ=2) ggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCAc < 1:13854114/101‑1 (MQ=255) ggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCAc < 1:462199/101‑1 (MQ=255) gtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCaga < 1:5431438/95‑3 (MQ=9) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt < 1:2965212/101‑1 (MQ=255) ggggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTc < 1:6108744/101‑1 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt > 1:14044963/1‑101 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:11347555/101‑1 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:11084507/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:13525973/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:5214660/101‑1 (MQ=255) ccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGC‑CGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcaga > 1:7245177/2‑94 (MQ=255) ccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGC‑CGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcaga > 1:13311258/2‑94 (MQ=255) cAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAc > 1:13253250/1‑101 (MQ=255) aGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAcc > 1:6181295/1‑101 (MQ=255) aTTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAcccc < 1:13046551/101‑1 (MQ=255) aTTAGCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAATCCCGCACGTCTTAcccc < 1:10758798/101‑1 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCg < 1:10583613/101‑1 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCg < 1:14204967/101‑1 (MQ=255) tATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGc < 1:10347860/101‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCt < 1:156209/101‑1 (MQ=255) aTCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGACGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCCACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCt > 1:5049696/1‑101 (MQ=255) tCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCtt < 1:10184031/101‑1 (MQ=255) tCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCtt > 1:7375167/1‑101 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc < 1:10988527/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGG‑AAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCt > 1:8558358/1‑101 (MQ=255) gTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTg > 1:1183920/1‑101 (MQ=255) gTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTg < 1:5615973/101‑1 (MQ=255) ggAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTa > 1:9589648/1‑101 (MQ=255) gAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAc < 1:8944544/101‑1 (MQ=255) aaCTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAct > 1:13744956/1‑101 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:8375829/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:10620421/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTATTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:6263299/101‑1 (MQ=255) tCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgctg < 1:3712518/101‑1 (MQ=255) cGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTa > 1:3630094/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:5880914/1‑101 (MQ=255) tgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaa > 1:4874899/1‑101 (MQ=255) tgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaa > 1:8162833/1‑101 (MQ=255) tgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaa < 1:9926914/101‑1 (MQ=255) gATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaaa < 1:12241054/101‑1 (MQ=255) tGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:6210894/101‑1 (MQ=255) tGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:285048/101‑1 (MQ=255) ggCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:10493713/101‑1 (MQ=255) ggCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg > 1:2779979/1‑101 (MQ=255) gCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt > 1:9693496/1‑101 (MQ=255) cGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTc > 1:1638895/1‑101 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg > 1:12094921/1‑101 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg < 1:2462125/101‑1 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGCTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg < 1:9756619/101‑1 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:11927228/1‑101 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:5094306/1‑101 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:13651556/1‑101 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:3912159/1‑101 (MQ=255) aaaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTa < 1:214861/101‑1 (MQ=255) aaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTAc < 1:6644791/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg < 1:4462666/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg > 1:10082473/1‑101 (MQ=255) ggCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgc < 1:7904102/101‑1 (MQ=255) gCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgcc < 1:4172294/101‑1 (MQ=255) cTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgccg < 1:12598298/101‑1 (MQ=255) cTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgccg > 1:307854/1‑101 (MQ=255) cccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgccgcc < 1:681363/101‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGccgccg < 1:1722969/101‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGccgccg < 1:12190068/101‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgt > 1:3423173/1‑101 (MQ=255) tGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtg < 1:642365/101‑1 (MQ=255) ggcggcGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtgg > 1:10821454/1‑101 (MQ=255) ggcggcGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtgg < 1:1314599/101‑1 (MQ=255) ggcggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGa < 1:8691425/101‑1 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAATTTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:2683898/1‑101 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:5505776/1‑101 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:5353904/1‑101 (MQ=255) ggCAACTGTGTGGTGCTGAGACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGt > 1:1602284/1‑101 (MQ=255) ggCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGt > 1:2328297/1‑101 (MQ=255) ggCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGt < 1:3580641/101‑1 (MQ=255) cAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTgg < 1:6945597/101‑1 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt > 1:11701639/1‑101 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt > 1:3789617/1‑101 (MQ=255) aCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTc > 1:6031934/1‑101 (MQ=255) aCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTc > 1:3833043/1‑101 (MQ=255) tgtgtgGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCaa > 1:6243379/1‑101 (MQ=255) gtggtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATgg > 1:762226/1‑101 (MQ=255) ggtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGgcg > 1:10651042/1‑101 (MQ=255) gtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGCGAACGGGGTCAATGgcgc > 1:7403163/1‑101 (MQ=255) gCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAg > 1:7070468/1‑101 (MQ=255) gCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACCGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAg < 1:4939819/101‑1 (MQ=255) tGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGt > 1:8470633/1‑101 (MQ=255) tGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGt > 1:5683733/1‑101 (MQ=255) | CGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTG > NC_007779/3884382‑3884582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |