| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,884,485 | A→G | 5.1% | K194K (AAA→AAG) | aldB → | aldehyde dehydrogenase B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,884,485 | 0 | A→G | 5.1% | 22.7 ‑2.0 ‑1.0 | 234 | K194K (AAA→AAG) | aldB | aldehyde dehydrogenase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (9/3): ref base (109/112): total (118/116) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.36e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.01e-01 | ||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
TAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTGGGG > NC_007779/3884385‑3884585 | tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa < 1:8439748/101‑1 (MQ=255)tAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaaa > 1:5986198/1‑101 (MQ=255) aGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAc < 1:7702361/101‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAccc < 1:3707747/101‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAccc > 1:11998614/1‑101 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:204464/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:8516609/101‑1 (MQ=255) gtggtgGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGc > 1:6196504/1‑101 (MQ=255) ggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCAc < 1:462199/101‑1 (MQ=255) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt < 1:1604848/101‑1 (MQ=255) tggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGt > 1:1123355/1‑101 (MQ=255) tcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCG‑TGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagag < 1:10484438/96‑4 (MQ=255) gggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCt < 1:7415364/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt > 1:6930633/1‑101 (MQ=255) ccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGC‑CGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcaga > 1:13156489/2‑94 (MQ=255) cAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAc > 1:5682471/1‑101 (MQ=255) cAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAc > 1:8649770/1‑101 (MQ=255) gATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAccc < 1:2937868/101‑1 (MQ=255) aTTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAcccc < 1:7383008/101‑1 (MQ=255) aTTAGCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAATCCCGCACGTCTTAcccc < 1:10758798/101‑1 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCg > 1:13789355/1‑101 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCg > 1:13134678/1‑101 (MQ=255) aTCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGACGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCCACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCt > 1:5049696/1‑101 (MQ=255) tCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCtt < 1:10184031/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGG‑AAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCt > 1:8558358/1‑101 (MQ=255) cGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCt < 1:1463601/101‑1 (MQ=255) gTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTg < 1:5615973/101‑1 (MQ=255) tGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGt > 1:12237213/1‑101 (MQ=255) ggAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTTCCCCGCTTTCTGTa > 1:11813894/1‑101 (MQ=255) ggAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTa > 1:9589648/1‑101 (MQ=255) gAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAc < 1:8944544/101‑1 (MQ=255) cTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGACGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgc < 1:522740/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:10620421/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:1420138/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct > 1:13934307/1‑101 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct > 1:13548936/1‑101 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct < 1:8375829/101‑1 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:6241577/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:159302/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:5880914/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:3027419/1‑101 (MQ=255) tgctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATg > 1:11383424/1‑101 (MQ=255) gctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAGCCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATgg > 1:12159465/1‑101 (MQ=255) ctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa > 1:10988081/1‑101 (MQ=255) ctgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGa > 1:3590034/1‑101 (MQ=255) tgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaa < 1:9926914/101‑1 (MQ=255) tgATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaa < 1:13666554/101‑1 (MQ=255) aTGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAt > 1:10780816/1‑101 (MQ=255) tGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAAtt < 1:285048/101‑1 (MQ=255) ggCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:8128957/101‑1 (MQ=255) ggCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:6336928/101‑1 (MQ=255) gCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt > 1:9693496/1‑101 (MQ=255) gCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt > 1:5399148/1‑101 (MQ=255) cGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTc > 1:6514865/1‑101 (MQ=255) gAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCg < 1:1332026/101‑1 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg > 1:11961866/1‑101 (MQ=255) c‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGCTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg < 1:9756619/101‑1 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:3912159/1‑101 (MQ=255) gAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGAtt > 1:10640108/1‑101 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg > 1:10082473/1‑101 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg < 1:4462666/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg > 1:4849446/1‑101 (MQ=255) ggCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgc < 1:7904102/101‑1 (MQ=255) gCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgcc < 1:4172294/101‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGccgccg > 1:2311196/1‑101 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGccgccg < 1:2537219/101‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg > 1:9005364/1‑101 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg < 1:12401188/101‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg < 1:734538/101‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg < 1:704405/101‑1 (MQ=255) cgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGc > 1:1721525/1‑101 (MQ=255) gcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCg > 1:6254457/1‑101 (MQ=255) cTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgt > 1:3423173/1‑101 (MQ=255) gcggcgGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtggt > 1:10562715/1‑101 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAATTTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:2683898/1‑101 (MQ=255) cggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAAc > 1:13306498/1‑101 (MQ=255) gggCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACg < 1:188852/101‑1 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt < 1:5193558/101‑1 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt > 1:11701639/1‑101 (MQ=255) aaCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGt > 1:3789617/1‑101 (MQ=255) aCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTc < 1:2745730/101‑1 (MQ=255) aCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTc < 1:13487773/101‑1 (MQ=255) aCTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTc > 1:6031934/1‑101 (MQ=255) tgtgtgGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCaa < 1:6120802/101‑1 (MQ=255) tgtgtgGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCaa > 1:11176429/1‑101 (MQ=255) tgtgGTGCTGAACCCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATg < 1:6681801/101‑1 (MQ=255) tgtgGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATg < 1:729822/101‑1 (MQ=255) ggtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGgcg > 1:12756668/1‑101 (MQ=255) ggtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGgcg < 1:244334/101‑1 (MQ=255) gtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATgcgca < 1:10308749/101‑5 (MQ=255) gtgCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGgcgc < 1:1534076/101‑1 (MQ=255) gCTGAAACCCGCACGTCTTCCCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAg < 1:5466645/101‑1 (MQ=255) gCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACCGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAg < 1:4939819/101‑1 (MQ=255) tGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGt < 1:3823833/101‑1 (MQ=255) gAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTg < 1:11251735/101‑1 (MQ=255) aaaCCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTgg < 1:3341804/101‑1 (MQ=255) aaaCCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTgg < 1:6093408/101‑1 (MQ=255) aaCCCGCACGTCTTTCCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTggg < 1:3660743/101‑1 (MQ=255) aaCCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTggg > 1:11072289/1‑101 (MQ=255) aCCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTgggg < 1:7165062/101‑1 (MQ=255) | TAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGC‑TGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTGAACGTGGTCAATGGCGCAGGTGGGG > NC_007779/3884385‑3884585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |