| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,166,115 | C→T | 9.2% | G84G (GGC→GGT) | rpsL → | 30S ribosomal protein S12 |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,166,115 | 0 | C→T | 9.2% | 50.1 ‑0.9 ‑0.0 | 259 | G84G (GGC→GGT) | rpsL | 30S ribosomal protein S12 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (15/9): ref base (123/112): total (138/121) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.95e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.38e-01 | ||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
AAGTATGCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATG > NC_007779/4166015‑4166215 | aaGTATGCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGc > 1:13161590/1‑101 (MQ=255)aaGTATGCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGc > 1:144936/1‑101 (MQ=255) aTGCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTc < 1:845601/101‑1 (MQ=255) aTGCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTc > 1:8126763/1‑101 (MQ=255) aTGCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTc > 1:3588496/1‑101 (MQ=255) tGCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCg > 1:13368588/1‑101 (MQ=255) gCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCgt < 1:563264/101‑1 (MQ=255) gCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCgt < 1:11752478/101‑1 (MQ=255) ccGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACTTCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCgtg < 1:9763647/101‑1 (MQ=255) ccGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCgtg > 1:13173026/1‑101 (MQ=255) cGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCgtgt > 1:4046594/1‑101 (MQ=255) cGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCgtgt < 1:7662685/101‑1 (MQ=255) gtTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTaa > 1:9068879/1‑101 (MQ=255) tCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAg > 1:860439/1‑101 (MQ=255) tCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAg < 1:3845869/101‑1 (MQ=255) cGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGa > 1:8290230/1‑101 (MQ=255) cGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGa > 1:10777018/1‑101 (MQ=255) cGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGa > 1:6446444/1‑101 (MQ=255) cGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGa < 1:4883220/101‑1 (MQ=255) gTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGAc > 1:9212966/1‑101 (MQ=255) gTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGAc < 1:7535630/101‑1 (MQ=255) cTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCt < 1:5743658/101‑1 (MQ=255) tGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTc < 1:13590132/101‑1 (MQ=255) tGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTc > 1:1871395/1‑101 (MQ=255) aCTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTccc > 1:215604/1‑101 (MQ=255) aCTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTccc < 1:11500058/101‑1 (MQ=255) aaCGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCggg > 1:559427/1‑101 (MQ=255) aCGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGgt < 1:10111423/101‑1 (MQ=255) ttCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCg < 1:12266780/101‑1 (MQ=255) cGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGCCCTCCCGGGTGTTCGtt < 1:10877635/101‑1 (MQ=255) cGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGtt > 1:6757262/1‑101 (MQ=255) gAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTa > 1:12440305/1‑101 (MQ=255) gAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTa < 1:1430636/101‑1 (MQ=255) aaGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTAc > 1:3317038/1‑101 (MQ=255) aGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTAcc < 1:2260004/101‑1 (MQ=255) aGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTAcc > 1:2856527/1‑101 (MQ=255) aGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTAcc > 1:8215633/1‑101 (MQ=255) aGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACATCCCGGGTGTTCGTTAcc > 1:9843898/1‑101 (MQ=255) gTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAGCCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACca < 1:9534301/101‑1 (MQ=255) tGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACcac > 1:12926066/1‑101 (MQ=255) gACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACcaca > 1:4756243/1‑101 (MQ=255) ttCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCg < 1:7283774/101‑1 (MQ=255) tCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGt < 1:523650/101‑1 (MQ=255) tCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGt > 1:12791265/1‑101 (MQ=255) ccTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTa < 1:2844945/101‑1 (MQ=255) acattccgggtgAGGGCCACAACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCgt > 1:3224469/9‑101 (MQ=255) cattccgggtgAGGGCCACAACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCgtg < 1:13110132/94‑1 (MQ=255) cattccgggtgAGGGCCACAACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCgtg < 1:7739022/94‑1 (MQ=255) cATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACgtg < 1:12021251/101‑1 (MQ=255) cGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACgtggtg > 1:9663276/1‑101 (MQ=255) ggtggtGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGCGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTgc > 1:3003972/1‑101 (MQ=255) cgggtgAGGGCCACAACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCgtggttcc > 1:10537754/3‑98 (MQ=255) tggtgAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTgcgc > 1:4554272/1‑101 (MQ=255) gggtgAGGGCCACAACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCgtggttccc < 1:5346912/100‑5 (MQ=255) ggtgAGGGCCACAACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCgtggttccct < 1:9745331/101‑6 (MQ=255) ggtgAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCt < 1:8795839/101‑1 (MQ=255) ggtgAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCt > 1:11860382/1‑101 (MQ=255) gtgAGGGCCACAACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCgtggttccctc > 1:4200013/1‑95 (MQ=255) tgAGGGCCACAACCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCgtggttccctcg > 1:11606811/1‑94 (MQ=255) gAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGa < 1:121010/101‑1 (MQ=255) aGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACt > 1:12174587/1‑101 (MQ=255) ggTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTg > 1:6318011/1‑101 (MQ=255) gTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGc < 1:8482683/101‑1 (MQ=255) aaCCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCgg > 1:7427870/1‑101 (MQ=255) aaCCTGCAGGAGCACTCCATGGTGCTCGTTCGCGGTGGTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGAcacccaggg < 1:6071503/101‑9 (MQ=255) aCCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGGGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGc > 1:1664515/1‑101 (MQ=255) ccTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCg > 1:6624053/1‑101 (MQ=255) tGCAGGAGCACTCCGTGAGCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGtt < 1:14205413/101‑1 (MQ=255) gCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTa > 1:8555707/1‑101 (MQ=255) gCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTa > 1:14133474/1‑101 (MQ=255) aGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTaaa > 1:11109461/1‑101 (MQ=255) ggAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAg < 1:10027589/101‑1 (MQ=255) gAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGa < 1:4374918/101‑1 (MQ=255) cgcTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCg < 1:6145361/99‑1 (MQ=255) cACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCg > 1:1733744/1‑101 (MQ=255) cACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCg < 1:13944269/101‑1 (MQ=255) 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tgatcctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAg > 1:13663023/1‑101 (MQ=255) tgatcctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAg > 1:7196980/1‑101 (MQ=255) gatcctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAgg > 1:7933374/1‑101 (MQ=255) gatcctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAgg < 1:11327918/101‑1 (MQ=255) cctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTc < 1:6917058/101‑1 (MQ=255) ctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCg > 1:9338960/1‑101 (MQ=255) tgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGt > 1:6986649/1‑101 (MQ=255) gatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTATGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGtt < 1:1981164/101‑1 (MQ=255) atccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTc < 1:3211560/101‑1 (MQ=255) tccTTGGCGATCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTCCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCTTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTcc < 1:9317626/101‑1 (MQ=255) tccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTcc > 1:10705714/1‑101 (MQ=255) ccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCa < 1:5118982/101‑1 (MQ=255) cGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCaa < 1:12351181/101‑1 (MQ=255) cGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCaa < 1:6777540/101‑1 (MQ=255) tGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGt < 1:895253/101‑1 (MQ=255) gCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTAt < 1:6866890/101‑1 (MQ=255) cGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATg > 1:3969789/1‑101 (MQ=255) | AAGTATGCCGTGTTCGTCTGACTAACGGTTTCGAAGTGACTTCCTACATCGGTGGTGAAGGTCACAACCTGCAGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATG > NC_007779/4166015‑4166215 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |