| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 224,725 | T→A | 21.4% | noncoding (955/1542 nt) | rrsH → | 16S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 224,725 | 0 | T→A | 21.4% | 91.3 ‑0.9 ‑0.4 | 149 | noncoding (955/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (20/12): ref base (63/54): total (83/66) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.27e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.41e-01 | ||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCA > NC_007779/224672‑224825 | ggTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCcaca > 1:13504382/1‑101 (MQ=11)ggTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCcaca < 1:6585896/101‑1 (MQ=11) ttAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑Ga < 1:12477478/101‑1 (MQ=32) ttAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑Ga > 1:11789165/1‑101 (MQ=32) tAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑Gaa > 1:10123995/1‑101 (MQ=32) tAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑Gaa > 1:9228412/1‑101 (MQ=32) tAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑Gaa > 1:12935259/1‑101 (MQ=32) tAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑Gaa > 1:6711109/1‑101 (MQ=32) aaaaCTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAAc > 1:5419808/1‑101 (MQ=33) aaaaCTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAAc > 1:7583095/1‑101 (MQ=33) aaaaCTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAAc < 1:7420259/101‑1 (MQ=33) aaaCTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACt > 1:12642578/1‑101 (MQ=34) aaCTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcg < 1:4149703/101‑6 (MQ=1) aaCTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcg > 1:1979853/1‑96 (MQ=1) aaCTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcg > 1:14141281/1‑96 (MQ=1) aaCTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcg > 1:8245972/1‑96 (MQ=1) aCTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACttt < 1:5714076/101‑1 (MQ=35) aCTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACttt < 1:11042636/101‑1 (MQ=35) aCTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACttt < 1:3944767/101‑1 (MQ=35) aCTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgc > 1:6541291/1‑95 (MQ=1) aCTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgc > 1:303989/1‑95 (MQ=1) aCTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgc > 1:8831223/1‑95 (MQ=1) cTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcg < 1:5227753/101‑8 (MQ=1) cTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcg < 1:2808556/101‑8 (MQ=1) cTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcg > 1:9586587/1‑94 (MQ=1) cTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcg < 1:4528886/101‑8 (MQ=1) cTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGGGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcg > 1:8559337/1‑94 (MQ=1) tCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTcc < 1:3446325/101‑1 (MQ=38) tCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTcc < 1:7060812/101‑1 (MQ=38) tCAAATGAAGTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTcc < 1:4710740/101‑1 (MQ=38) tCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgc < 1:12787285/101‑9 (MQ=1) tCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgc > 1:11687479/1‑93 (MQ=1) cAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCa > 1:13114215/1‑101 (MQ=39) cAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgcc > 1:13956677/1‑92 (MQ=1) cAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgcc > 1:6171042/1‑92 (MQ=1) cAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgcc > 1:29235/1‑92 (MQ=1) aaaTGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCag > 1:12800602/1‑101 (MQ=39) aaaGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgcca > 1:9668504/1‑91 (MQ=1) aaaGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgcca < 1:100318/101‑11 (MQ=1) aaaGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgcca < 1:4678527/101‑11 (MQ=1) aaaGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgcca > 1:11276295/1‑91 (MQ=1) aaaGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcgcca > 1:12980768/1‑91 (MQ=1) aaaGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACA‑ggatcgcccca > 1:12944582/1‑91 (MQ=1) aaTGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCaga < 1:3442799/101‑1 (MQ=39) aTGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCagag < 1:6880819/101‑1 (MQ=40) tGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAgaga < 1:5485386/101‑1 (MQ=40) tGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAgaga < 1:12273422/101‑1 (MQ=39) aTTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATgg < 1:12575123/101‑1 (MQ=255) ttaaCGGGGGACGGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGa < 1:9857062/98‑1 (MQ=255) tGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAt > 1:8251477/1‑101 (MQ=255) tGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAt > 1:11093938/1‑101 (MQ=255) tGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAt > 1:7267409/1‑101 (MQ=255) tGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAt < 1:1220329/101‑1 (MQ=255) tGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAt < 1:2453126/101‑1 (MQ=255) gACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAtt > 1:8433173/1‑101 (MQ=255) gACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACATGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAtt > 1:3866150/1‑101 (MQ=255) aCGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTg > 1:14073962/1‑101 (MQ=255) cGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTgg > 1:10318100/1‑101 (MQ=255) cGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTgg < 1:13010766/101‑1 (MQ=255) cGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACAGGATCGCGCCAGAGATGGagtt > 1:9293085/1‑98 (MQ=1) tggggCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGt > 1:4179266/2‑101 (MQ=255) gggggCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGt > 1:6554228/1‑101 (MQ=255) gggggCACGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGCGATGGATTggc > 1:309267/1‑100 (MQ=255) gggCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGc < 1:7732560/101‑1 (MQ=255) cccGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCtt > 1:13604220/1‑101 (MQ=255) cccGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCtt < 1:778924/101‑1 (MQ=255) ccGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTc < 1:1731465/101‑1 (MQ=255) cGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCg < 1:5813659/101‑1 (MQ=255) cGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCg > 1:10873043/1‑101 (MQ=255) gCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCgg < 1:10244936/101‑1 (MQ=255) cacaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCggg < 1:5313853/101‑1 (MQ=255) cacaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCggg < 1:3312419/101‑1 (MQ=255) acaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGa < 1:8305677/101‑1 (MQ=255) acaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGa > 1:2909758/1‑101 (MQ=255) acaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGa > 1:2780646/1‑101 (MQ=255) caAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGaa < 1:1196604/101‑1 (MQ=255) caAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGaa < 1:8033716/101‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAAc < 1:6286471/101‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAAc > 1:3194241/1‑101 (MQ=255) cGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtgt < 1:384748/101‑1 (MQ=255) cGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtgt > 1:10667494/1‑101 (MQ=255) cGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtgt < 1:13241404/101‑1 (MQ=255) cGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtgt < 1:14001532/101‑1 (MQ=255) gTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTga < 1:4359241/101‑1 (MQ=255) gTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTga < 1:10379580/101‑1 (MQ=255) tGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgag < 1:13340274/101‑1 (MQ=255) tGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgag > 1:2354849/1‑101 (MQ=255) ggAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgaga > 1:11553699/1‑101 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg < 1:6456899/101‑1 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg < 1:181678/101‑1 (MQ=255) cATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAgg < 1:8940649/101‑1 (MQ=255) cATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAgg > 1:11748732/1‑101 (MQ=255) cATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAgg > 1:1927123/1‑101 (MQ=255) tgtgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtg > 1:7549852/1‑101 (MQ=255) gtgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgc > 1:10788114/1‑101 (MQ=255) tgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgct < 1:3134148/101‑1 (MQ=255) tgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgct < 1:2574463/101‑1 (MQ=255) ggTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:684634/1‑101 (MQ=255) tttAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCa < 1:8092727/101‑1 (MQ=255) tttAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCa > 1:11708861/1‑101 (MQ=255) | GGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCA > NC_007779/224672‑224825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |