| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,168,374 | T→C | 8.3% | R491R (CGT→CGC) | fusA → | protein chain elongation factor EF‑G |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,168,374 | 0 | T→C | 8.3% | 60.4 ‑1.6 ‑0.1 | 302 | R491R (CGT→CGC) | fusA | protein chain elongation factor EF‑G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (16/9): ref base (135/142): total (151/151) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.10e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.73e-01 | ||||||||||
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
TCGCGGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGC > NC_007779/4168274‑4168474 | tcGCGGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑Gt < 1:7621160/101‑1 (MQ=255) ggcggTATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGa > 1:13814316/4‑101 (MQ=255) cggTATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGaga < 1:6600273/100‑3 (MQ=255) ggTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAAc > 1:12836508/1‑101 (MQ=255) gTATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGAcc > 1:6719236/1‑100 (MQ=255) aTGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCAt < 1:5292598/101‑1 (MQ=255) aTGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTAt > 1:12733825/1‑101 (MQ=255) aTGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTAt > 1:10408907/1‑101 (MQ=255) aTGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTAt > 1:4220831/1‑101 (MQ=255) tGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATc < 1:4935000/101‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATc > 1:876449/1‑101 (MQ=255) tGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATc > 1:2382797/1‑101 (MQ=255) tGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATc < 1:11157623/101‑1 (MQ=255) ggCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCg > 1:4421558/1‑101 (MQ=255) ggCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCg > 1:11068013/1‑101 (MQ=255) gCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATCCGc < 1:11423485/101‑1 (MQ=255) gCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGc > 1:3082704/1‑101 (MQ=255) cGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATCCGca < 1:145343/101‑2 (MQ=255) cGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGcc < 1:4487538/101‑1 (MQ=255) cGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGcc < 1:976905/101‑1 (MQ=255) gAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCa < 1:1134534/101‑1 (MQ=255) gAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCa < 1:14081017/101‑1 (MQ=255) gctccACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATCCGCAAgc < 1:3640168/97‑2 (MQ=255) tccACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATCCGCAAgccg > 1:314577/3‑98 (MQ=255) tGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGaaa > 1:10950069/1‑101 (MQ=255) tGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGaaa < 1:9673532/101‑1 (MQ=255) tGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGaaa > 1:1974040/1‑101 (MQ=255) aCCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGtt > 1:700390/1‑101 (MQ=255) aCCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGtt < 1:8215619/101‑1 (MQ=255) aCCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGtt > 1:9372572/1‑101 (MQ=255) cTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTAc > 1:13294346/1‑101 (MQ=255) cGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATCCGCAAgccggtcgaga > 1:11988195/1‑91 (MQ=255) cGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCg < 1:10014494/101‑1 (MQ=255) gACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGa > 1:3508533/1‑101 (MQ=255) aCATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGAt > 1:4239712/1‑101 (MQ=255) tcatcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGtt < 1:2880566/101‑1 (MQ=255) atcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGa < 1:12420919/101‑1 (MQ=255) tcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGaa > 1:2619627/1‑101 (MQ=255) cGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAg > 1:6266205/1‑101 (MQ=255) cGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAg < 1:11833770/101‑1 (MQ=255) aCCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTTAAGCGAACGGAGGTAAACCCCAAGGTGCTTACC‑GTGAAACTAACCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTaaa < 1:10531240/101‑1 (MQ=255) aCCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTaaa < 1:13098627/101‑1 (MQ=255) aCCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTaaa > 1:9051937/1‑101 (MQ=255) cGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTTCC‑GTTAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAaca < 1:8504736/101‑1 (MQ=255) cGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAaca < 1:9162508/101‑1 (MQ=255) cGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAaca > 1:1595686/1‑101 (MQ=255) aTGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgc > 1:5472723/1‑101 (MQ=255) aTGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgc > 1:6895206/1‑101 (MQ=255) aTGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgc < 1:6065622/101‑1 (MQ=255) tGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgcg < 1:5006129/101‑1 (MQ=255) tGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgcg > 1:4068260/1‑101 (MQ=255) gCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAAc > 1:2424049/1‑101 (MQ=255) gTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAg > 1:7429793/1‑101 (MQ=255) gTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAg > 1:6171897/1‑101 (MQ=255) gAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTc < 1:10592843/101‑1 (MQ=255) gAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTc > 1:9558914/1‑101 (MQ=255) aTTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtg < 1:10123981/101‑1 (MQ=255) aTTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtg < 1:12046795/101‑1 (MQ=255) aTTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtg > 1:7866847/1‑101 (MQ=255) aTTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtg > 1:8680125/1‑101 (MQ=255) tCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggt < 1:8127239/101‑1 (MQ=255) tCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggt > 1:6499357/1‑101 (MQ=255) tCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggt > 1:7122832/1‑101 (MQ=255) cAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtg > 1:2447872/1‑101 (MQ=255) cAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtg < 1:9894452/101‑1 (MQ=255) aaCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtgg < 1:5414204/101‑1 (MQ=255) aCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTggtggt < 1:466651/101‑1 (MQ=255) ggtGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcg < 1:5998652/99‑1 (MQ=255) gTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcg > 1:14237772/1‑101 (MQ=255) gTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcg < 1:8693999/101‑1 (MQ=255) tGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtg > 1:2741873/1‑101 (MQ=255) gAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtgg < 1:3387517/101‑1 (MQ=255) gAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtgg > 1:2929732/1‑101 (MQ=255) aaGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtggc > 1:7968721/1‑100 (MQ=255) aGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtggtc < 1:5784634/101‑1 (MQ=255) gCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCa < 1:6306075/101‑1 (MQ=255) gCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCa < 1:203144/101‑1 (MQ=255) gAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGt > 1:7315467/1‑101 (MQ=255) gAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGt > 1:13873721/1‑101 (MQ=255) gAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGt > 1:13021298/1‑101 (MQ=255) aCGTAAGTAAACCGCAGGTTACTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTAt < 1:1172338/101‑1 (MQ=255) cGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATg < 1:11517746/101‑1 (MQ=255) gTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATgg > 1:13413194/1‑101 (MQ=255) aGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTc > 1:6966137/1‑101 (MQ=255) ggTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑ATGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCa < 1:8390062/101‑1 (MQ=255) gTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCAt > 1:2971652/1‑101 (MQ=255) gTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCAt < 1:5548444/101‑1 (MQ=255) aaCCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCAtgtt < 1:5712519/101‑1 (MQ=255) aaCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGGAAACACGCGAAACAGTCTGGGGGTCGTGGTCAGTATAGACAtgtt > 1:3800527/1‑101 (MQ=255) ccGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCAtgttgt > 1:1668137/1‑101 (MQ=255) cGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATgttgtt < 1:13206158/101‑1 (MQ=255) gCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTa > 1:2292411/1‑101 (MQ=255) gCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTa < 1:1839994/101‑1 (MQ=255) cagtgTTTCTTACCGGTAAAACTAACCGCAAAAAATTTACTGTTGTAGAAGGAAAACACGCAAAACGGTGTGGGGGTCGTGGTCAGTATGGTCATgttgtt < 1:8337337/97‑1 (MQ=255) aGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATc < 1:10754945/101‑1 (MQ=255) cTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATg > 1:1635322/1‑101 (MQ=255) ttACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGTTGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGCCAGCATGGTCATGCTGTTATCGACACGt > 1:12539309/1‑101 (MQ=255) ttACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGt > 1:4353049/1‑101 (MQ=255) aCC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTAc < 1:3679766/101‑1 (MQ=255) tGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGc > 1:13718309/1‑101 (MQ=255) | TCGCGGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGC > NC_007779/4168274‑4168474 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |