| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,168,380 | T→C | 5.6% | T493T (ACT→ACC) | fusA → | protein chain elongation factor EF‑G |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,168,380 | 0 | T→C | 5.6% | 35.4 ‑0.5 ‑0.0 | 303 | T493T (ACT→ACC) | fusA | protein chain elongation factor EF‑G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/7): ref base (142/144): total (152/151) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.19e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.74e-01 | ||||||||||
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
GTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGCTGGAGC > NC_007779/4168280‑4168480 | tATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTa < 1:11394665/101‑1 (MQ=255) aTGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGCTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCAt > 1:6062813/1‑101 (MQ=255) aTGGGCGAGCTCCACCTAGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCAt > 1:1058358/1‑101 (MQ=255) aTGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTAt > 1:4220831/1‑101 (MQ=255) tGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATc > 1:876449/1‑101 (MQ=255) tGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATc > 1:5953109/1‑101 (MQ=255) gggCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATcc < 1:7218934/101‑1 (MQ=255) ggCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCg > 1:4421558/1‑101 (MQ=255) gCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCAAGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATCCGc > 1:7014008/1‑101 (MQ=255) gCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGc > 1:3082704/1‑101 (MQ=255) cGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTTAAACTATCCGcc < 1:1621222/101‑1 (MQ=255) cGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGcc < 1:13293909/101‑1 (MQ=255) cGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGcc < 1:976905/101‑1 (MQ=255) gAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCa < 1:494217/101‑1 (MQ=255) gctccACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATCCGCAAgc < 1:3640168/97‑2 (MQ=255) aCTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGa < 1:13170121/101‑1 (MQ=255) tccACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACC‑GCGAGACCATCCGCAAgccg > 1:314577/3‑98 (MQ=255) tGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGaaa > 1:1974040/1‑101 (MQ=255) tGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGaaa < 1:9673532/101‑1 (MQ=255) tGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGaaa > 1:5459004/1‑101 (MQ=255) tGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGaaa > 1:1253488/1‑101 (MQ=255) gCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAg < 1:6839725/101‑1 (MQ=255) aCCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGtt > 1:9372572/1‑101 (MQ=255) ccTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTa > 1:10843585/1‑101 (MQ=255) ccTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTa < 1:11291908/101‑1 (MQ=255) cTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTAc < 1:2142122/101‑1 (MQ=255) tCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTAcc < 1:5577213/101‑1 (MQ=255) cGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCg < 1:5312670/101‑1 (MQ=255) cGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCg < 1:626849/101‑1 (MQ=255) cGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCg < 1:10014494/101‑1 (MQ=255) aCATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGAt > 1:4239712/1‑101 (MQ=255) catcatCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATg > 1:6440736/1‑101 (MQ=255) atcatcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGt < 1:2934094/101‑1 (MQ=255) tcatcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGtt < 1:11430900/101‑1 (MQ=255) tcatcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGtt < 1:2880566/101‑1 (MQ=255) tcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGaa < 1:2023259/101‑1 (MQ=255) accgtGACCGGATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGaa < 1:5720776/97‑1 (MQ=255) gTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAgg < 1:13785690/101‑1 (MQ=255) ttGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGt < 1:12039287/101‑1 (MQ=255) tGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTa > 1:9318909/1‑101 (MQ=255) tGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTa > 1:10440858/1‑101 (MQ=255) tGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTa < 1:11922164/101‑1 (MQ=255) aCCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTaaa > 1:9051937/1‑101 (MQ=255) gTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAacac < 1:11074912/101‑1 (MQ=255) gTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAacac < 1:5516416/101‑1 (MQ=255) aTGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgc > 1:4533255/1‑101 (MQ=255) tGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgcg > 1:13821158/1‑101 (MQ=255) tGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgcg > 1:4068260/1‑101 (MQ=255) aGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGaaa < 1:818672/101‑1 (MQ=255) aGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGaaa < 1:5101312/101‑1 (MQ=255) gTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAg > 1:6240035/1‑101 (MQ=255) gAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTc > 1:9558914/1‑101 (MQ=255) gAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGCAAACACGCGAAACAGTc > 1:2645119/1‑101 (MQ=255) aaTTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCt < 1:6915383/101‑1 (MQ=255) aTTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtg > 1:8680125/1‑101 (MQ=255) aTTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtg < 1:10123981/101‑1 (MQ=255) tCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggt < 1:732282/101‑1 (MQ=255) cAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtg < 1:9894452/101‑1 (MQ=255) aaCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtgg > 1:14128237/1‑101 (MQ=255) aaCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtgg < 1:14303344/101‑1 (MQ=255) aaCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtgg < 1:2386559/101‑1 (MQ=255) aCGTTGAAGCGAACGTAGGTAACCCGCAGGTTGCTTGCC‑GTGAACCTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCTAAACAGTCTggtggt < 1:10657544/101‑1 (MQ=255) aCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTggtggt < 1:466651/101‑1 (MQ=255) gTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcg < 1:8693999/101‑1 (MQ=255) tGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtg < 1:7952607/101‑1 (MQ=255) tGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtg > 1:2741873/1‑101 (MQ=255) tGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtg < 1:11735150/101‑1 (MQ=255) aaGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtggt > 1:8086619/1‑101 (MQ=255) cGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAg < 1:1406692/101‑1 (MQ=255) 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cagtgTTTCTTACCGGTAAAACTAACCGCAAAAAATTTACTGTTGTAGAAGGAAAACACGCAAAACGGTGTGGGGGTCGTGGTCAGTATGGTCATgttgtt < 1:8337337/97‑1 (MQ=255) aGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATc < 1:6171821/101‑1 (MQ=255) ggTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCg > 1:10958744/1‑101 (MQ=255) tGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACa < 1:6529535/101‑1 (MQ=255) cTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATg > 1:13652921/1‑101 (MQ=255) ttACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGt > 1:11634275/1‑101 (MQ=255) aCC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTAc < 1:3679766/101‑1 (MQ=255) aCC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTAc > 1:12752277/1‑101 (MQ=255) cc‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTAcc > 1:3375942/1‑101 (MQ=255) gTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCg > 1:2444553/1‑101 (MQ=255) gTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCg < 1:13009763/101‑1 (MQ=255) gAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGCt < 1:8461198/101‑1 (MQ=255) aCTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGCTGGa < 1:4850331/101‑1 (MQ=255) aCTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGCTGGa > 1:4467679/1‑101 (MQ=255) cTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGCTGGAg < 1:7657091/101‑1 (MQ=255) tATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGCTGGAGc < 1:3994357/101‑1 (MQ=255) tATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGCTGGAGc > 1:12588096/1‑101 (MQ=255) | GTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACC‑GTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGCTGGAGC > NC_007779/4168280‑4168480 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |