| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,169,338 | G→C | 29.6% | G84G (GGG→GGC) | tufA → | protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,169,338 | 0 | G→C | 29.6% | 146.5 ‑0.5 ‑0.7 | 142 | G84G (GGG→GGC) | tufA | protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (20/22): ref base (53/47): total (73/69) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.85e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.90e-01 | ||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
ACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTG > NC_007779/4169277‑4169438 | acgtctcgcACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTgctgct < 1:6924625/93‑1 (MQ=2)acacTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTgctgct > 1:4573673/1‑101 (MQ=11)acacTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTgctgct < 1:342853/101‑1 (MQ=11) cacTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTc > 1:11668326/1‑101 (MQ=31) gtctcgcACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCa < 1:716832/95‑1 (MQ=2) ttCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGa > 1:11908979/1‑101 (MQ=32) ctcgcACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGa < 1:11182144/97‑1 (MQ=2) tctcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGAt > 1:4398184/1‑101 (MQ=32) tcgcACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGAt < 1:849279/98‑1 (MQ=2) ctcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATg < 1:11630023/101‑1 (MQ=32) ctcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATg < 1:11438207/101‑1 (MQ=32) tcACGTTTAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATgg < 1:2970284/101‑1 (MQ=17) tcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATgg > 1:8920592/1‑101 (MQ=32) cACGTTTAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGa < 1:829554/101‑1 (MQ=17) cACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGa < 1:10680940/101‑1 (MQ=2) aCGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc > 1:12277737/1‑101 (MQ=2) aCGTTGAATACGACACCCCGGCCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc < 1:4907345/101‑1 (MQ=17) aCGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc > 1:9407466/1‑101 (MQ=32) aCGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc < 1:13044101/101‑1 (MQ=32) aCGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc < 1:11140892/101‑1 (MQ=32) aCGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc < 1:4254995/101‑1 (MQ=32) gTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACgg > 1:7256862/1‑101 (MQ=32) ttGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgc > 1:4632819/1‑101 (MQ=32) tGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgcg > 1:2160552/1‑101 (MQ=32) gAATACGACGCCCCGACCCGTCACTGCGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgcgc < 1:4719515/101‑1 (MQ=12) aaTACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGcgcg < 1:11761704/101‑1 (MQ=33) aaTACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGcgcg < 1:1764079/101‑1 (MQ=33) tACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGAt < 1:1157040/101‑1 (MQ=33) tACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGAt > 1:13691321/1‑101 (MQ=32) aCGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATc > 1:7105910/1‑101 (MQ=32) acacCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTg > 1:6850732/1‑101 (MQ=32) cacCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTgg > 1:11522492/1‑101 (MQ=32) acCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGt < 1:1679565/101‑1 (MQ=32) acCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGt > 1:1558901/1‑101 (MQ=32) ccccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTa > 1:5301229/1‑101 (MQ=32) ccccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTa > 1:575642/1‑101 (MQ=32) cgagaagcGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGttg < 1:3082046/94‑3 (MQ=2) cccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAg < 1:13467732/101‑1 (MQ=33) ccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGt > 1:13745797/1‑101 (MQ=32) gACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtg > 1:2242213/1‑101 (MQ=32) gACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtg < 1:11795264/101‑1 (MQ=33) gACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtg < 1:4507325/101‑1 (MQ=33) aCCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgc > 1:753764/1‑101 (MQ=32) cccGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgct < 1:13545814/101‑1 (MQ=32) cccGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgct > 1:1116956/1‑101 (MQ=32) cccGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgct < 1:3480478/101‑1 (MQ=32) agcGTCACTATGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgcc < 1:11408541/99‑2 (MQ=2) gcGTCACTGCGCTCGCGTCGACGCT‑CCGGGCTGCGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgccg < 1:548017/100‑3 (MQ=2) cGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgctgc < 1:7167049/101‑1 (MQ=32) gTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgccgct > 1:5959063/1‑100 (MQ=2) gTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgccgct < 1:8213737/101‑2 (MQ=2) gTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCg > 1:2441383/1‑101 (MQ=32) cACTACGCTCACGTCGAC‑GCTCCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTAc > 1:4809278/1‑101 (MQ=2) cACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGAc < 1:8773562/101‑1 (MQ=32) cACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGAc < 1:12666612/101‑1 (MQ=33) cACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGAc < 1:9845277/101‑1 (MQ=33) aCTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACt < 1:7438588/101‑1 (MQ=33) cTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTAccg < 1:14036110/101‑3 (MQ=2) cTACGCTCACGTCGAC‑GCTCCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTAccg > 1:11361852/1‑99 (MQ=2) cTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTg < 1:6913653/101‑1 (MQ=32) tcGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGAc < 1:6114676/100‑1 (MQ=2) cGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACg > 1:6994479/1‑101 (MQ=32) gcgcacGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACgg < 1:6290573/98‑1 (MQ=18) gCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACgg > 1:8246429/1‑101 (MQ=32) acGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCg < 1:8020569/101‑1 (MQ=32) cGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGa > 1:7792477/1‑101 (MQ=32) gTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGAt < 1:11277544/101‑1 (MQ=32) cgtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATTACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGa > 1:5934881/11‑101 (MQ=2) cgtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGa < 1:13930829/91‑1 (MQ=2) cgtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGa > 1:13336186/11‑101 (MQ=2) tAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATg > 1:4241087/1‑101 (MQ=32) gtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGAt < 1:231466/92‑1 (MQ=2) tcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATg > 1:9892566/9‑101 (MQ=2) aGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGc > 1:1662004/1‑101 (MQ=32) aGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGGGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGc > 1:3250784/1‑101 (MQ=17) gACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc < 1:12945867/101‑1 (MQ=32) gACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc < 1:278697/101‑1 (MQ=32) gACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc > 1:8219854/1‑101 (MQ=32) cgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGc < 1:9667711/94‑1 (MQ=2) cgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGc > 1:8247644/8‑101 (MQ=2) aCTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCg < 1:648213/101‑1 (MQ=32) cTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGc > 1:10482534/1‑101 (MQ=32) cTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGc > 1:2563547/1‑101 (MQ=32) acgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCg < 1:5940240/96‑1 (MQ=2) tGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCa < 1:3950204/101‑1 (MQ=32) gctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCa > 1:9484152/4‑101 (MQ=2) gctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCa > 1:8608216/4‑101 (MQ=2) gC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAg < 1:356122/101‑1 (MQ=32) gC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAg > 1:5210324/1‑101 (MQ=32) ctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAg < 1:7415531/99‑1 (MQ=2) c‑ccGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGa < 1:7537678/101‑1 (MQ=32) cGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACt > 1:12902447/1‑101 (MQ=32) cGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACt < 1:11124465/101‑1 (MQ=32) ggggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc < 1:13197473/101‑1 (MQ=32) ggggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc < 1:9086463/101‑1 (MQ=32) ggggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc < 1:1139630/101‑1 (MQ=32) gggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCg > 1:13680239/1‑101 (MQ=33) ggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGt < 1:246991/101‑1 (MQ=32) gCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTg > 1:9184049/1‑101 (MQ=33) gCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTg < 1:12699004/101‑1 (MQ=32) | ACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTG > NC_007779/4169277‑4169438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |