| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,169,413 | T→C | 35.8% | T109T (ACT→ACC) | tufA → | protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,169,413 | 0 | T→C | 35.8% | 268.8 ‑1.3 ‑0.2 | 229 | T109T (ACT→ACC) | tufA | protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (40/42): ref base (84/63): total (124/105) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.69e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.73e-01 | ||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
ACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACA > NC_007779/4169313‑4169477 | aCTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACt > 1:2472236/1‑101 (MQ=32) cGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACg > 1:6994479/1‑101 (MQ=32) acGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCg < 1:8020569/101‑1 (MQ=32) cgtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATTACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGa > 1:5934881/11‑101 (MQ=2) cgtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGa < 1:13930829/91‑1 (MQ=2) gtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGAt < 1:6199477/92‑1 (MQ=2) gtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGAt > 1:7460140/10‑101 (MQ=2) cgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGc < 1:9667711/94‑1 (MQ=2) aGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGc > 1:7254944/1‑101 (MQ=32) gacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGcc < 1:1821329/95‑1 (MQ=2) gACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc < 1:278697/101‑1 (MQ=32) gACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc < 1:12945867/101‑1 (MQ=32) gACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc > 1:8219854/1‑101 (MQ=32) aCTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTTCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCg < 1:4547537/101‑1 (MQ=17) aCTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCg < 1:648213/101‑1 (MQ=32) aCTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCg > 1:9626957/1‑101 (MQ=32) tGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCa < 1:3950204/101‑1 (MQ=32) tGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCa < 1:8259454/101‑1 (MQ=32) gctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCa < 1:11478028/98‑1 (MQ=2) gctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCa > 1:8608216/4‑101 (MQ=2) ccGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGAc > 1:8674355/1‑101 (MQ=32) cGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACt > 1:12902447/1‑101 (MQ=32) ggggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc < 1:1139630/101‑1 (MQ=32) ggggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc < 1:594681/101‑1 (MQ=32) ggggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc < 1:13197473/101‑1 (MQ=32) ggccACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCg < 1:10049101/98‑1 (MQ=2) gCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCGGACTCGTg > 1:11603015/1‑101 (MQ=18) gCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTg > 1:9184049/1‑101 (MQ=33) ccACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTg > 1:11172568/2‑101 (MQ=2) ccACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTg > 1:5330278/2‑101 (MQ=2) cACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGa > 1:14169023/1‑101 (MQ=33) cACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGa > 1:11896613/1‑101 (MQ=33) cACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGa > 1:13711266/1‑101 (MQ=33) cACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGa > 1:519075/1‑101 (MQ=11) cACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGa < 1:6940080/101‑1 (MQ=2) aCGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAg > 1:12675805/1‑101 (MQ=32) gCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGca < 1:7346605/101‑1 (MQ=32) gCCGACTACATCAAGAACATGATCACCTGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGca < 1:10853720/101‑1 (MQ=2) gCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGca < 1:9226618/101‑1 (MQ=2) gCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGca > 1:6774900/1‑101 (MQ=11) ccGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGcac > 1:13341070/1‑101 (MQ=33) cGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGcaca > 1:5758530/1‑101 (MQ=33) cGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGcaca > 1:3106653/1‑101 (MQ=33) cGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGcacg > 1:2932715/1‑100 (MQ=11) cGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGcacg > 1:4315270/1‑100 (MQ=11) gACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACAt > 1:11651875/1‑101 (MQ=33) gACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACAt > 1:13150572/1‑101 (MQ=32) cTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATcc > 1:8564036/1‑101 (MQ=32) cTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATcc > 1:13561400/1‑101 (MQ=33) tATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCct > 1:13427238/1‑101 (MQ=32) tATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCct > 1:13822273/1‑101 (MQ=33) aTGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCctg > 1:1421845/1‑101 (MQ=33) aTGTTAAAAACATGACCTCCGGTGCTGCTCAGATGTACGGCGCGATCCCGGTGGTTCCGCGGACTGACGTCCCGATGCCGCAGCCTCGTGAGCACATCctg < 1:6285352/101‑1 (MQ=11) tGTTAAAAACATGATCACCGGGGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTTCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGGACATCatgc > 1:8877780/1‑101 (MQ=11) tAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTgg > 1:7600539/1‑101 (MQ=33) tAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTgg < 1:13648285/101‑1 (MQ=32) agaaCATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTggct > 1:1129168/3‑99 (MQ=2) agaaCATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTggct > 1:93998/3‑99 (MQ=11) aaaaCATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgt > 1:10800443/1‑101 (MQ=33) aaaCATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtc > 1:9527639/1‑101 (MQ=32) aaCATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcg > 1:1454194/1‑101 (MQ=33) cATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGctcgcc > 1:9338166/1‑99 (MQ=2) cATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcgtc < 1:7540621/101‑1 (MQ=32) aTGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCa > 1:10689331/1‑101 (MQ=2) aTGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCa < 1:3375596/101‑1 (MQ=32) tGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAg < 1:10378318/101‑1 (MQ=2) tGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAg < 1:10547730/101‑1 (MQ=2) gATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAgg < 1:2011351/101‑1 (MQ=32) gATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAgg > 1:11975007/1‑101 (MQ=33) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt < 1:1629952/101‑1 (MQ=32) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt > 1:3681797/1‑101 (MQ=33) aTCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGt < 1:1509708/101‑1 (MQ=32) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa > 1:13505158/1‑101 (MQ=33) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa > 1:3028332/1‑101 (MQ=33) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa < 1:12301577/101‑1 (MQ=32) cACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGttg < 1:13914526/101‑3 (MQ=2) cACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAg < 1:902722/101‑1 (MQ=32) cACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAg > 1:4464565/1‑101 (MQ=32) cACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAg > 1:11071393/1‑101 (MQ=32) aCCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAgg < 1:10793914/101‑1 (MQ=32) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGc < 1:5654245/101‑1 (MQ=2) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGc < 1:8728687/101‑1 (MQ=32) ccGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGc < 1:9909222/101‑1 (MQ=32) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCg < 1:2444817/101‑1 (MQ=2) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCg > 1:12239423/1‑101 (MQ=2) cGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCg > 1:8443263/1‑101 (MQ=32) ggTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGt > 1:2211695/1‑101 (MQ=32) ggTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGt < 1:9799570/101‑1 (MQ=32) gTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGtt < 1:7140503/101‑1 (MQ=2) gTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGtt > 1:483713/1‑101 (MQ=32) tgctgcTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTc > 1:10644666/1‑101 (MQ=32) tgctgcTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTc > 1:4105867/1‑101 (MQ=32) gctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTcc > 1:13003609/1‑101 (MQ=32) gctgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTcc < 1:9423234/101‑1 (MQ=32) tgctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGt > 1:6869201/1‑101 (MQ=2) tgctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGt < 1:11700974/101‑1 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTa < 1:10270084/101‑1 (MQ=2) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa < 1:2806685/101‑1 (MQ=32) gctCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa < 1:7932204/101‑1 (MQ=32) tCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGACCCGTGAGCACGTTCTCCTGGCTCGCCAGGTTGGCGTTCCGTAca < 1:6308015/101‑1 (MQ=2) | ACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACA > NC_007779/4169313‑4169477 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |