| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 224,811 | Δ1 bp | 1.8% | noncoding (1041/1542 nt) | rrsH → | 16S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 224,811 | 0 | G→. | 1.8% | 5.1 0.0 ‑0.0 | 221 | noncoding (1041/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (116/100): total (119/102) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.97e-01 | ||||||||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCC > NC_007779/224711‑224911 | ggTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtgtg < 1:1249710/101‑1 (MQ=255) tGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgag < 1:12977116/101‑1 (MQ=255) tGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgag < 1:3737015/101‑1 (MQ=255) tGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgag > 1:5804967/1‑101 (MQ=255) gAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGAc < 1:7123474/101‑1 (MQ=255) gAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGAc < 1:6213920/101‑1 (MQ=255) aGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACa > 1:9024086/1‑101 (MQ=255) aGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACa < 1:5898027/101‑1 (MQ=255) aGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACa < 1:14682169/101‑1 (MQ=255) gcttgtgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg > 1:14057136/4‑101 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg > 1:5558581/1‑101 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg > 1:10049672/1‑101 (MQ=255) cATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAgg > 1:12359881/1‑101 (MQ=255) aTGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGt < 1:1118266/101‑1 (MQ=255) tgtgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtg > 1:5245634/1‑101 (MQ=255) ggTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:11281640/1‑101 (MQ=255) ggTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:10817158/1‑101 (MQ=255) gTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctgc > 1:4963624/1‑101 (MQ=255) gTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctgc < 1:2102196/101‑1 (MQ=255) gTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctgc > 1:4351575/1‑101 (MQ=255) tttAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCa > 1:11119394/1‑101 (MQ=255) ttAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACTTCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCAt < 1:10275359/101‑1 (MQ=255) ttAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCAt > 1:6293063/1‑101 (MQ=255) tAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATg < 1:950464/101‑1 (MQ=255) tAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATg < 1:4181130/101‑1 (MQ=255) aaTTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATgg > 1:7434679/1‑101 (MQ=255) aaTTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATgg < 1:302187/101‑1 (MQ=255) aaTTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATgg > 1:965830/1‑101 (MQ=255) ttCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCt < 1:14494242/101‑1 (MQ=255) cGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgt > 1:15090873/1‑101 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc > 1:8303798/1‑101 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc > 1:14564595/1‑101 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc < 1:10321864/101‑1 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc < 1:6480761/101‑1 (MQ=255) tGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtcgt > 1:945297/1‑101 (MQ=255) gCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtcgtc < 1:1290077/101‑1 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa < 1:8543254/101‑1 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa < 1:10460506/101‑1 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa > 1:6820564/1‑101 (MQ=255) aaCGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAg > 1:6724864/1‑101 (MQ=255) aaCGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACAGGATCGCGCCAGAGATGG‑‑TGTTTCCCTTGTGGCTTGT‑ATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCt < 1:8987711/101‑1 (MQ=2) aCGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACAGGATCGCGCCAGAGATGG‑‑TGTTTCCCTTGTGGCTTGT‑ATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTc > 1:1926368/1‑101 (MQ=2) cgcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCt < 1:4873013/101‑1 (MQ=255) gcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTc > 1:3880389/1‑101 (MQ=255) gcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTc < 1:11871414/101‑1 (MQ=255) cgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCg > 1:10541431/1‑101 (MQ=255) gaagaaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCgt < 1:5148809/101‑1 (MQ=255) aaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGtgttg < 1:3279579/101‑1 (MQ=255) aCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGtgttgt > 1:2692377/1‑101 (MQ=255) ccTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTtgtg > 1:12174371/1‑101 (MQ=255) ccTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTtgtg < 1:10170801/101‑1 (MQ=255) ttACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGaa > 1:4668510/1‑101 (MQ=255) tGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGtt < 1:12637662/101‑1 (MQ=255) tGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGtt > 1:9224576/1‑101 (MQ=255) tGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGtt < 1:6685255/101‑1 (MQ=255) tGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGtt > 1:1338570/1‑101 (MQ=255) tCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTggg > 1:11565146/1‑101 (MQ=255) cTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGt > 1:12770592/1‑101 (MQ=255) tGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTa > 1:4622671/1‑101 (MQ=255) tGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTa > 1:7497973/1‑101 (MQ=255) gACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTaa < 1:3401834/101‑1 (MQ=255) aTCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTc > 1:1889997/1‑101 (MQ=255) tCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTcc > 1:14168111/1‑101 (MQ=255) ccACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTccc > 1:14982485/1‑101 (MQ=255) caca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCg < 1:7852403/101‑1 (MQ=255) aca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGc > 1:7193304/1‑101 (MQ=255) a‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCaa < 1:8210934/101‑1 (MQ=255) aaCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACg > 1:12693919/1‑101 (MQ=255) tttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgc > 1:3584358/1‑101 (MQ=255) tttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgc > 1:1594547/1‑101 (MQ=255) tttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgc < 1:4309889/101‑1 (MQ=255) ttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgcg < 1:6947627/101‑1 (MQ=255) ccAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCa < 1:10992745/101‑1 (MQ=255) cAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCaa < 1:4255113/101‑1 (MQ=255) gaTGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTACCGCAACGAGCGCAACCCt < 1:9766092/101‑1 (MQ=255) aTGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCtt > 1:4038225/1‑101 (MQ=40) ggATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTAt < 1:13761030/101‑1 (MQ=39) gATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATc > 1:2397881/1‑101 (MQ=38) ttGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCtt > 1:909797/1‑101 (MQ=39) ttGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCtt > 1:7371277/1‑101 (MQ=39) tGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCttt > 1:4930776/1‑101 (MQ=39) gCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTttgtt > 1:14217836/1‑101 (MQ=35) gCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTttgtt > 1:4417403/1‑101 (MQ=35) ccTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTttgttg > 1:2128354/1‑101 (MQ=35) ccTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTttgttg > 1:15018069/1‑101 (MQ=35) cTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGc > 1:5228350/1‑101 (MQ=35) ttCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGcc < 1:12189844/101‑1 (MQ=35) tCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCa < 1:2994705/101‑1 (MQ=35) tCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCa > 1:3159848/1‑101 (MQ=35) ggAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCg > 1:13937703/1‑101 (MQ=35) ggAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCg > 1:13322393/1‑101 (MQ=35) ggAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCg < 1:11644098/101‑1 (MQ=37) gAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTTGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCgg < 1:5689182/101‑1 (MQ=25) gAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCgg > 1:1833520/1‑101 (MQ=35) aaCTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGt > 1:15187687/1‑101 (MQ=35) aCTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTc > 1:7940703/1‑101 (MQ=35) cTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTcc > 1:8236154/1‑101 (MQ=34) tgtgAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTccg > 1:8773914/1‑101 (MQ=33) gtgAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTccgg < 1:4836821/101‑1 (MQ=33) gagaCAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTccggcc > 1:2302048/1‑101 (MQ=32) | GGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCC > NC_007779/224711‑224911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |