| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,124,070 | Δ1 bp | 3.0% | coding (46/1224 nt) | glcF ← | glycolate oxidase iron‑sulfur subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,124,070 | 0 | G→. | 3.0% | 14.1 0.0 ‑0.1 | 203 | coding (46/1224 nt) | glcF | glycolate oxidase iron‑sulfur subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/3): ref base (88/109): total (91/112) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.69e-01 | ||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
CGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGG > NC_007779/3123970‑3124170 | cgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAg < 1:11912179/101‑1 (MQ=255) gcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgc > 1:3177871/1‑101 (MQ=255) ggCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgc < 1:14229402/101‑1 (MQ=255) ggCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgc > 1:9162666/1‑101 (MQ=255) ggCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgc > 1:8943685/1‑101 (MQ=255) gCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcg > 1:7282741/1‑101 (MQ=255) gCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTAAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcg > 1:10623029/1‑101 (MQ=255) cGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgc < 1:11221747/101‑1 (MQ=255) cGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgc < 1:10038487/101‑1 (MQ=255) gTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcg > 1:7935499/1‑101 (MQ=255) gTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcg > 1:2666503/1‑101 (MQ=255) tCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcgc > 1:13679469/1‑101 (MQ=255) ccAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGcgcgcgcgcg > 1:1532776/1‑101 (MQ=255) ttCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCt < 1:4986085/101‑1 (MQ=255) ttCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCt < 1:3273816/101‑1 (MQ=255) ttCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCt > 1:13398090/1‑101 (MQ=255) aTCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGcc < 1:12702329/101‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGcc < 1:7207806/101‑1 (MQ=255) tCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCg > 1:7169590/1‑101 (MQ=255) gCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCa < 1:15137976/101‑1 (MQ=255) gCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCa > 1:14822453/1‑101 (MQ=255) gCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCa > 1:11769273/1‑101 (MQ=255) cccAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAt < 1:4277104/101‑1 (MQ=255) ccAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtc > 1:4355957/1‑101 (MQ=255) cAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtct > 1:15057805/1‑101 (MQ=255) gAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATctct < 1:11098859/101‑1 (MQ=255) gAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATctct > 1:441019/1‑101 (MQ=255) gAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATctct > 1:9400871/1‑101 (MQ=255) aaGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCtt < 1:7470697/101‑1 (MQ=255) aGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTc < 1:13168473/101‑1 (MQ=255) gCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCa < 1:6145229/101‑1 (MQ=255) cTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAg < 1:862540/101‑1 (MQ=255) tGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGt > 1:13945275/1‑101 (MQ=255) gATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGtt > 1:6696612/1‑101 (MQ=255) gATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGtt > 1:2956642/1‑101 (MQ=255) aTAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTa > 1:3998389/1‑101 (MQ=255) tAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTaa < 1:708982/101‑1 (MQ=255) aGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAt > 1:5766658/1‑101 (MQ=255) ggTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAtt > 1:2468934/1‑101 (MQ=255) gTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTg < 1:5580241/101‑1 (MQ=255) ttGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTgg > 1:8427599/1‑101 (MQ=255) gggCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGt > 1:7736091/1‑101 (MQ=255) ggCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGtt > 1:12794429/1‑101 (MQ=255) gCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGttt > 1:4657584/1‑101 (MQ=255) cAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTg > 1:1669247/1‑101 (MQ=255) aGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGc < 1:124088/101‑1 (MQ=255) gTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCAt < 1:2192491/101‑1 (MQ=255) ttGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATa < 1:2372767/101‑1 (MQ=255) ttGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATa > 1:4482995/1‑101 (MQ=255) cGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGcc > 1:1011195/1‑101 (MQ=255) tACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGc < 1:9245236/101‑1 (MQ=255) aCAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGct > 1:4707779/1‑101 (MQ=255) cAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctc < 1:10277027/101‑1 (MQ=255) aaaaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcc > 1:13231901/1‑101 (MQ=255) aaaaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcc > 1:13765719/1‑101 (MQ=255) aaaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcct < 1:3261333/101‑1 (MQ=255) aaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcctc < 1:7981688/101‑1 (MQ=255) aaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcctc < 1:514045/101‑1 (MQ=255) aTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCa < 1:10980141/101‑1 (MQ=255) aTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCa > 1:2295247/1‑101 (MQ=255) aTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCATCa < 1:8185319/101‑1 (MQ=255) ccGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCaaa < 1:9645732/101‑1 (MQ=255) gCAGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGt > 1:3880582/1‑101 (MQ=255) cAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGtt < 1:11654112/101‑1 (MQ=255) aGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTc > 1:6279913/1‑101 (MQ=255) tGAACACAGTCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcg < 1:6727606/101‑1 (MQ=255) tGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcg < 1:7827148/101‑1 (MQ=255) tGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcg > 1:2209470/1‑101 (MQ=255) gAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcgc > 1:8718266/1‑101 (MQ=255) aaCACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcgcg < 1:11738111/101‑1 (MQ=255) aaCACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcgcg < 1:1954947/101‑1 (MQ=255) aaCACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcgcg < 1:1091869/101‑1 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTa < 1:14511396/101‑1 (MQ=255) acaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTAc < 1:5453111/101‑1 (MQ=255) acaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTAc < 1:5677253/101‑1 (MQ=255) ggCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCTCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATg < 1:12310706/101‑1 (MQ=255) ggCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATg < 1:2051334/101‑1 (MQ=255) cgcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGTCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCg < 1:7361775/101‑1 (MQ=255) cgcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCg < 1:276581/101‑1 (MQ=255) cgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAc > 1:5944120/1‑101 (MQ=255) gcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc > 1:8778336/1‑101 (MQ=255) aGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCgg < 1:3066986/101‑1 (MQ=255) ggATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCggg > 1:11816257/1‑101 (MQ=255) aTGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGt < 1:10738887/101‑1 (MQ=255) aTGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGt > 1:12880467/1‑101 (MQ=255) cTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTaa > 1:2565514/1‑101 (MQ=255) gTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAac < 1:6643085/101‑1 (MQ=255) gTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAac < 1:3445008/101‑1 (MQ=255) gTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAac < 1:955281/101‑1 (MQ=255) gTCGGCTTCCA‑‑GCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAacac < 1:12032104/101‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACAcg > 1:4971074/1‑101 (MQ=255) cTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACAcgcc < 1:3828697/101‑1 (MQ=255) cTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACAcgcc > 1:3726276/1‑101 (MQ=255) ttCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACAcgccg > 1:12640997/1‑101 (MQ=255) ttCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACAcgccg > 1:4593162/1‑101 (MQ=255) tCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACAcgccgc > 1:10509135/1‑101 (MQ=255) cAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCaa < 1:11916745/101‑1 (MQ=255) aGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg > 1:14274482/1‑101 (MQ=255) aGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg < 1:5499468/101‑1 (MQ=255) gcgcgcgcgcGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAgg < 1:4051847/101‑1 (MQ=255) | CGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGG > NC_007779/3123970‑3124170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |