New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_007779 1907280 =2 (0.010)105 (0.490) 74/180 NT 98.1% intergenic (+307/‑122) yobD/yebN inner membrane protein/inner membrane protein
?NC_007779 = 2412225 NA (NA)intergenic (‑55/‑782) insA/yfbQ IS1 element protein/aminotransferase

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  NC_007779/1907379‑1907280
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT  <  NC_007779/2412225‑2412140
                                                                                                                                                                                          
CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGG                                                                                       <  1:4868327/101‑1
 CATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGG                                                                                      >  1:2720020/1‑101
  ATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGT                                                                                     <  1:5480647/101‑1
  ATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGT                                                                                     <  1:14155820/101‑1
    AAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGA                                                                                   <  1:1641561/101‑1
    AAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGA                                                                                   >  1:14339974/1‑101
    AAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGA                                                                                   <  1:8883500/101‑1
     AAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGAT                                                                                  <  1:7794450/101‑1
        CACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCT                                                                               >  1:10452956/1‑101
         accttcTCGCCCCAAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTG                                                                              <  1:14148139/95‑1
           ATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCC                                                                            >  1:4360626/1‑101
           ATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCC                                                                            <  1:4051371/101‑1
           ATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCC                                                                            >  1:9200859/1‑101
              ATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAAC                                                                         >  1:6703598/1‑101
              ATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAAC                                                                         <  1:7029042/101‑1
              ATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAAC                                                                         <  1:14996926/101‑1
                CGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTT                                                                       >  1:10812447/1‑101
                CGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTT                                                                       <  1:8522119/101‑1
                 GCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTA                                                                      <  1:11965687/101‑1
                 GCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTA                                                                      >  1:8256438/1‑101
                 GCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTA                                                                      >  1:14087817/1‑101
                  CCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTAC                                                                     <  1:114599/101‑1
                   CCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACT                                                                    >  1:5265610/1‑101
                   CCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACT                                                                    >  1:11540655/1‑101
                   CCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACT                                                                    <  1:2340333/101‑1
                   CCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACT                                                                    >  1:15119361/1‑101
                    CCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTG                                                                   <  1:10308052/101‑1
                    CCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTG                                                                   <  1:1651301/101‑1
                    CCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTG                                                                   >  1:8123818/1‑101
                     CCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGCTGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA                                                                  >  1:14088777/1‑101
                     CCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA                                                                  >  1:13963178/1‑101
                     CCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGACGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA                                                                  >  1:10951091/1‑101
                      CAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT                                                                 >  1:10949555/1‑101
                      CAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT                                                                 >  1:6444309/1‑101
                       AGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT                                                                <  1:4287857/101‑1
                       AGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT                                                                >  1:12122916/1‑101
                       AGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT                                                                >  1:12150541/1‑101
                       AGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT                                                                <  1:7750047/101‑1
                        GCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT                                                               <  1:5345338/101‑1
                         CAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA                                                              >  1:13290661/1‑101
                          AAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG                                                             >  1:3982827/1‑101
                             CATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT                                                          >  1:1869131/1‑101
                              ATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA                                                         >  1:625732/1‑101
                              ATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA                                                         <  1:13517232/101‑1
                               TGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCTCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT                                                        <  1:8264061/101‑1
                               TGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT                                                        <  1:3758221/101‑1
                                  ATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT                                                     >  1:4667339/1‑101
                                  ATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT                                                     <  1:10957886/101‑1
                                  ATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT                                                     <  1:8031955/101‑1
                                       aGAACAACAAGGCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT                                                <  1:15070749/100‑1
                                        GAACAACAAGCCGTGTTGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT                                               >  1:5211287/1‑101
                                         AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT                                              <  1:12971299/101‑1
                                         AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT                                              >  1:9340896/1‑101
                                           CAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT                                            <  1:6469077/101‑1
                                            AACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG                                           <  1:3869803/101‑1
                                             ACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA                                          <  1:11947762/101‑1
                                             ACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCAGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA                                          >  1:10625186/1‑101
                                                 GCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG                                      <  1:12768403/101‑1
                                                  CCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGTCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC                                     <  1:4901176/101‑1
                                                   CGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT                                    >  1:4002001/1‑101
                                                   CGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT                                    >  1:14079402/1‑101
                                                     TGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC                                  <  1:13097475/101‑1
                                                      GATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA                                 >  1:9758095/1‑101
                                                       ATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG                                >  1:6092926/1‑101
                                                        TGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT                               <  1:10535050/101‑1
                                                         GGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGTATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG                              <  1:8021213/101‑1
                                                          GTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG                             <  1:2727700/101‑1
                                                           TTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC                            >  1:4083630/1‑101
                                                           TTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC                            >  1:3663399/1‑101
                                                            TTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT                           >  1:13721319/1‑101
                                                             TTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT                          <  1:9381149/101‑1
                                                             TTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT                          >  1:1818870/1‑101
                                                             TTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT                          >  1:2908096/1‑101
                                                                 CGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT                      <  1:11142177/101‑1
                                                                 CGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT                      >  1:3888733/1‑101
                                                                 CGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT                      >  1:3282567/1‑101
                                                                     CATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT                  <  1:4548008/101‑1
                                                                      ATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA                 >  1:12131013/1‑101
                                                                      ATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA                 >  1:5537497/1‑101
                                                                      ATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA                 >  1:6430705/1‑101
                                                                       TGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT                >  1:5844414/1‑101
                                                                        GCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC               >  1:11472/1‑101
                                                                         CAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA              <  1:5590119/101‑1
                                                                         CAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA              <  1:13422832/101‑1
                                                                         CAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA              <  1:4155561/101‑1
                                                                          AGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG             >  1:9321941/1‑101
                                                                           GGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC            <  1:3102511/101‑1
                                                                            GCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT           >  1:9007199/1‑101
                                                                             CATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG          >  1:7451568/1‑101
                                                                             CATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG          >  1:36440/1‑101
                                                                               TAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC        >  1:3136171/1‑101
                                                                                AGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC       >  1:4297432/1‑101
                                                                                  CGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT     <  1:13869660/101‑1
                                                                                  CGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT     >  1:13604736/1‑101
                                                                                  CGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT     >  1:8521871/1‑101
                                                                                   GATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC    <  1:8564936/101‑1
                                                                                   GATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC    <  1:1863265/101‑1
                                                                                     TTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT  >  1:12365768/1‑101
                                                                                     TTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT  >  1:14968887/1‑101
                                                                                     TTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT  <  1:9512446/101‑1
                                                                                                                                                                                          
CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  NC_007779/1907379‑1907280
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT  <  NC_007779/2412225‑2412140

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.