| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 2521057 | NA (NA) | 43 (0.210) | 32/174 | NT | 22.0% | intergenic (+168/+32) | insL/yfeA | transposase/diguanylate cyclase |
| ? | NC_007779 | = 3175170 | 158 (0.740) | coding (320/828 nt) | cpdA | cyclic 3',5'‑adenosine monophosphate phosphodiesterase | |||||
TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTatg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/2520958‑2521057‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGA < NC_007779/3175170‑3175068 TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA < 1:1023964/101‑1TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA < 1:8942604/101‑1TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA < 1:289005/101‑1TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA > 1:3746930/1‑101TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA < 1:4591742/101‑1TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA < 1:4885786/101‑1TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA > 1:1183967/1‑101TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA > 1:12007349/1‑101TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA < 1:7819704/101‑1TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA > 1:12484292/1‑101TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA < 1:12487402/101‑1TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTA > 1:13337975/1‑101 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAT > 1:2364481/1‑101 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAT < 1:2756180/101‑1 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAT < 1:3974792/101‑1 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAT < 1:7438459/101‑1 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAT < 1:7685321/101‑1 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAT < 1:787459/101‑1 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAT < 1:7953331/101‑1 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGCTAGCGCTTAT > 1:11247110/1‑101 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTATTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAT < 1:10265569/101‑1 ACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCC < 1:8640314/101‑1 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCC < 1:5863452/101‑1 AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGC > 1:14102686/1‑101 ATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCG < 1:5956159/101‑1 TTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGA > 1:336652/1‑101 GAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAG < 1:11533347/101‑1 GAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAG < 1:2695249/101‑1 GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGC < 1:5792816/101‑1 GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGC < 1:2688366/101‑1 ACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGT < 1:6088729/101‑1 CGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTG < 1:9732183/101‑1 GCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGT > 1:478454/1‑101 GAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTT < 1:3229964/101‑1 CATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTG < 1:3136415/101‑1 CGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTG > 1:2529666/1‑101 ACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATG < 1:14064826/101‑1 AGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCA > 1:13329696/1‑101 CACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAAT < 1:13620069/101‑1 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATC > 1:5246442/1‑101 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATC < 1:4759584/101‑1 CCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCC < 1:3067235/101‑1 GAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCTTG < 1:10358093/101‑1 GCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTG < 1:5044971/101‑1 CGCATTCTTCAGATGGTTCGACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGG > 1:9281243/1‑101 CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGAT > 1:2814443/1‑101 CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGAT > 1:2329940/1‑101 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATA > 1:14339856/1‑101 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATA > 1:9410940/1‑101 TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAG < 1:9141363/101‑1 CAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGG > 1:3438225/1‑101 CAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGG > 1:2048842/1‑101 AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGT < 1:11316014/101‑1 taccaCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG‑GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTT > 1:11344532/6‑101 GGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTT < 1:12392985/101‑1 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGG > 1:3792088/1‑101 aCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG‑GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCG < 1:10827416/100‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCG < 1:13815572/101‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCG < 1:9540816/101‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATG‑GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTG > 1:5777499/1‑101 CCTTAAGTTAGCGCTTATG‑GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCG > 1:7879212/1‑101 AAGTTAGCGCTTATG‑GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACG > 1:658600/1‑101 GTTAGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGG > 1:795200/1‑101 AGCGCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGA < 1:361061/101‑1 GCTTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCT < 1:2958785/101‑1 TTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGA > 1:5779812/1‑101 TTATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGA > 1:14481903/1‑101 TATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAG < 1:13748159/101‑1 ATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGTGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGC > 1:2536836/1‑101 ATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGC < 1:13658750/101‑1 ATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGC < 1:146550/101‑1 TGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCG > 1:7738585/1‑101 TGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCG > 1:7283701/1‑101 TGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCG > 1:13919290/1‑101 GCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGA > 1:7752791/1‑101 GCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGA < 1:1859820/101‑1 GCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGA > 1:10315309/1‑101 TGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTatg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/2520958‑2521057‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGCGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGA < NC_007779/3175170‑3175068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |