| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 224,796 | G→T | 1.8% | noncoding (1026/1542 nt) | rrsH → | 16S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 224,796 | 0 | G→T | 1.8% | 2.6 0.0 ‑0.0 | 227 | noncoding (1026/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (113/110): total (115/112) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.99e-01 | ||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTT > NC_007779/224696‑224896 | ggggCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCTGAGATGGATTGGTg > 1:12387589/1‑101 (MQ=255) ccGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTc < 1:7937998/101‑1 (MQ=255) cGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCg < 1:15068994/101‑1 (MQ=255) cGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCg > 1:13981368/1‑101 (MQ=255) cacaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCggg > 1:6846448/1‑101 (MQ=255) acaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGa > 1:4799711/1‑101 (MQ=255) caAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGaa < 1:1087008/101‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAAc < 1:11888770/101‑1 (MQ=255) aGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACt < 1:5900993/101‑1 (MQ=255) aGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACt > 1:3563314/1‑101 (MQ=255) aGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACt < 1:13304374/101‑1 (MQ=255) gCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtg < 1:6146807/101‑1 (MQ=255) gCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtg < 1:12181007/101‑1 (MQ=255) ggTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtgtg < 1:1522669/101‑1 (MQ=255) tGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgag > 1:5804967/1‑101 (MQ=255) tGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgag < 1:12977116/101‑1 (MQ=255) gAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGAc < 1:6213920/101‑1 (MQ=255) gAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGAc < 1:7123474/101‑1 (MQ=255) aGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACa > 1:9024086/1‑101 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg > 1:10049672/1‑101 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg > 1:14989331/1‑101 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg > 1:1231117/1‑101 (MQ=255) aTGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGt > 1:6045947/1‑101 (MQ=255) tgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgct < 1:7316021/101‑1 (MQ=255) ggTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:10817158/1‑101 (MQ=255) ggTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:10281396/1‑101 (MQ=255) gTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctgc < 1:11019855/101‑1 (MQ=255) gTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctgc > 1:4351575/1‑101 (MQ=255) gTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctgc > 1:4963624/1‑101 (MQ=255) tAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATg < 1:4181130/101‑1 (MQ=255) aaTTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATgg > 1:965830/1‑101 (MQ=255) aaTTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATgg < 1:302187/101‑1 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc < 1:635449/101‑1 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc > 1:14564595/1‑101 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc < 1:10321864/101‑1 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc < 1:6480761/101‑1 (MQ=255) tGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtcgt > 1:945297/1‑101 (MQ=255) gCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtcgtc > 1:6537271/1‑101 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa < 1:8543254/101‑1 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa < 1:11647021/101‑1 (MQ=255) aaCGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAg < 1:4296982/101‑1 (MQ=255) aaCGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAg > 1:6724864/1‑101 (MQ=255) aaCGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAg > 1:2305251/1‑101 (MQ=255) aaCGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACAGGATCGCGCCAGAGATGG‑‑TGTTTCCCTTGTGGCTTGT‑ATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCt < 1:8987711/101‑1 (MQ=2) cgcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCt < 1:2124289/101‑1 (MQ=255) cgcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCt < 1:4873013/101‑1 (MQ=255) gcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTc > 1:3880389/1‑101 (MQ=255) gcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTc > 1:8258489/1‑101 (MQ=255) cgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCg > 1:10541431/1‑101 (MQ=255) gaagaaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCgt < 1:5148809/101‑1 (MQ=255) agaaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCgtgt < 1:2029357/101‑1 (MQ=255) aaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGtgttg < 1:3279579/101‑1 (MQ=255) aCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGtgttgt > 1:2692377/1‑101 (MQ=255) aCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGtgttgt < 1:11345684/101‑1 (MQ=255) ccTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTtgtg < 1:10170801/101‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTTAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGa > 1:4122357/1‑101 (MQ=255) cTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGa < 1:5250980/101‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGa > 1:11219333/1‑101 (MQ=255) aCCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAAt > 1:8620394/1‑101 (MQ=255) aCCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAAt < 1:4980228/101‑1 (MQ=255) tGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGtt < 1:12637662/101‑1 (MQ=255) tGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGtt < 1:6685255/101‑1 (MQ=255) tGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGtt > 1:1338570/1‑101 (MQ=255) ggTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTg > 1:1206222/1‑101 (MQ=255) gTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTgg > 1:2868996/1‑101 (MQ=255) cTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGt > 1:12770592/1‑101 (MQ=255) ttGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGtt > 1:9300492/1‑101 (MQ=255) tGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTa < 1:9218981/101‑1 (MQ=255) tGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTa > 1:11178196/1‑101 (MQ=255) tGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTa > 1:4622671/1‑101 (MQ=255) tGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTa < 1:3814164/101‑1 (MQ=255) tGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTa < 1:1885099/101‑1 (MQ=255) gACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTaa < 1:3401834/101‑1 (MQ=255) aTCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTc > 1:12866515/1‑101 (MQ=255) tCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTcc > 1:14191444/1‑101 (MQ=255) caca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCg < 1:7852403/101‑1 (MQ=255) aca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGc > 1:7719072/1‑101 (MQ=255) aca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGc > 1:7193304/1‑101 (MQ=255) a‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCTGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCaa < 1:9064132/101‑1 (MQ=255) gAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAAc < 1:14941506/101‑1 (MQ=255) gAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAAc < 1:6766004/101‑1 (MQ=255) aaCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACg > 1:12693919/1‑101 (MQ=255) aaCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACg > 1:7374043/1‑101 (MQ=255) aaCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACg > 1:5788972/1‑101 (MQ=255) aCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGa < 1:14060748/101‑1 (MQ=255) aCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGa < 1:15102522/101‑1 (MQ=255) cTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAg < 1:5240509/101‑1 (MQ=255) tttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgc > 1:1594547/1‑101 (MQ=255) ttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgcg < 1:6947627/101‑1 (MQ=255) ccAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCa < 1:11596191/101‑1 (MQ=255) cAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCaa > 1:14293621/1‑101 (MQ=255) ggagaTGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAc > 1:9536565/2‑101 (MQ=255) aTGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCtt > 1:4682524/1‑101 (MQ=255) gATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATc > 1:2397881/1‑101 (MQ=38) aTTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCt > 1:9723572/1‑101 (MQ=38) tGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACGGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCttt < 1:13746936/101‑1 (MQ=38) tGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCttt > 1:4930776/1‑101 (MQ=39) ggTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCtttt < 1:1897555/101‑1 (MQ=37) tGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTttgt > 1:3728728/1‑101 (MQ=37) gCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTttgtt > 1:4417403/1‑101 (MQ=35) | GGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTT > NC_007779/224696‑224896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |