| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 224,887 | A→G | 29.0% | noncoding (1117/1542 nt) | rrsH → | 16S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 224,887 | 0 | A→G | 29.0% | 0.0 ‑3.4 ‑2.2 | 352 | noncoding (1117/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (68/34): ref base (134/116): total (202/150) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.22e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.05e-03 | ||||||||||
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
GGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAC > NC_007779/224788‑224987 | aTTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCt > 1:9723572/1‑101 (MQ=38) ttGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCtt > 1:7371277/1‑101 (MQ=39) tGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACGGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCttt < 1:13746936/101‑1 (MQ=38) gCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTttgtt > 1:4417403/1‑101 (MQ=35) cTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGc < 1:8538043/101‑1 (MQ=35) cTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGc > 1:14638502/1‑101 (MQ=35) ttCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGcc < 1:12189844/101‑1 (MQ=35) tCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCa < 1:2994705/101‑1 (MQ=35) tCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCa > 1:3159848/1‑101 (MQ=35) gAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTTGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑g‑g < 1:5689182/101‑1 (MQ=25) aaCTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑Gt > 1:15187687/1‑101 (MQ=35) aCTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTc > 1:5514501/1‑101 (MQ=35) tgtgAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTccg > 1:8246590/1‑101 (MQ=33) tgtgAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTccg < 1:5893182/101‑1 (MQ=34) agaCAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTccggccg > 1:13157384/1‑101 (MQ=32) aCAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCggg < 1:6570857/101‑1 (MQ=32) cAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGa < 1:7172005/101‑1 (MQ=33) aGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGaa > 1:10296932/1‑101 (MQ=32) aGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGaa < 1:9959662/101‑1 (MQ=33) ggTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAAc > 1:8026786/1‑101 (MQ=32) gctgcATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCa < 1:12660899/101‑1 (MQ=33) ctgcATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCaa > 1:15100232/1‑101 (MQ=32) tgcATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCaaa < 1:7052385/101‑1 (MQ=33) gcATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAg < 1:4059401/101‑1 (MQ=33) cATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAgg > 1:12090074/1‑101 (MQ=32) aTGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGga > 1:5243041/1‑101 (MQ=32) aTGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGga > 1:9196839/1‑101 (MQ=32) aTGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGga < 1:10237479/101‑1 (MQ=33) tGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGgag > 1:5126846/1‑101 (MQ=32) tGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGgag < 1:2782004/101‑1 (MQ=33) gCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGAc > 1:10727797/1‑101 (MQ=32) gCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGAc < 1:14420864/101‑1 (MQ=32) gCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGAc < 1:13423386/101‑1 (MQ=33) tGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTg > 1:11127997/1‑101 (MQ=32) tGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTg > 1:4223715/1‑101 (MQ=32) cgtcAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCa > 1:3275239/1‑101 (MQ=32) gtcAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAg < 1:4642644/101‑1 (MQ=32) gtcAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAg > 1:12861624/1‑101 (MQ=32) gtcAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAg > 1:3776060/1‑101 (MQ=32) tcAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGt > 1:6371931/1‑101 (MQ=32) gCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGAt > 1:8342701/1‑101 (MQ=32) cTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATa > 1:6995967/1‑101 (MQ=32) cTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATa < 1:11373322/101‑1 (MQ=32) cGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATaaa > 1:13938631/1‑101 (MQ=32) tgttgtGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACt < 1:8723611/101‑1 (MQ=32) tgttgtGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACt < 1:14967489/101‑1 (MQ=32) aaaTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGaa > 1:7118751/1‑101 (MQ=32) gTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTg > 1:1368628/1‑101 (MQ=33) ttGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTgg > 1:12335287/1‑101 (MQ=33) tGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTggg < 1:1180983/101‑1 (MQ=32) ggTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGa < 1:3483047/101‑1 (MQ=32) gTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGAt > 1:4335639/1‑101 (MQ=33) ttAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATg > 1:9541269/1‑101 (MQ=32) tAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGa > 1:14103126/1‑101 (MQ=33) aaGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGa > 1:12506198/1‑101 (MQ=2) aaGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGAc > 1:8401583/1‑101 (MQ=32) aGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGAc > 1:1416745/1‑101 (MQ=2) aGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGAc > 1:10802414/1‑101 (MQ=2) aGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGAc > 1:13255388/1‑101 (MQ=2) tCCCGCAACGAGCGCAGCCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGt < 1:2375904/101‑1 (MQ=2) tCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTc > 1:14829211/1‑101 (MQ=33) cccGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTc > 1:4159256/1‑101 (MQ=2) cccGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTc > 1:10848086/1‑101 (MQ=2) ccGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCa < 1:3370038/101‑1 (MQ=2) ccGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCa > 1:8158103/1‑101 (MQ=2) ccGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCC‑GGGGTTAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCa < 1:14695516/101‑1 (MQ=2) ccGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCaa > 1:7525210/1‑101 (MQ=33) cGCCACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCaa < 1:3012074/101‑1 (MQ=2) cGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTATGTTGCCAG‑CAC‑GTTGTGGTGGGGACTCGTAAGAAACTGCCGGGGTTAACTC‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCaa > 1:1937119/1‑101 (MQ=2) 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cAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGcc > 1:6217886/1‑101 (MQ=32) aaCCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGccc > 1:7675972/1‑101 (MQ=32) cccTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCtt < 1:3114711/101‑1 (MQ=32) cccTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCtt > 1:4870501/1‑101 (MQ=32) cccTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCtt > 1:5481315/1‑101 (MQ=32) ccTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTa > 1:2074112/1‑101 (MQ=32) cTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTAc > 1:2144383/1‑101 (MQ=32) cTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTAc < 1:4601731/101‑1 (MQ=32) tATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGa > 1:7885086/1‑101 (MQ=32) aTCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAc > 1:2299803/1‑101 (MQ=32) | GGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAG‑C‑G‑GTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACT‑GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAC > NC_007779/224788‑224987 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |