| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 13,320 | A→C | 15.5% | V386V (GTA→GTC) | dnaK → | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_007779 | 13,320 | 0 | A→C | 15.5% | 157.3 0.0 ‑0.0 | 309 | V386V (GTA→GTC) | dnaK | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (22/26): ref base (117/144): total (139/170) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.99e-01 | ||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
TTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGA > NC_007779/13220‑13420 | tGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaa > 1:4661463/1‑101 (MQ=255) gCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaaa < 1:5565226/101‑1 (MQ=255) aGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGAc < 1:5271239/101‑1 (MQ=255) gTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACg < 1:11425656/101‑1 (MQ=255) ttCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGt < 1:13501119/101‑1 (MQ=255) tCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTa < 1:4469940/101‑1 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ccGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGt < 1:2186169/101‑1 (MQ=255) ccGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGt < 1:942008/101‑1 (MQ=255) gaacaagggcGTTAACCCGGACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTa > 1:12342928/10‑101 (MQ=255) gTAGAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcc > 1:14991895/1‑101 (MQ=255) gTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcc > 1:8495074/1‑101 (MQ=255) gTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcc > 1:9196034/1‑101 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc > 1:15142301/1‑101 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc > 1:1273245/1‑101 (MQ=255) aaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCg > 1:12884415/1‑101 (MQ=255) aaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCg > 1:14459535/1‑101 (MQ=255) cGTTAACCCGGACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGt > 1:6521246/1‑101 (MQ=255) cGTTAACCCGGACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGt > 1:7879886/1‑101 (MQ=255) cGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGt < 1:550317/101‑1 (MQ=255) gTTAACCCGGACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGtc > 1:3060260/1‑101 (MQ=255) gTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGtc < 1:2649701/101‑1 (MQ=255) gTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGtc > 1:957895/1‑101 (MQ=255) ttAACCCGGACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGtcg < 1:2296327/101‑2 (MQ=255) ttAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGtct < 1:8063753/101‑1 (MQ=255) tAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGtctc < 1:14251632/101‑1 (MQ=255) tAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGtctc < 1:5200794/101‑1 (MQ=255) aaCCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGGGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTctct > 1:11975255/1‑101 (MQ=255) aCCCGGACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTg > 1:1480935/1‑101 (MQ=255) cccGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTgg > 1:12662971/1‑101 (MQ=255) ccGGACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTggg > 1:13253105/1‑101 (MQ=255) gACGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTAt < 1:10148292/101‑1 (MQ=255) gACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTAt < 1:3679146/101‑1 (MQ=255) aCGAGGTTGTCGCAGTTGGTGCTGCTCTGCAGGCCGGCGTTCTGCGCGGTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTAtt < 1:12373126/101‑2 (MQ=255) aCGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATc > 1:9730000/1‑101 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |