| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 13,403 | A→G | 12.9% | K414R (AAA→AGA) | dnaK → | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 13,403 | 0 | A→G | 12.9% | 89.0 ‑2.3 ‑0.0 | 262 | K414R (AAA→AGA) | dnaK | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (21/13): ref base (105/123): total (126/136) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 9.95e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.01e-01 | ||||||||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
GTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAACGT > NC_007779/13303‑13503 | ttCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGaaa < 1:10055631/101‑1 (MQ=255) ttCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGaaa < 1:6382793/101‑1 (MQ=255) tCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGaaaa < 1:6179805/101‑1 (MQ=255) tGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAac < 1:9297419/101‑1 (MQ=255) tGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAac > 1:7631309/1‑101 (MQ=255) gACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAaca < 1:11052334/101‑1 (MQ=255) gcTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTGCCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAacac < 1:3588026/100‑1 (MQ=255) cggTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAAcacca > 1:11913287/2‑101 (MQ=255) gTGAGGTCAAGGACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGGGCAACACCACt > 1:4047689/1‑101 (MQ=255) gTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACt < 1:8011773/101‑1 (MQ=255) tGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTa < 1:10919644/101‑1 (MQ=255) gACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTAt > 1:7306029/1‑101 (MQ=255) aCGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATc < 1:2327351/101‑1 (MQ=255) aCGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATc > 1:7795509/1‑101 (MQ=255) gTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATccc > 1:1978430/1‑101 (MQ=255) tAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCg < 1:4147142/101‑1 (MQ=255) tAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCg > 1:1049176/1‑101 (MQ=255) tAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCg < 1:1619694/101‑1 (MQ=255) aaaaGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGa > 1:9031682/1‑101 (MQ=255) aGACGTACTGCTGCTGTACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCa > 1:12469359/1‑101 (MQ=255) aGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCa < 1:5047557/101‑1 (MQ=255) gACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCaa < 1:12758494/101‑1 (MQ=255) gACGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCaa < 1:7566988/101‑1 (MQ=255) aCGTGCTGCTGCTCGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAg > 1:13380766/1‑101 (MQ=255) cGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑c < 1:5901343/101‑1 (MQ=255) cGTACTGCTGCTGGACGTCACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑c < 1:11272800/101‑1 (MQ=255) gtgctgctgctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAG‑cg > 1:12400602/4‑100 (MQ=255) gtgctgctgctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAG‑cg < 1:5010280/98‑2 (MQ=255) gTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑ca < 1:5334018/101‑1 (MQ=255) tACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑cac > 1:9243850/1‑101 (MQ=255) gctgctgctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAG‑cgtt > 1:2565541/2‑98 (MQ=255) tgctgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGc < 1:15105009/101‑1 (MQ=255) tgctgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGc < 1:3525415/101‑1 (MQ=255) ctgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCa > 1:14437417/1‑101 (MQ=255) tgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAg > 1:14557492/1‑101 (MQ=255) tgctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAg < 1:2401038/101‑1 (MQ=255) tgctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAG‑cgttctgag > 1:8464595/1‑93 (MQ=255) tgctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAG‑cgttcggag > 1:8035914/1‑93 (MQ=255) gctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAgg > 1:2783318/1‑101 (MQ=255) gctcGACGTTACCCCGCTGTCGCTGGGTATTGAGACCAAGGGCGGTGTCATGACCAAGCTGATCGAGCGCAACACCACTATCCCGACCAAG‑cgttcggaga > 1:9172838/1‑92 (MQ=255) ctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGgt < 1:1330249/101‑1 (MQ=255) ctgGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGgt < 1:8896873/101‑1 (MQ=255) ggACGTTGCCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCAGGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGgtgt < 1:3945291/101‑1 (MQ=255) ggACGTTCCCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGgtgt < 1:11480103/101‑1 (MQ=255) gACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGtt > 1:9535726/1‑101 (MQ=255) gACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGtt > 1:14762747/1‑101 (MQ=255) aCGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGGGGGTTGACGCCGCTGA‑CGCGAAAAACCCCAATATCCCCACCCAGCCACACCCAGGTGTtc > 1:5223523/1‑101 (MQ=255) cGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTtct < 1:13941451/101‑1 (MQ=255) ttcccccGCTGTCTGGGGGTATAGAAACCATGGGGTGTGTGAGGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTctct < 1:6824919/98‑1 (MQ=255) ttACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTctct < 1:4113451/101‑1 (MQ=255) tACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTCTGTTGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTa < 1:10619326/101‑1 (MQ=255) aCCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTAc < 1:9736830/101‑1 (MQ=255) ccccGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTAcc > 1:13741995/1‑101 (MQ=255) cccGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCg > 1:3556963/1‑101 (MQ=255) cGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCt < 1:8973410/101‑1 (MQ=255) cGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCt > 1:10225626/1‑101 (MQ=255) cGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCt < 1:6614166/101‑1 (MQ=255) tctcTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACGCCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGa < 1:10108929/101‑1 (MQ=255) ctctGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGAc < 1:7459250/101‑1 (MQ=255) ctctGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGAc > 1:6881220/1‑101 (MQ=255) ctctGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGAc > 1:4434496/1‑101 (MQ=255) ctctGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGAc < 1:5122354/101‑1 (MQ=255) tctGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACa > 1:10173480/1‑101 (MQ=255) tATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGt < 1:11207601/101‑1 (MQ=255) tCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCt > 1:6243661/1‑101 (MQ=255) aaCCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCgg > 1:7057484/1‑101 (MQ=255) aaCCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCgg < 1:1939455/101‑1 (MQ=255) ccATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTa < 1:6100003/101‑1 (MQ=255) ccATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTa < 1:14889407/101‑1 (MQ=255) tGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAcc < 1:4817368/101‑1 (MQ=255) ggCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAccat < 1:12180131/101‑1 (MQ=255) gCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAccatc > 1:14149282/1‑101 (MQ=255) ggTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAccatcca < 1:1549958/101‑1 (MQ=255) ggTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAccatcca > 1:11109438/1‑101 (MQ=255) ggTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAAccatcca > 1:14452386/1‑101 (MQ=255) gtgATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCAtgt < 1:3435101/101‑1 (MQ=255) tgatgaCGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCAtgtg > 1:12303179/1‑101 (MQ=255) gatgaCGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGtgc < 1:8288275/101‑1 (MQ=255) atgaCGCCGCTGATCGCGAAAACCACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTCCCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGCTAACCATCCATGtgct < 1:1447114/101‑1 (MQ=255) gacgacGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGtgctgc < 1:399659/101‑1 (MQ=255) gacgacGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGtgctgc < 1:4336352/101‑1 (MQ=255) cgacgCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAg > 1:3745081/1‑101 (MQ=255) cgacgCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAg < 1:588362/101‑1 (MQ=255) gCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTg < 1:2688822/101‑1 (MQ=255) cTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGa > 1:3335030/1‑101 (MQ=255) tGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGaa > 1:9419460/1‑101 (MQ=255) aTCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACg < 1:8806758/101‑1 (MQ=255) cgcgAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTa > 1:8108645/1‑101 (MQ=255) gcgAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTaa > 1:2235601/1‑101 (MQ=255) gcgAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTaa < 1:3179325/101‑1 (MQ=255) gcgAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTaa > 1:12849846/1‑101 (MQ=255) gcgAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTaa < 1:13080671/101‑1 (MQ=255) gcgAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTaa > 1:6260679/1‑101 (MQ=255) cgAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTaaa < 1:7249245/101‑1 (MQ=255) cgAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTaaa > 1:5503701/1‑101 (MQ=255) gAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAAc > 1:796754/1‑101 (MQ=255) gAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAAc > 1:4634959/1‑101 (MQ=255) aaaaaCACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAACg > 1:5623174/1‑101 (MQ=255) aaaaCACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAACGt < 1:11626317/101‑1 (MQ=255) aaaaCACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAACGt > 1:5603235/1‑101 (MQ=255) | GTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAG‑CACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCATCCATGTGCTGCAGGGTGAACGTAAACGT > NC_007779/13303‑13503 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |