| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,033,081 | A→G | 6.5% | G250G (GGT→GGC) | lysS ← | lysine tRNA synthetase |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,033,081 | 0 | A→G | 6.5% | 35.8 ‑0.8 ‑0.2 | 263 | G250G (GGT→GGC) | lysS | lysine tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/7): ref base (118/128): total (128/135) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.57e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.32e-01 | ||||||||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
AAGCCATGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGACGCGCAGCGGCA > NC_007779/3032981‑3033180 | aaGCCATGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGcca > 1:7280995/1‑101 (MQ=255) aGCCATGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGccac > 1:10412722/1‑101 (MQ=255) gCCATGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGccacc > 1:3421633/1‑101 (MQ=255) cATGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCaccaa > 1:4751427/1‑101 (MQ=255) aTGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCaccaac < 1:11025241/101‑1 (MQ=255) aTGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCaccaac < 1:4244878/101‑1 (MQ=255) tGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCaccaacc > 1:1846114/1‑101 (MQ=255) agagTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAaccac‑c > 1:14775536/1‑101 (MQ=255) agagTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAaccac‑c < 1:11700570/101‑1 (MQ=255) gTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGa < 1:5694033/101‑1 (MQ=255) ttCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGAc < 1:12527209/101‑1 (MQ=255) tCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACg < 1:13029285/101‑1 (MQ=255) catcatGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCt < 1:14465864/101‑1 (MQ=255) atcatGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCtt < 1:2031048/101‑1 (MQ=255) tcatGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTg < 1:643271/101‑1 (MQ=255) tcatGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTg > 1:13166255/1‑101 (MQ=255) atGGTGAACTCTGGGTTACGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAg < 1:12468542/101‑1 (MQ=255) gTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTa < 1:9146844/101‑1 (MQ=255) gAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACa > 1:5832290/1‑101 (MQ=255) gAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACa < 1:1930299/101‑1 (MQ=255) aaCTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAg > 1:1119738/1‑101 (MQ=255) ctGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTcc > 1:12205562/1‑101 (MQ=255) ctGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTcc > 1:3910787/1‑101 (MQ=255) ctGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTcc < 1:6932175/101‑1 (MQ=255) tGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACATGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCg < 1:14701386/101‑1 (MQ=255) tGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCg < 1:8789932/101‑1 (MQ=255) tGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCg < 1:6307757/101‑1 (MQ=255) tGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCg < 1:10073461/101‑1 (MQ=255) gggTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGTATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCgg > 1:3183677/1‑101 (MQ=255) gggTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGGAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCgg > 1:3610122/1‑101 (MQ=255) tATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGcgcg < 1:12952951/101‑1 (MQ=255) tATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGcgcg > 1:6747682/1‑101 (MQ=255) tATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGcgcg < 1:3786957/101‑1 (MQ=255) tATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGcgcg > 1:5601928/1‑101 (MQ=255) aTGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGa > 1:2420895/1‑101 (MQ=255) tGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGAt < 1:10938334/101‑1 (MQ=255) tGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGAt > 1:5517456/1‑101 (MQ=255) cGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACg > 1:9878515/1‑101 (MQ=255) gTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGc < 1:795188/101‑1 (MQ=255) tACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCa > 1:7409775/1‑101 (MQ=255) tACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCa < 1:7720074/101‑1 (MQ=255) tACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGGTGATTTTGAATACACGCTCGCAGCCACCAACCAC‑CACACCCCTGAGGGACAAGTCCGGcgcggtgagca > 1:13059780/1‑94 (MQ=255) cGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAgg > 1:113032/1‑101 (MQ=255) cGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAgg < 1:9304843/101‑1 (MQ=255) cGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAgg > 1:10192198/1‑101 (MQ=255) tcgatgccctCGTTACGGAAGTTACGGTTAATCTCAAAGACTCGCTCCATACCGCCGACGACGCAG‑CGCTTGAGGAAAAGCTCCGGCGCGATGCGCAGGTa > 1:271925/10‑101 (MQ=255) cgatgccctCGTTACGGAAGTTACGGTTAATCTCAAAGACTCGCTCCATACCGCCGACGACGCAG‑CGCTTGAGGAAAAGCTCCGGCGCGATGCGCAGGTag < 1:721597/93‑2 (MQ=255) cgatgccctCGTTACGGAAGTTACGGTTAATCTCAAAGACTCGCTCCATACCGCCGACGACGCAG‑CGCTTGAGGAAAAGCTCCGGCGCGATGCGCAGGTag > 1:6260077/9‑100 (MQ=255) gatgccctCGTTACGGAAGTTACGGTTAATCTCAAAGACTCGCTCCATACCGCCGACGACGCAG‑CGCTTGAGGAAAAGCTCCGGCGCGATGCGCAGGTaga < 1:1664038/94‑3 (MQ=255) aaTACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACa > 1:6624167/1‑101 (MQ=255) tgccctCGTTACGGAAGTTACGGTTAATCTCAAAGACTCGCTCCATACCGCCGACGACGCAG‑CGCTTGAGGAAAAGCTCCGGCGCGATGCGCAGGTagaga > 1:2488896/6‑97 (MQ=255) tACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATg > 1:2552675/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGGCGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGt > 1:10290351/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGt < 1:12684614/101‑1 (MQ=255) cctCGTTACGGAAGTTACGGTTAATCTCAAAGACTCGCTCCATACCGCCGACGACGCAG‑CGCTTGAGGAAAAGCTCCGGCGCGATGCGCAGGTagagatca > 1:11530978/3‑94 (MQ=255) cTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCg < 1:9102954/101‑1 (MQ=255) cTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCg > 1:8510187/1‑101 (MQ=255) ttACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATc > 1:6024499/1‑101 (MQ=255) ttACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATc > 1:8269378/1‑101 (MQ=255) cGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAg > 1:4404248/1‑101 (MQ=255) ggAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAgc < 1:8629300/101‑1 (MQ=255) ggAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAgc > 1:10745409/1‑101 (MQ=255) ggAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAgc < 1:11485867/101‑1 (MQ=255) gAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAgcg < 1:13700255/101‑1 (MQ=255) gAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAgcg < 1:2107622/101‑1 (MQ=255) aGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGcgcg > 1:9501301/1‑101 (MQ=255) gTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGt > 1:5092021/1‑101 (MQ=255) ttACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGtt > 1:11145660/1‑101 (MQ=255) ttACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGtt > 1:14826777/1‑101 (MQ=255) 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ttCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGa > 1:5132336/1‑101 (MQ=255) ttCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGa > 1:2877032/1‑101 (MQ=255) cGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATa < 1:11604305/101‑1 (MQ=255) cGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATa > 1:13516219/1‑101 (MQ=255) aaTACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATaaa > 1:15025701/1‑101 (MQ=255) aTACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAAc < 1:142921/101‑1 (MQ=255) aTACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAAc > 1:12378887/1‑101 (MQ=255) acacGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACgg > 1:1275220/1‑101 (MQ=255) acacGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACgg > 1:12790239/1‑101 (MQ=255) acacGCTCGAAGCCAACAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCAGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACgg < 1:12269444/101‑1 (MQ=255) acGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGAc < 1:13590271/101‑1 (MQ=255) acGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGAc < 1:7588869/101‑1 (MQ=255) cGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGAcg > 1:8428418/1‑101 (MQ=255) gCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGACGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGAcgc > 1:1461725/1‑101 (MQ=255) cGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGACGCGCa > 1:13409291/1‑101 (MQ=255) gAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGACGCGCAg < 1:1777375/101‑1 (MQ=255) ccaccaACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGACGCGCAGCGGc < 1:4088181/101‑1 (MQ=255) | AAGCCATGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCTGGGTTATGACGTACGGAAATACCTTCGTTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACACGCTCGAAGCCACCAACCAC‑CAGACGCTTGAGGTACAGTTCCGGCGCGATACGCAGGTACATGTCGAGATCCAGCGCGTTATGGTGGGTGATAAACGGACGCGCAGCGGCA > NC_007779/3032981‑3033180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |