| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,270,195 | G→T | 5.4% | intergenic (+738/+285) | yhaC → / ← garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,270,195 | 0 | G→T | 5.4% | 26.1 ‑1.5 ‑0.0 | 223 | intergenic (+738/+285) | yhaC/garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/9): ref base (96/115): total (99/124) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.35e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.29e-01 | ||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCG > NC_007779/3270095‑3270294 | gTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTg < 1:5485299/101‑1 (MQ=255)gTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTg < 1:8042908/101‑1 (MQ=255) tCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGc < 1:9640643/101‑1 (MQ=255) gTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCtt > 1:10219331/1‑101 (MQ=255) cGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGc > 1:4526070/1‑101 (MQ=255) gTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCt > 1:6293054/1‑101 (MQ=255) gTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCt > 1:7922213/1‑101 (MQ=255) tGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTc > 1:3866136/1‑101 (MQ=255) ggACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTcc > 1:12608296/1‑101 (MQ=255) ggACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTcc < 1:1710139/101‑1 (MQ=255) aCAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCgg > 1:9740493/1‑101 (MQ=255) cAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCggg < 1:1546217/101‑1 (MQ=255) aGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGt < 1:7352154/101‑1 (MQ=255) gTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTg < 1:8748551/101‑1 (MQ=255) ttcatCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGt > 1:15021920/1‑101 (MQ=255) tcatCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGtt > 1:7079307/1‑101 (MQ=255) catCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGttt < 1:11559410/101‑1 (MQ=255) atCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTa > 1:8130462/1‑101 (MQ=255) atCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTa < 1:5596128/101‑1 (MQ=255) tCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTAc > 1:13209632/1‑101 (MQ=255) aGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGt > 1:5232015/1‑101 (MQ=255) aGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGt < 1:8782081/101‑1 (MQ=255) gCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGc < 1:11687035/101‑1 (MQ=255) ccAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGcc > 1:3092251/1‑101 (MQ=255) cAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACgg > 1:910247/1‑101 (MQ=255) cAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACgg < 1:10147350/101‑1 (MQ=255) tCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACt > 1:4347243/1‑101 (MQ=255) tCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACt < 1:2976553/101‑1 (MQ=255) tCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACt > 1:6539509/1‑101 (MQ=255) cGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGTCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTg < 1:12068417/101‑1 (MQ=255) tCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa > 1:9225231/1‑101 (MQ=255) aCTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTAcc > 1:12395579/1‑101 (MQ=255) cTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCa > 1:5391383/1‑101 (MQ=255) cAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGGGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcg > 1:4932071/1‑101 (MQ=255) aaGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcgc > 1:3686728/1‑101 (MQ=255) agcagcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcgc‑g < 1:7766564/101‑1 (MQ=255) agcagcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcgc‑g < 1:9159095/101‑1 (MQ=255) agcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTg > 1:14845513/1‑101 (MQ=255) agcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTg > 1:6906935/1‑101 (MQ=255) gcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTgc > 1:3944051/1‑101 (MQ=255) gcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTgc < 1:3332465/101‑1 (MQ=255) cTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTgcgc < 1:1408424/101‑1 (MQ=255) tACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGct > 1:6647636/1‑101 (MQ=255) aCCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGctc > 1:7376867/1‑101 (MQ=255) cccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGctct < 1:15071600/101‑1 (MQ=255) cccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGctct > 1:14771188/1‑101 (MQ=255) gggTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAc < 1:1907058/101‑1 (MQ=255) ggTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAcc < 1:10993262/101‑1 (MQ=255) ttCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGc < 1:8232323/101‑1 (MQ=255) cAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCAc < 1:12170939/101‑1 (MQ=255) aGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCAcc > 1:162248/1‑101 (MQ=255) tACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCt < 1:11262640/101‑1 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:8354361/101‑1 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:9865323/101‑1 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:1835490/101‑1 (MQ=255) gggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTc < 1:5738754/101‑1 (MQ=255) gggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCGTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTc < 1:1080312/101‑1 (MQ=255) ggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCa < 1:11021989/101‑1 (MQ=255) gCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCAc < 1:357997/101‑1 (MQ=255) gCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCAc > 1:5796691/1‑101 (MQ=255) ccGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCAcc > 1:4435210/1‑101 (MQ=255) cGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCAccc < 1:9398747/101‑1 (MQ=255) cGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCAccc > 1:1183607/1‑101 (MQ=255) gTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTATCGCACCCTTTCACCCt > 1:11993315/1‑101 (MQ=255) gTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCt < 1:12742817/101‑1 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCtt < 1:11369556/101‑1 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCtt < 1:12081492/101‑1 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCtt < 1:13377224/101‑1 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa < 1:7564037/101‑1 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa < 1:10914899/101‑1 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa > 1:1922778/1‑101 (MQ=255) cTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAcc < 1:3920964/101‑1 (MQ=255) cTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAcc < 1:13542248/101‑1 (MQ=255) ttATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCt > 1:5997026/1‑101 (MQ=255) ttATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCt < 1:5652487/101‑1 (MQ=255) tATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTg < 1:6738555/101‑1 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGa > 1:14409974/1‑101 (MQ=255) tGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGAt > 1:14912271/1‑101 (MQ=255) tGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGATCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGAt > 1:9066878/1‑101 (MQ=255) gAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATc < 1:13762317/101‑1 (MQ=255) atgcgcgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATct < 1:6364450/94‑2 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCTCg < 1:10743358/101‑1 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCg < 1:4008412/101‑1 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCg > 1:4201060/1‑101 (MQ=255) cgcgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctcca < 1:2537612/97‑5 (MQ=255) cccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGc < 1:14571409/101‑1 (MQ=255) ccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCt < 1:5906241/101‑1 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:3240602/99‑7 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:9524500/99‑7 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:10491355/99‑7 (MQ=255) cTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCtt < 1:9585650/101‑1 (MQ=255) cTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCtt > 1:10664931/1‑101 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTg > 1:5300450/1‑101 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTg < 1:9465229/101‑1 (MQ=255) aTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccacagc < 1:12880780/101‑9 (MQ=255) tttTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccacagct > 1:8479112/1‑92 (MQ=255) tttTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccacagct < 1:14334433/101‑10 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTTTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg > 1:8000452/1‑101 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg < 1:8819712/101‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg < 1:4769644/101‑1 (MQ=255) | GTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCG > NC_007779/3270095‑3270294 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |