| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,270,226 | C→G | 4.5% | intergenic (+769/+254) | yhaC → / ← garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,270,226 | 0 | C→G | 4.5% | 23.6 ‑1.4 0.0 | 257 | intergenic (+769/+254) | yhaC/garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/9): ref base (113/132): total (116/141) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.35e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
AGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTG > NC_007779/3270126‑3270325 | cAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACgg > 1:910247/1‑101 (MQ=255) tCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACt > 1:4347243/1‑101 (MQ=255) tCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACt < 1:12317984/101‑1 (MQ=255) cACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTAc < 1:1204545/101‑1 (MQ=255) cTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCa > 1:5391383/1‑101 (MQ=255) cTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCa < 1:1908836/101‑1 (MQ=255) ggCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGc < 1:10753181/101‑1 (MQ=255) gCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGcc < 1:5768636/101‑1 (MQ=255) cTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcg < 1:7368991/101‑1 (MQ=255) tCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgc < 1:8086837/101‑1 (MQ=255) cAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcg < 1:12081927/101‑1 (MQ=255) agcagcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcgc‑g < 1:7766564/101‑1 (MQ=255) agcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTg > 1:2047215/1‑101 (MQ=255) cTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTgcgc < 1:1408424/101‑1 (MQ=255) cccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGctct > 1:1422269/1‑101 (MQ=255) ccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCtt > 1:9201624/1‑101 (MQ=255) cGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTa < 1:3322382/101‑1 (MQ=255) ggTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAcc < 1:10993262/101‑1 (MQ=255) ggTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAcc < 1:4403819/101‑1 (MQ=255) ttCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGc < 1:8232323/101‑1 (MQ=255) ttCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGc < 1:3900016/101‑1 (MQ=255) tCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCa < 1:413021/101‑1 (MQ=255) gTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGTCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCAccc < 1:1700884/101‑1 (MQ=255) aCGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCtt > 1:10419548/1‑101 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:9865323/101‑1 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:1835490/101‑1 (MQ=255) gggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTc < 1:12556648/101‑1 (MQ=255) ggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCa > 1:14817003/1‑101 (MQ=255) ggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCa < 1:11021989/101‑1 (MQ=255) gCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCAc < 1:6571547/101‑1 (MQ=255) gTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTATCGCACCCTTTCACCCt > 1:11993315/1‑101 (MQ=255) gTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCt < 1:11580691/101‑1 (MQ=255) gTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCt > 1:5550907/1‑101 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCtt > 1:3940408/1‑101 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCtt < 1:13377224/101‑1 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCtt < 1:11186658/101‑1 (MQ=255) acattATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa > 1:9608809/4‑101 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa < 1:10914899/101‑1 (MQ=255) cTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAcc > 1:8374101/1‑101 (MQ=255) cTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAcc < 1:13542248/101‑1 (MQ=255) ttATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCGCCCTTTCACCCTTACCt > 1:14866689/1‑101 (MQ=255) ttATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCt < 1:5652487/101‑1 (MQ=255) ttATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCt > 1:5997026/1‑101 (MQ=255) tATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTg < 1:6738555/101‑1 (MQ=255) agcatgcgcgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGa > 1:8803488/11‑101 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGa > 1:8482155/1‑101 (MQ=255) gAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATc < 1:13762317/101‑1 (MQ=255) gAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATc < 1:4903704/101‑1 (MQ=255) gAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAACGCACCCTTTCACCCTTACCTGATc > 1:3408942/1‑101 (MQ=255) aaCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGTGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGGTcc < 1:15137973/101‑1 (MQ=255) aaCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATcc < 1:1801773/101‑1 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCg < 1:11366745/101‑1 (MQ=255) cgcgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctcca > 1:8979382/5‑97 (MQ=255) cccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGGGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGc > 1:36412/1‑101 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:9524500/99‑7 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:9368271/99‑7 (MQ=255) cTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCtt > 1:7896942/1‑101 (MQ=255) cTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCtt > 1:10664931/1‑101 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTg > 1:8290386/1‑101 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTg < 1:9465229/101‑1 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTg > 1:5300450/1‑101 (MQ=255) ttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgcgc > 1:958704/1‑101 (MQ=255) ttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgcgc > 1:13945432/1‑101 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTTTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg > 1:8000452/1‑101 (MQ=255) gCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCggg < 1:7247303/101‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCggg > 1:2235034/1‑101 (MQ=255) ccTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGc > 1:8617404/1‑101 (MQ=255) cTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGcc > 1:2631883/1‑101 (MQ=255) tGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGAGCGGGCCAt > 1:635966/1‑101 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACGGCACCTTTTCACCCTTACTTGATCCCGCTTGGCCGGGCCATcg > 1:5816360/1‑101 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg < 1:12177622/101‑1 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg > 1:12427230/1‑101 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg > 1:12774170/1‑101 (MQ=255) ccGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggc < 1:12923644/101‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcg < 1:6245102/101‑1 (MQ=255) gggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcgg > 1:5081926/1‑101 (MQ=255) ggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGt < 1:1496713/101‑1 (MQ=255) ggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGt > 1:5237491/1‑101 (MQ=255) gTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGtt < 1:8913453/101‑1 (MQ=255) gTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGGGCGCTCTTACCGCACCCCTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCCTcggcgggt > 1:10177951/1‑99 (MQ=255) tGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGttt < 1:6392969/101‑1 (MQ=255) tGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGttt < 1:1541469/101‑1 (MQ=255) tGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGttt < 1:2395415/101‑1 (MQ=255) ggAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTTCCGCCCCCGTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCCGGCCCTCGGCGGGTTg > 1:10020855/1‑101 (MQ=255) ggAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTg < 1:3689464/101‑1 (MQ=255) aGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGct < 1:3023396/101‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctc > 1:14517373/1‑101 (MQ=255) gTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctc > 1:11620920/1‑101 (MQ=255) gTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctc > 1:14665797/1‑101 (MQ=255) gTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctc < 1:4574147/101‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTATGccc > 1:13135649/1‑99 (MQ=255) tttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctct < 1:8054171/101‑1 (MQ=255) ttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctc < 1:12871694/101‑1 (MQ=255) ttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctc > 1:6706908/1‑101 (MQ=255) tACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctct > 1:7648391/1‑101 (MQ=255) aCCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTg < 1:3206064/101‑1 (MQ=255) gTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTg < 1:7458901/101‑1 (MQ=255) gCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCa < 1:14388244/101‑1 (MQ=255) gCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCa < 1:6929897/101‑1 (MQ=255) cACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACt < 1:351479/101‑1 (MQ=255) | AGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTG > NC_007779/3270126‑3270325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |