| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,270,234 | T→C | 4.7% | intergenic (+777/+246) | yhaC → / ← garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,270,234 | 0 | T→C | 4.7% | 20.9 ‑1.5 ‑0.0 | 253 | intergenic (+777/+246) | yhaC/garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/9): ref base (112/129): total (115/138) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.34e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGT > NC_007779/3270134‑3270334 | tCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa < 1:8965475/101‑1 (MQ=255) tCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa > 1:6045552/1‑101 (MQ=255) cACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTAc < 1:1204545/101‑1 (MQ=255) cTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCa < 1:1908836/101‑1 (MQ=255) cTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCa > 1:5391383/1‑101 (MQ=255) gCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGcc < 1:5768636/101‑1 (MQ=255) tCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgc < 1:8086837/101‑1 (MQ=255) aaGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcgc > 1:3686728/1‑101 (MQ=255) agcagcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcgc‑g < 1:7766564/101‑1 (MQ=255) agcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTg > 1:2047215/1‑101 (MQ=255) gcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTgc < 1:3332465/101‑1 (MQ=255) cTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTgcgc > 1:5820724/1‑101 (MQ=255) tACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGct > 1:6647636/1‑101 (MQ=255) aCCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGctc > 1:7376867/1‑101 (MQ=255) cccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGctct < 1:15071600/101‑1 (MQ=255) ccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCtt > 1:9201624/1‑101 (MQ=255) ccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCtt < 1:13107167/101‑1 (MQ=255) gggTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAc > 1:12770583/1‑101 (MQ=255) ggTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAcc < 1:4403819/101‑1 (MQ=255) gTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGTCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCAccc < 1:1700884/101‑1 (MQ=255) gTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCAccc > 1:9087796/1‑101 (MQ=255) aCGGGCCGTACCTTATGAACCACTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCtt > 1:14350311/1‑101 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:1835490/101‑1 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:8354361/101‑1 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:9865323/101‑1 (MQ=255) ggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCa > 1:14817003/1‑101 (MQ=255) gCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCAc < 1:6571547/101‑1 (MQ=255) gTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCt > 1:13505875/1‑101 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCtt < 1:11186658/101‑1 (MQ=255) acattATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa > 1:9608809/4‑101 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa < 1:13591525/101‑1 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa < 1:10914899/101‑1 (MQ=255) ccTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAc < 1:11556225/101‑1 (MQ=255) cTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAcc < 1:3920964/101‑1 (MQ=255) tATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTg < 1:5688639/101‑1 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGa > 1:14409974/1‑101 (MQ=255) tGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGAt > 1:14912271/1‑101 (MQ=255) gAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATc < 1:4903704/101‑1 (MQ=255) atgcgcgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATct < 1:6364450/94‑2 (MQ=255) aCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATccc < 1:12460924/101‑1 (MQ=255) aCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATccc < 1:3173740/101‑1 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCg > 1:4201060/1‑101 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCg < 1:4008412/101‑1 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCg < 1:10218122/101‑1 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCg < 1:11366745/101‑1 (MQ=255) cccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGc > 1:10719942/1‑101 (MQ=255) cccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGc < 1:14571409/101‑1 (MQ=255) ccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCt < 1:5906241/101‑1 (MQ=255) ccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCt < 1:8775065/101‑1 (MQ=255) ccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCt < 1:5604784/101‑1 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:3240602/99‑7 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:9368271/99‑7 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:10491355/99‑7 (MQ=255) cgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccaca < 1:9524500/99‑7 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTg < 1:9465229/101‑1 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTg > 1:5300450/1‑101 (MQ=255) aTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccacagc < 1:7655974/101‑9 (MQ=255) aTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccacagc < 1:12880780/101‑9 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgc > 1:7991155/1‑101 (MQ=255) tttTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccacagct > 1:8479112/1‑92 (MQ=255) ttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgcgc < 1:10999009/101‑1 (MQ=255) ttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgcgc > 1:958704/1‑101 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg > 1:14070191/1‑101 (MQ=255) gCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCggg < 1:10777262/101‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCggg < 1:7247303/101‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCggg > 1:1536653/1‑101 (MQ=255) gCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCggg < 1:12148398/101‑1 (MQ=255) ccTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGc > 1:8617404/1‑101 (MQ=255) tGCTCCGGGCGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGCGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCCTGCGCCGGCCAt > 1:8010372/1‑101 (MQ=255) gCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATc > 1:8149953/1‑101 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg < 1:1107617/101‑1 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg > 1:2198589/1‑101 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg < 1:3598691/101‑1 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg > 1:14194833/1‑101 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg < 1:12177622/101‑1 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg > 1:3490246/1‑101 (MQ=255) gggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcgg > 1:5081926/1‑101 (MQ=255) gggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcgg < 1:8873546/101‑1 (MQ=255) ggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGt < 1:1496713/101‑1 (MQ=255) ggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGt < 1:13374890/101‑1 (MQ=255) tGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGttt < 1:2624120/101‑1 (MQ=255) tGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGttt < 1:1812874/101‑1 (MQ=255) ggAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTTCCGCCCCCGTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCCGGCCCTCGGCGGGTTg > 1:10020855/1‑101 (MQ=255) ggAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTg > 1:13764775/1‑101 (MQ=255) ggAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTg > 1:2312027/1‑101 (MQ=255) gTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctc < 1:12816682/101‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctc < 1:4574147/101‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctc > 1:11620920/1‑101 (MQ=255) ttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctc > 1:829025/1‑101 (MQ=255) tACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctct > 1:11967091/1‑101 (MQ=255) cGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGtt > 1:5211275/1‑101 (MQ=255) gTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTg < 1:7458901/101‑1 (MQ=255) tGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGc < 1:388085/101‑1 (MQ=255) gCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCa < 1:6929897/101‑1 (MQ=255) cACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACt < 1:6337989/101‑1 (MQ=255) aCGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTg < 1:12400653/101‑1 (MQ=255) aCGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTg < 1:6793277/101‑1 (MQ=255) ggACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGt > 1:7887747/1‑101 (MQ=255) tGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTg < 1:14695622/101‑1 (MQ=255) ttACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTggg < 1:2994945/101‑1 (MQ=255) | CTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGT > NC_007779/3270134‑3270334 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |