| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 13,291 | G→C | 14.5% | V377L (GTT→CTT) | dnaK → | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_007779 | 13,291 | 0 | G→C | 14.5% | 136.1 ‑0.1 ‑0.0 | 297 | V377L (GTT→CTT) | dnaK | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (20/23): ref base (122/132): total (142/155) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.71e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.86e-01 | ||||||||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
GACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGAC > NC_007779/13191‑13391 | gACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGctgctg > 1:13119982/1‑101 (MQ=255)gACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGctgctg > 1:316597/1‑101 (MQ=255)gACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGctgctg < 1:12464110/101‑1 (MQ=255)gACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGctgctg > 1:593436/1‑101 (MQ=255)gACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGctgctg > 1:60675/1‑101 (MQ=255)gACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGctgctg > 1:7007080/1‑101 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aGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACg > 1:3058010/1‑101 (MQ=255) ttGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGCGACGTa < 1:12032646/101‑1 (MQ=255) gCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaaa < 1:8687572/101‑1 (MQ=255) tGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAg > 1:7090890/1‑101 (MQ=255) gAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCATTCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGa < 1:14623046/101‑1 (MQ=255) gTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACg < 1:10437373/101‑1 (MQ=255) tCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTa < 1:12854222/101‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |