| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,450,018 | T→C | 13.0% | E438E (GAA→GAG) | rpoC ← | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,450,018 | 0 | T→C | 13.0% | 102.9 0.0 ‑2.6 | 278 | E438E (GAA→GAG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (19/17): ref base (129/112): total (148/130) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.36e-03 | ||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
GCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTT > NC_007779/3449918‑3450118 | gCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGt < 1:4258397/101‑1 (MQ=255) cGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTGGGGGTTATTTG‑CGCCCAAACCCGCGGGTGGAGCTTGAATGCTTTTACCTCGATCAAGAACCGGtc > 1:12080107/1‑100 (MQ=255) cGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGtt > 1:10718859/1‑101 (MQ=255) cGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGtt < 1:2028489/101‑1 (MQ=255) aCGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCaaa > 1:7900741/1‑101 (MQ=255) aCGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCaaa < 1:13911751/101‑1 (MQ=255) cGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAAt < 1:12627365/101‑1 (MQ=255) aaCAGCCATCTGGTGACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCt < 1:9315973/101‑1 (MQ=255) aaCAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCt < 1:8706894/101‑1 (MQ=255) gCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGAt < 1:6344181/101‑1 (MQ=255) gCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGAt < 1:12360947/101‑1 (MQ=255) cATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAc < 1:12457827/101‑1 (MQ=255) tCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAccc > 1:9155370/1‑101 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg > 1:4607769/1‑101 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg < 1:1272394/101‑1 (MQ=255) tCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACg > 1:330114/1‑101 (MQ=255) cACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACgg < 1:8572971/101‑1 (MQ=255) cGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCaga < 1:2910205/101‑1 (MQ=255) cGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCaga > 1:3123407/1‑101 (MQ=255) gAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCagag > 1:4331745/1‑101 (MQ=255) gAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCagag < 1:6804693/101‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGt < 1:13577874/101‑1 (MQ=255) tCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCgg > 1:9191169/1‑101 (MQ=255) cGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGt < 1:5029312/101‑1 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg < 1:13133897/101‑1 (MQ=255) tataTGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACgg > 1:8443237/1‑101 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc > 1:6128171/1‑101 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc < 1:8854709/101‑1 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc > 1:13726820/1‑101 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc > 1:13544872/1‑101 (MQ=255) gCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcag < 1:4911638/101‑1 (MQ=255) gCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcag < 1:12822703/101‑1 (MQ=255) cctcacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATAACCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagc < 1:1276056/92‑1 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca < 1:9404666/101‑1 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca < 1:7207062/101‑1 (MQ=255) gCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagcag > 1:2722219/1‑101 (MQ=255) cacaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGt > 1:10547314/1‑101 (MQ=255) atgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGAcc < 1:14500406/98‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc < 1:179855/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc < 1:13994212/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc > 1:1113714/1‑101 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc < 1:1013217/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc < 1:9746698/101‑1 (MQ=255) aaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCg < 1:1728803/101‑1 (MQ=255) aCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCgg > 1:7785695/1‑101 (MQ=255) ccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCggg < 1:8271370/101‑1 (MQ=255) ccAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCggg > 1:14910288/1‑101 (MQ=255) cAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCCGGCGGTCCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgt > 1:2163610/1‑101 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt > 1:6278033/1‑101 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt < 1:13266333/101‑1 (MQ=255) agtgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtg < 1:5404157/98‑1 (MQ=255) agtgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtg > 1:1289029/4‑101 (MQ=255) agtgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGGGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCggggg > 1:11655333/4‑99 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg < 1:3989689/101‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg > 1:12978495/1‑101 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg < 1:2475633/101‑1 (MQ=255) gtgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtgt < 1:4223288/99‑1 (MQ=255) gtgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtgt < 1:6931401/99‑1 (MQ=255) gtgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtgt > 1:5688965/3‑101 (MQ=255) tgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtgtc < 1:8138492/100‑2 (MQ=255) ggggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGtt < 1:11471464/100‑1 (MQ=255) gggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCGGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTc > 1:5069174/1‑101 (MQ=255) gCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggta > 1:9635272/1‑98 (MQ=255) cAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGa > 1:6485248/1‑101 (MQ=255) cAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGa < 1:15078755/101‑1 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt > 1:14120556/1‑101 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt > 1:7687172/1‑101 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt > 1:14355311/1‑101 (MQ=255) gCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATa < 1:872408/101‑1 (MQ=255) gCTGAATTGCCTTACCCTCAACC‑AGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggtaatg > 1:13304389/1‑95 (MQ=255) cTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATaa > 1:526551/1‑101 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc > 1:8327875/1‑101 (MQ=255) ggATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACt < 1:3716270/101‑1 (MQ=255) tAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCg > 1:10993516/1‑101 (MQ=255) aGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGt < 1:3057380/101‑1 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGGCGTTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc > 1:4716511/1‑101 (MQ=255) tACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAgg > 1:5530202/1‑101 (MQ=255) tACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAgg > 1:14724341/1‑101 (MQ=255) ccTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGat < 1:6637606/101‑1 (MQ=255) cTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGata < 1:7414701/101‑1 (MQ=255) cTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGata < 1:4483987/101‑1 (MQ=255) ttCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat > 1:6742727/1‑101 (MQ=255) ttCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat < 1:11349882/101‑1 (MQ=255) ttCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat < 1:11253174/101‑1 (MQ=255) cGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATcc < 1:1554474/101‑1 (MQ=255) cGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATcc > 1:1037445/1‑101 (MQ=255) gATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATccc < 1:198326/101‑1 (MQ=255) gATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATccc > 1:3788729/1‑101 (MQ=255) tC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaa > 1:7641226/1‑101 (MQ=255) tC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaa > 1:1292970/1‑101 (MQ=255) c‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaaa < 1:348420/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:10015238/101‑1 (MQ=255) gTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACg < 1:8352296/101‑1 (MQ=255) gTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACg < 1:13501150/101‑1 (MQ=255) tACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGa > 1:14422744/1‑101 (MQ=255) ccGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACa < 1:12519699/101‑1 (MQ=255) cGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAg < 1:15049769/101‑1 (MQ=255) cGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAg > 1:9226869/1‑101 (MQ=255) ggTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGc > 1:700047/1‑101 (MQ=255) ttCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGctt > 1:986986/1‑101 (MQ=255) | GCGGTACGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATC‑AGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTT > NC_007779/3449918‑3450118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |